Nature子刊 | 微生物群通过DNA甲基化来控制肠道内平衡和炎症

推荐:江舜尧

编译:Jione、song

编辑:小菌菌

以色列希伯来大学医学院以色列-加拿大医学研究所发展生物学和癌症重点实验室Ihab Ansari等人于2020年2月3日在顶级期刊Nature Microbiology发表题目为《The microbiota programs DNA methylation to control intestinal homeostasis and inflammation》的文章,该研究为揭示肠道微生物群诱导的表观遗传变化对体内稳态的影响提供了重要的参考。

文章摘要

研究背景:肠道炎性疾病引起许多与健康有关的问题,并降低了发展中国家和工业化国家的生活质量。尽管已经对肠道微生物组的多样性进行了很多研究,但对它如何影响正常和致病条件下肠道稳态的了解却很少。
方法:本文对常规饲养和无菌小鼠进行全基因组亚硫酸盐测序,并采用遗传干预,研究并分析了共生细菌对正常和急性炎症条件下小鼠肠上皮细胞的表观遗传DNA甲基化作用的影响。
结果:暴露于共生菌群会导致调节元件上的局部DNA甲基化,这是TET2 / 3依赖性的。这最终激活了一组“早期哨兵”反应基因,以维持肠道的动态平衡。此外,暴露于右旋糖酐硫酸钠引起的急性炎症中的微生物会导致DNA甲基化和染色质在调节元件上的可及性发生变化,从而导致基因表达过程发生改变,这些基因表达过程涉及结肠炎和结肠癌相关功能。
结论:本文研究结果表明,微生物群诱导的表观遗传变化对于体内适当的肠道稳态是必要的。

文中重点图片说明:

图1 | 从GF中分离的结肠隐窝细胞与CNV小鼠的WGBS比较。

图2 | 急性炎症中的甲基化改变影响基因表达。

图3 | 肠结肠炎的ATAC测序分析。

图4 | 在肠道菌群缺乏的情况下,炎症性结肠的表达和甲基化变化。

图5 | 微生物诱导去甲基化的分子机制。




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