科学家绘制了非洲猪瘟病毒基因组图,发现30个新基因
来自英国和波兰的一组研究人员已经在整个非洲猪瘟病毒(ASFv)基因组中绘制了基因表达图谱。这有助于确定它们的激活顺序以及发现新基因。
研究人员与伦敦大学学院(UCL),Pirbright学院和波兰华沙大学建立了联系,并在同行评审的《病毒学杂志》上发表了他们的研究。
他们的作者写道:“在这里,我们提出了第一个急需的全基因组转录组研究,该研究提供了对ASFv转录的独特见解,并为未来对ASFv基因的功能分析提供了资源,而这对于对抗这种毁灭性疾病至关重要。”
首次绘制了ASF病毒的总基因组图。
发现30个新基因
根据UCL网站上的新闻稿,这项研究可以为那些开发疫苗和抗病毒药物以预防由该病毒引起的致命猪病的人提供重要信息。首席教授Finn Werner解释说:“我们的数据显示,ASFv具有复杂的哺乳动物控制基因表达的方法,该方法使用特定的启动子使RNA聚合酶能够区分病毒感染过程中应表达哪些基因。我们的研究还发现了30多个以前未知的新基因。”
在他们的研究中,研究人员使用了下一代测序技术来分析ASFv表达的基因。他们由此创建了完整的遗传路线图,揭示了在整个感染周期中打开不同组的ASFv基因的顺序。
ASFv可以改变激活基因的模式
UCL网站上的新闻文章继续描述,包括ASFv中的基因在内的基因是通过称为“转录”的过程激活的。该过程由称为RNA聚合酶的分子机器执行,该机器通过确保在感染期间的正确时间表达DNA中编码的信息来充当“守门人”。RNA聚合酶根据位于基因之前的特定DNA序列或“启动子”来查找基因。
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研究小组证明,在早期感染期间表达的基因与以后表达的基因具有不同的启动子,从而使病毒根据感染的阶段改变活化基因的模式。用于DNA复制和逃避免疫系统的基因会在感染周期的早期打开,而那些涉及为新病毒颗粒创建蛋白质的基因则在稍后被激活。
ASFv具有非常大的DNA基因组
Linda Dixon博士是Pirbright ASFv集团的负责人,也是该科学文章的合著者。在该Pirbright网站上的新闻文章,她说:“非洲猪瘟病毒具有非常大的DNA基因组。为了进行比较,流感病毒表达8个基因,而ASFv表达150至190个基因,迄今为止,这使得科学家难以鉴定和确定每个基因的重要性。我们的研究有助于弄清哪些基因在感染的不同阶段中很重要,以便更好地了解其功能。”
根据新闻报道,通过提高对ASFv基本生物学的认识,该研究提供了重要信息,将有助于推进疾病控制方法的研究。
文章来源《 病毒学杂志》上的研究文章由英国伦敦大学学院的Gwenny Cackett,Dorota Matelska,MichalSýkora,JürgBähler和Finn Werner撰写。Raquel Portugal和Linda Dixon,英国Pirbright研究所;和波兰华沙大学的Michal Malecki。
PS:
非洲猪瘟病毒非常大,及时剔除了一部分基因也不影响它保持致病力,就像坦克即使丢了一个轮子也不影响跑。这也是一直基因缺失苗效果一直不理想的主要原因。
这次做的图谱有望让科学家更清晰的认知病毒基因组特点,从而更利于基因确实苗的研制。
当然,非瘟疫苗研制依旧道路漫漫,想要真正防控好非瘟,还要靠我们自身的生物安全防控体系。