生信怕补实验?不怕,还有这种方法

很多人喜欢利用生信发文章,但是往往又害怕审稿人要求补实验,补实验需要消耗大量的时间、金钱。对于没有经费的朋友而言,补实验可以说是难于登天,实在没有办法完成。生信偏向于基础科研,遇到审稿人要求补实验完全属于正常现象。作为临床医生,偏向临床研究,直接从病人出发,利用病人数据发文章,不是更好的选择吗?像下面的临床医生,他们就是这样干的,收集病人数据,然后整理好,复制粘贴代码,直接出结果发文章:

文章题目:The risk factors related to the severity of painin patients with Chronic Prostatitis/ChronicPelvic Pain Syndrome

文章的操作内容非常简单,收集整理数据,然后复制相关的代码,输入到r软件,于是得到下面的几张图:

这种基于临床数据发文的方法,同时适合肿瘤研究与非肿瘤研究。生信数据挖掘严重倾向于肿瘤方向,肿瘤数据非常丰富,而非肿瘤数据少得可怜。但是上面这种方法,不会这样,只要你能够收集相关数据,结果还行就可以发文。

当然这种方法也有局限性,需要自己收集病人数据,有很多人没有时间收集数据,或者被老板安排到了实验室(放羊式教学),这类朋友就没有办法了。肿瘤方向的还可以搞一下生信数据挖掘,但是非肿瘤方向的就更加惨了,生信数据少,非常困难。试想着发表meta分析,但是meta分析往往都是不能用来毕业或者评职称。

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