R语言读取文件常用代码(收藏)

1 读取txt文件

这是一个DAVID网址富集分析的结果ddd<-read.table("DAVID.txt",sep = "\t",header = T,na.strings = c("NA"))

sep = "\t"表示制表符分隔，header = T表示第一行包含变量名，na.strings = c("NA")表示文件中的缺失数据都是用NA代替具体参数信息如下

2 读取csv文件R读取csv文件和读取txt文件很类似，使用的是read.csv()代码，参数基本上也是一样的

这是一个csv文件，一般都是逗号分隔ddd<-read.csv("DAVID.csv",sep = ",",header = T,na.strings = c("NA"))

如果还是使用制表符分隔，sep = "\t"那么读出来使这样的

3 读取xls和xlsx文件读取xls或者xlsx需要安装R包，我们这里介绍readxl的使用readxl包是tidyverse中的一员，是导入Excel表格数据的一个R包#install.packages("readxl")library(readxl)ddd<-read_excel("DAVID.xlsx")ddd

具体的参数如下

4 读取大文件如果读取的文件太大，用read.csv会非常消耗内存和时间，而使用data.table中多的fread可以大大节省内存和时间library(data.table)ddd<-fread("DAVID.csv",sep = ",",header = T,na.strings = c("NA"))主要参数有：sep列之间的分隔符nrow读取的行数，默认全部，nrow=0仅仅返回列名header第一行是否是列名na.strings文件中的缺失数据是否都是用NA代替stringsASFactors 是否转化字符串为因子verbose是否报告运行时间data.tableTRUE返回data.table，FALSE返回data.frame5 读取剪切板读取剪切板我们可以使用read.delim函数直接复制表格中的数据

ddd<-read.delim(file="clipboard",header=T,sep="\t")

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