过表达载体构建流程及注意事项

表达基因扩增的引物设计:

1. NCBI Gene 数据库查找基因cDNA序列;
2. 查找CDS区序列的酶切位点,对比载体上的酶切位点,避免冲突(可使用primer premier5 软件或南京德泰生物镜像(网站));

3. CDS区首、尾序列 + 5’端加上酶切位点和(或)保护碱基(如下图)。

表达载体构建简要流程

1. PCR扩增出基因CDS区,1400bp左右,胶回收;
2. 双酶切胶回收产物及载体,胶回收;
3. 酶切后的产物用T4连接酶(Takara) 连接过夜,转化,鉴定。

常见问题

1. 引物特异性不好,PCR杂带太多或根本扩增不出来

在CDS区的上下游重新选择引物,扩增成功后,以这个大一点的片段为模板扩增CDS区;

人基因ORF库购买。

2. PCR产物酶切不成功

构建克隆载体,再酶切;

载体自连会使Lac Z编码,在IPTG/X-Gal平板上呈现蓝色。

3. 没有合适的酶切位点

无缝克隆试剂盒。

4. 没有合适的抗体

加上标签,翻译成融合蛋白,比如His、HA、Flag、Myc等,N端C端均可;

引物设计:CDS区序列,5’端依次加上标签序列、酶切位点和(或)保护碱基;

载体自带标签,需要注意酶切位点处可能移码。

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