【ESMO 2021】世和基因 ctDNA MRD 检测展示巨大潜力
欧洲肿瘤内科学会年会（ESMO大会）是欧洲最负盛名和最具影响力的肿瘤学会议，坚持以多学科多维度促进癌症的治疗和推进肿瘤医学专业的发展，现已成为集临床实践、转化研究及多学科交叉讨论为一体的全球性学术交流平台。受全球疫情影响，今年将以虚拟会议形式于2021年9月16-21日举行。世和基因连续7年参与AACR、ASCO、ESMO和WCLC等国际大型会议，迄今已中稿100多项研究成果。本届ESMO大会，世和基因参与的多项研究成果在会议中通过Poster形式展出，今天重点为大家介绍其中的一个篇章。
2021 ESMO 世和基因 ctDNA MRD 新评估方法
Poster摘要号：908
Utility of Circulating Free DNA 5’-end Motif Profile in the Prediction of Pathological Response after Neoadjuvant Chemoradiotherapy in Patients with Locally Advanced Rectal Cancer
研究团队：复旦大学附属肿瘤医院章真教授团队
成果亮点：采用NGS靶向测序构建cfDNA末端基序模型预测neo-CRT后non-pCR患者
局部晚期直肠癌（locally advanced rectal cancer，LARC）患者接受新辅助同步放化疗（neoadjuvant chemoradiotherapy，neo-CRT）后可能获得完全病理缓解（pathological complete response，pCR) ，这部分患者可以考虑选择“观察&等待”（“Watch & Wait”，W&W）策略，改善生活质量。但目前临床术前主要通过影像学等方法评估临床完全缓解（complete clinical response，cCR），与术后pCR仍存在不一致性，亟待更加灵敏的准确的疗效评估技术。目前，血浆cfDNA末端基序（end motif）特征已经在肿瘤早筛研究中显示了较高的灵敏度。
复旦大学附属肿瘤医院章真教授团队与世和基因合作在直肠癌患者中开展基于ctDNA液体活检评分的术后复发监测研究（Monitoring Post-surgery Cancer Recurrence by ctDNA Liquid Biopsy Rating，CALIBRATE），局晚期直肠癌新辅助治疗复发监测研究（CALIBRATE-RC-nCRT），初步探索了cfDNA末端基序对于预测接受neo-CRT治疗后LARC患者的病理反应的可行性。
研究自2016年2月至2017年10月共入组了119例术前接受neo-CRT的LARC患者（cT3-4; N0-2; M0）。采集患者的基线血浆、neo-CRT治疗过程中以及治疗后的血浆样本，采用世和一号®大panel进行NGS靶向测序。根据测序结果计算cfDNA片段中4096个6-mer 5’末端基序出现的丰度，并构建elastic-net逻辑回归模型预测患者的pCR状态。最后通过内部5倍交叉验证和30次重复验证评价该模型的预测效能。研究最终纳入了103位患者，交叉验证显示末端基序模型预测pCR状态的AUC为0.95。以约登指数为截断点，预测non-PCR的敏感性和特异性分别为95%和85%，准确度为93%。值得注意的是，在neo-CRT治疗期间或者治疗后血浆无法检测到ctDNA突变的患者中，末端基序模型依然表现出良好的预测能力，其AUC为0.94，预测non-pCR的敏感性和特异性分别为89%和88%，准确性为89%。
结论：cfDNA末端基序模型能够有效预测neo-CRT治疗后患者的病理反应，且预测性能优于基于传统临床疗效评估方法，cfDNA末端基序模型有助于筛选出适合采用W&W治疗方案的优势人群。
Poster摘要号：3462
Circulating tumor DNA analysis integrating tumor clonality detects minimal residual disease in resectable non small-cell lung cancer
研究团队：江苏省肿瘤医院许林教授、尹荣教授团队
成果亮点：ctDNA突变结合肿瘤组织进化分析可提高可手术NSCLC的MRD监测效果
根治性手术切除是早期肺癌患者的主要治疗手段，但由于传统检测手段无法检测到微小残留病灶（Minimal Residual Disease，MRD），部分患者术后仍然存在复发转移的风险。《肺癌MRD的检测和临床应用共识》指出早期非小细胞肺癌患者根治性切除术后，MRD阳性提示复发风险高。但目前国内的MRD监测方法均尚未经过临床验证，江苏省肿瘤医院许林教授、尹荣教授与世和基因合作开展了肺癌时空异质性（Lung Cancer Tempo-spatial Heterogeneity, LuCaTH）研究以评估是否可以通过ctDNA追踪肿瘤组织的克隆演化过程以提高MRD监测对肿瘤复发风险的预测效果。
LuCaTH研究前瞻性入组了127位Ⅰ-Ⅲ期接受根治性手术切除的NSCLC患者，分别在基线、术后7天以及之后每3个月采集患者的血浆样本，并对肿瘤组织进行多区域采样，用NGS技术对采集的593例组织样本以及634例血浆样本进行世和一号®大panel检测。通过检测结果重建肿瘤组织的克隆演化过程并用于辅助血浆ctDNA分析。研究结果发现术前和术后血浆的阳性检出率随着病理分期的提高而上升。术前单点血浆检测以及术后多点血浆监测过程中的ctDNA阳性均能提示升高的复发风险（HR=2.23，P=0.019；HR=7.95，P < 0.0001）。术后单点血浆检测最早在术后7天即可提示患者预后，术后7天ctDNA阳性预示升高的复发风险（HR=3.90，P= 0.00011）。术后多点血浆监测的ctDNA阳性对于预示肿瘤复发可以在保证81.9%的特异性的前提下达到73.5%的灵敏度，提前影像学检查发现肿瘤复发的中位时间达到145天。
结论：对于接受根治性治疗的NSCLC患者，结合了肿瘤组织进化分析的ctDNA动态监测可以提示患者的MRD状态，预测肿瘤复发风险。
排版编辑：tay