Developmental Cell:衰老中,皮下脂肪为什么会减少?
背景介绍
近年来,单细胞RNA测序(scRNA-seq)已经成为解析前脂肪细胞(adipose precursors)异质性的一项新技术,它为从多能间充质干细胞(Mesenchymal stem cells,MSCs)到确定命运的前脂肪细胞(Committed adipose precursor cell)的分化成脂轨迹提供了新的见解。然而,许多scRNA-seq研究使用了FACS去除免疫细胞后的SVF细胞,因此它们可能反映不了所有的前脂肪细胞(adipose precursors)亚群,从而无法说明这些细胞的完整结构层次。
在衰老过程中,内脏脂肪组织(Visceral adipose tissue,VAT)和肌肉间脂肪(Inter-muscular fat)呈现增加的趋势。相比之下,小鼠和人类的外周皮下脂肪组织(Subcutaneous adipose tissue,SAT)随着年龄的增长而显著减少。VAT与如胰岛素抵抗和心血管疾病等在内的病理状态的发生发展有关,而SAT含较多米色脂肪,可以促进产热能力增加,对人类代谢性疾病则具有潜在的保护作用。尽管VAT和SAT在衰老过程中的发生不同的变化,但是一般认为它们作为人类脂肪祖细胞(adipose progenitors)的增殖和分化能力都会在衰老过程中会急剧下降。由于这些细胞会发生衰老和凋亡,最终导致小鼠和人类的白色脂肪(White adipose tissue, WAT)质量改变,并对全身代谢产生影响。然而,至今为止在衰老过程中SVF细胞亚群的潜在变化以及不同亚群之间存在的相互关系、分子机制研究尚不清楚。
为了研究SAT在衰老过程中减少的分子机制,研究人员使用了scRNA-seq方法比较了年轻和衰老小鼠SAT中未去掉免疫细胞的全部SVF细胞。作者发现,随着年龄的增长,前脂肪细胞亚群(Adipose precursor populations)的数量急剧下降,同时检测到SAT中出现一个细胞亚群,此细胞亚群伴随衰老而产生并进一步积累,研究人员将其命名为小鼠的衰老依赖性调节细胞(Aging-dependent regulatory cells,ARCs)。在老年志愿者的SAT中检测到了ARC亚群,而年轻志愿者中则没有发现。虽然ARC细胞亚群也有表达脂肪祖细胞(adipose progenitor)阳性标记分子物,但它们表现出分化能力受损,并高表达炎症细胞因子,如Ccl6。除此之外,该细胞亚群虽不表达泛免疫标记物分子(pan-immune marker)CD45,但高表达促炎症基因。研究人员还发现,ARC失去增殖和分化为脂肪细胞的能力,并可以通过分泌细胞因子抑制前脂肪细胞(adipose precursors)的增殖和分化能力。Pu.1(又称Spi1)参与了SAT中ARC的发育,体内前脂肪细胞(adipose precursors)中过表达Pu.1可抑制邻近细胞的分化能力。综上,衰老相关的ARC亚群在衰老过程中出现的前脂肪细胞(adipose precursors)数量减少、脂肪生成抑制和SAT损失中发挥关键作用。
1、ARC只出现在衰老过程中的皮下脂肪
研究结果
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研究人员为了探究10周龄(young)、48周龄(aged)和72周龄(old)的三组小鼠的腹股沟WAT(Inguinal WAT,iWAT)中SVF细胞亚群的异质性,采用了scRNA-seq测序方法进行分析。实验过程中为了防止细胞分选过程中产生的潜在偏差,研究人员在不去除Lin+细胞(CD45+、CD31+和Ter119+,即不去除免疫细胞和内皮细胞)的情况下使用iWAT的总SVF细胞。对每组2只小鼠的iWAT进行scRNA-seq。分析时,利用Partek Flow生成t分布随机邻近嵌入(t-SNE)图。基因表达谱的无监督聚类分析(Unsupervised clustering),表明在年轻小鼠中存在10个细胞簇,而在衰老小鼠中存在11个细胞簇,每个细胞簇均包含500到2500个细胞左右,每个细胞测序得到平均约19万reads(Fig 1A)。并且研究人员还重复了三次scRNA-seq以确保分类的可重复性(Fig S1A)。值得注意的是,这种无偏差的scRNA-seq能够展现出更全面的iWAT细胞中的不同亚群。且研究人员整合Lin+和Lin-亚群获得的整体祖细胞与常规的去除Lin+细胞亚群后进行的测序分析相比,可以更准确的反映iWAT中SVF整体状况。
