Nature 子刊 | 特应性皮炎和牛皮癣患者中的微生物与宿主之间的相互作用
推荐：江舜尧
编译：艾奥里亚
编辑：小菌菌
文中重要图片说明：
图1 | AD（特应性皮炎）和PSO（牛皮癣）患者皮肤微生物群的特点。结果表明，HV（健康受试者）（n=115）有典型的皮肤微生物群落，而AD（n=82）和PSO（n=119）患者的皮肤微生物菌群有显著变化；a表示基于16S rRNA基因序列的进化树，对95种最丰富的OTUs的丰度和统计意义进行了分析；热图中的蓝色强度反映了各区域的相对丰度；绿色竖直条的长度表示非参数统计评分；不同颜色代表不同的细菌门（绿色代表Firmicutes；红色代表Proteobacteria；青色代表 Bacteroidetes；蓝色代表Cyanobacteria；橘黄色代表Actinobacteria）；b表示HV，AD以及PSO人群中主要的优势细菌；c代表11个OTUs的统计分析表明AD人群或者PSO患者与HV患者在纠正混杂因素后具有最显著的变化；d表示AD或者HV患者中严格厌氧菌代表性OTUs的相对丰度的统计分析。
图2| AD（特应性皮炎）和PSO（牛皮癣）患者微生物分类。a代表随机森林特征选择和分类（RF）鉴定的最优鉴别AD（n=82）的可变重要性；b代表RF分析确定的最优判别PSO（n=119）分类群的可变重要性；c代表基于RF选择的与AD相关的OTUs共现网络图；d代表基于RF选择的与PSO相关的OTUs共现网络图。
图3| AD（特应性皮炎）和PSO（牛皮癣）患者皮肤微生物转录本。
图4 | S. aureus的识别以及功能联想。a代表利用FDR为10−5的水平上，利用AD相关基因（AD患者，n=82），构建了一个AD基因共表达网络；b代表S. aureus“高”（n=27）和“低”（n=25）样本之间差异性分析显示有256个差异表达基因；基因注释和独创性途径分析识别了S. aureus特征中富集的基因（c）并预测了上游调控因子（d）；e表示在顶部功能和相关基因之间生成的分子网络；f表示S. aureus“高”和“低”丰度样本中选定基因的RNA表达水平的统计分析。
图5 | 特应性皮炎和牛皮癣中宿主与微生物之间的相互作用。AD（特应性皮炎）的特点是金黄色葡萄球菌（S. aureus）的过度生长以及微生物多样性的丧失。在AD中，金黄色葡萄球菌在皮肤上的定植与上皮屏障功能、免疫活化、白细胞迁移、TRP降解和代谢重编程有关的基因失调相关。PSO（牛皮癣）与多种物种有关，包括由C. Simulans和C. Kroppenstedii定殖量的增加，以及Lactobacillus、P. aces和Corynebacterium spp.的丧失。
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