中国数据 | 猫冠状病毒流调数据知多少

导语：这篇文章阅读起来会比较困难，基因型的东西实在是太过复杂，小编提前划重点。这是一篇根据不同血清型下猫冠状病毒（FCoV）的回顾性研究，验证了FCoV感染似乎与多猫环境(p < 0.01)和年龄(p < 0.01)显著相关，I型和II型FCoV毒株在中国FIP感染猫中共同流行。I型FCoV毒株在FIP感染猫和临床健康猫中均表现出较高的流行率和遗传多样性。

阅读须知：读者可能会有疑问，文中 I型FCoV和II型猫FCoV究竟是什么？FCoV根据其血清学特性分为Ⅰ型和Ⅱ型FCoV两种血清型；根据致病性也分为FECV和FIPV两种生物型。这两种生物型FECV和FIPV同时存在于血清型I和II中(Tekes&Thiel，2016)。Ⅰ型和Ⅱ型FCoV均可引起FIP。FIP仍然是最常见的致死性感染性猫疾病之一，目前尚无有效治疗方法。

注意：血清型和生物型不是一个概念哈，所以I，II型并不对应FECV和FIPV。

中国流调：临床健康猫和疑似FIP猫中猫冠状病毒I型和II型的流行情况和遗传多样性

猫传染性腹膜炎(FIP)是野猫和家猫的一种致死性传染病，FIP的发生在我国屡见报道。为追踪我国Ⅰ、Ⅱ型猫冠状病毒的演变过程，从我国兽医院采集FIP疑似猫腹水115份，临床健康猫粪便54份。

以6b基因为靶点的RT‐PCR检测样本中是否存在FCoV。结果发现，共有126份(74.6%，126/169)样本FCoV阳性：75.7%(87/115)的FIP‐疑似样本FCoV阳性，72.2%(39/54)的临床健康样本FCoV阳性。在126份FCoV阳性样本中，95个部分S基因测序成功。部分基于S基因的基因分型表明，Ⅰ型FCoV和Ⅱ型FCoV分别占95.8%(91/95)和4.2%(4/95)。

基于部分S基因的系统发育分析显示，91株I型FCoV毒株表现出遗传多样性；4株II型FCoV毒株与来自台湾的II型FCoV毒株表现出密切关系。3株I型FCoV毒株HLJ/HRB/2016/10、HLJ/HRB/2016/11和HLJ/HRB/2016/13在几乎完整的基于基因组的系统发育树中形成了一个潜在的新分支。

进一步分析显示，FCoV感染似乎与多猫环境(p < 0.01)和年龄(p < 0.01)显著相关。

在中国鉴定的3株I型FCoV毒株BJ/2017/27、BJ/2018/22和XM/2018/04的S基因表现出6个核苷酸缺失(C4035AGCTC4040)。

我们的数据提供的证据表明，I型和II型FCoV毒株在中国FIP感染猫中共同流行。I型FCoV毒株在FIP感染猫和临床健康猫中均表现出较高的流行率和遗传多样性，多猫环境和年龄（< 6个月）与FCoV感染显著相关。

文献来源：Emmler L, Felten S, Matiasek K et al. Circulationand genetic diversity of Feline coronavirus type I and II from clinicallyhealthy and FIP-suspected cats in China J Feline Med Surg. 2020Aug;22(8):791-799. doi: 10.1177/1098612X19886671. Epub 2019 Nov 15.