研究人员通过Fcgr3、Cd79b和Ccl5等免疫细胞标记物确定了Lin+细胞亚群,其包括B细胞、T细胞、巨噬细胞和内皮细胞。脂肪组织中的Lin-细胞亚群含有CD34标记的脂肪祖细胞(adipose progenitor)。在脂肪谱系亚群(adipose lineage populations)中,除了先前发现的3个脂肪祖细胞亚群(MSC、APC和CD142high APC),研究人员还检测到另外3种细胞亚群:脂肪特异性的成脂Fmod+成纤维细胞(AFFs,能分化为脂肪细胞)(Fig S1D)、前脂肪细胞(Preadipocytes)和早期脂肪细胞(Early adipocytes)。研究人员没有在VAT中检测到AFFs(数据未展示),因此其仅存在于SAT中。总之,新检测到的这些前体细胞亚群(precursor populations)可能是由于使用了没有去除Lin+细胞亚群的总SVF。此前针对Lin-亚群的SVF研究(直接排除Lin+细胞亚群)可能会降低细胞亚群内的异质性:即可能会遗漏除了之前已知的特异性标记细胞类群(Fig S1B)。研究人员还发现了新的更特异的脂肪细胞标记物:MSCs和APCs上的Pi15和CD121a、MSCs特异的Gpr1、APCs的Pref-1,CD142high APCs的Ramp1和Aox3,AFFs的Fgf1和Fmod(Fig S1C)。
拓展阅读
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2018年的一篇Nature就曾报道CD142+细胞群作为脂肪形成调节细胞以旁分泌的机制抑制脂肪生成。在下图可以明显看出相较于CD142- ASPCs,CD142+ ASPCs的脂质形成量明显下降了。
Fig 1 | 小鼠皮下脂肪组织中的ARC在衰老出现
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为了从SVF中分离和鉴定ARC,研究人员鉴定了两种ARC中高表达的细胞表面蛋白Lgals3和CD36作为分子标记基因(Fig 2B)。研究人员首先利用CD45、CD31和Ter119将iWAT的SVF分为Lin+和Lin-亚群。在Lin-细胞中,研究人员定义Lgals3+ CD36+细胞为ARCs。[小编注:与作者之前发现ARC的策略不同,作者从所有的SVF中发现了ARC,并进一步证明不是免疫细胞(CD45+CD31+),所以后面作者的策略是去掉免疫细胞(CD45+CD31+),再进一步利用表面marker进行流式分选鉴定出ARC]。流式细胞分析表明Lgals3+ CD36+细胞大约占Lin-亚群的33%,这与scRNA-seq数据而估算的细胞比例类似(Fig 2C)。为了探究SAT在衰老中相关的变化,研究人员使用Fabp4对Lin-亚群的脂肪细胞进行分类。与预期结果一致,48周龄小鼠的SAT中早期脂肪细胞的百分比(3%)显著低于10周龄小鼠(10%)。72周龄小鼠的脂肪细胞百分比进一步下降(0.8%)(Fig2A)。作者也比较了年轻(20周龄)和老年(72周龄)小鼠的SAT重量。结果显示,老年小鼠的SAT质量下降了约50%,而VAT质量和总体重随着衰老而增加(Fig S2A)。这些结果说明衰老过程中,新形成的皮下脂肪细胞减少导致小鼠衰老过程中SAT减少。
