如何了解一个基因的功能

我们研究一个基因的时候,首先还是要知道这个基因的功能的。之前介绍很多数据库都可以用来查询基因的功能。比如最经典的genecards数据库介绍或者ncbi-gene数据库介绍在这两个基因综合信息查询数据库当中,我们可以了解目标基因的综合的功能。

一般来说一个基因的功能和这个基因所在的通路有关。因此基于通路数据库来查询基因的功能也是可以的。而 KOBAS (http://bioinfo.org/kobas/)是一个可以通过输入目标基因在相对应的通路数据库当中进行分析的工具。

另外需要注意的是KOBAS一个支持可以多物种多输入选项的工具。所以如果是研究其他物种的也是可以使用的哈。

基因功能预测

Annotation当中,我们可以输入想要分析的基因即可。

在经过简单的等待之后,就可以获得输入基因在通路等富集数据库当中的功能介绍。

富集分析

当然除了基因注释的功能。这个数据库还可以进行基因的富集分析和富集分析的可视化。当然这些功能的我们之前介绍的富集分析功能当中也都要类似的功能的。这里就不做具体的介绍了。

其他可能想要了解的富集分析工具

WebSestalt-富集分析软件

CPA-多种算法富集分析数据库

gprofiler-多ID富集分析

SIGNAL-通路与PPI联合分析数据库

GeneTrail-多组学数据富集分析数据库

(0)

相关推荐