接下来,研究人员为了探究ARC的特性,通过qRT-PCR检测了FACS分离的ARC的基因表达。结果显示Lgal3和CD36的水平比Lin-细胞高出约5倍,同时ARC也高表达脂肪祖细胞 (adipose progenitor)标记物,如CD34、Pdgfrα和Pref-1。与Lin+亚群相比,ARC不表达泛免疫标记物CD45或内皮细胞标记物CD31(Fig 2D)。作者进一步检测发现,免疫相关基因,如Jchain、Ptafr、Adgre1(F4/80)的表达水平分别提高了5倍、60倍和40倍;而成脂分化标志基因,如Loxl2和C/ebpβ的表达下降。之前的研究表明TGF-β1可以抑制APCs和前脂肪细胞(preadipocytes)的分化,而ARCs中TGF-β1的表达量增加了5倍,同时趋化因子的表达量显著增加,如Ccl5、Ccl6和Ccl9,分别增加了6倍、35倍和40倍(Fig 2E)。ARCs高表达调节淋巴细胞分化的转录因子,如Bax、Mafb、和Pu.1,也分别增加4倍,6倍和80倍(Fig 2F)。为了验证ARC是否是一个不同的细胞亚群,研究人员将FACS分选后的ARC与APC和CD142-High-APC进行了比较。通过qRT-PCR,研究人员发现在ARC中,ARC特异性高表达Pu.1、Ccl6和TGF-β,这些基因的表达水平显著高于APC或CD142-High-APC(Fig S2E)。整体基因表达谱结果说明ARCs表现促炎特征,并且抑制成脂基因的表达。
下一步,研究人员检测了ARCs细胞亚群的体外分化能力。FACS分选以后,他们进行ARCs培养,发现细胞并不能贴壁生长。进一步qRT-PCR分析显示,与CD38分选后的前脂肪细胞(preadipocytes)相比,细胞粘附因子,如Col5a2、Col14a1、Col1a1、Col1a2和Col3a1的表达量显著降低,而转录因子Fli1(可以抑制成纤维细胞胶原合成)的表达升高大约3倍(Fig 2G)。接下来研究人员在胶原涂层板上培养ARCs来使其贴壁,对ARC和前脂肪细胞(preadipocytes)进行脂肪细胞分化实验。在分化的第0天,基因分析显示ARCs的C/ebpδ、Pparγ和Fabp4表达水平显著降低,而Pref-1表达水平显著升高,上述结果表明ARC可能具有较低的分化能力。油红染色显示,与前脂肪细胞(preadipocytes)相比,ARCs中脂质积累更低。qRT-PCR结果显示Sox9(Sox9是一种已知的抑制脂肪细胞分化的转录因子)的表达增加了2.5倍。并且C/ebpδ、Pparγ和Fabp4等成脂分化因子基因的表达降低2倍(Fig 2H),上述结果表明ARC分化成脂肪细胞的能力受损。当ARCs在较低密度下培养时,它们的增殖能力比前脂肪细胞(preadipocytes)高2倍(Fig 2I)。总结而言,研究人员发现ARCs表达脂肪祖细胞(adipose progenitors)标记物,但它们抑制成脂分化。
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ARC分泌趋化因子来抑制邻近前脂肪细胞(adipose precursors)的增殖和分化
由于ARC具有高免疫特性并分泌多种细胞因子,因此它可能潜在地影响邻近的前脂肪细胞(adipose precursors)。于是研究人员通过共培养实验,检测了ARC对脂肪细胞分化的影响。首先从衰老小鼠iWAT中分离出ARCs,对其进行辐照处理以抑制分化,将这些细胞与3T3-L1细胞共培养,然后进行3T3-L1脂肪细胞分化。油红染色和明场成像(brightfield imaging)显示,对照3T3-L1细胞已完全分化为脂肪细胞。相反,与辐照的ARCs共培养的3T3-L1细胞表现出极少的脂质堆积。qRT-PCR结果显示,与ARC共培养的3T3-L1细胞中Sox9 mRNA水平提高了2倍,而分化成脂标志基因C/ebpβ、C/ebpδ、Pparγ和Fabp4的表达降低了约50%(Fig S3A)。研究人员通过使用来源于ARCs或APCs的生长培养基中检验了ARCs对3T3-L1细胞的脂肪分化的影响。与来自APCs的生长培养基相比,在ARCs生长培养基处理分化的3T3-L1细胞具有更少的脂质积累(Fig 3A)。同时qRT-PCR结果显示:在ARCs生长培养基处理的3T3-L1细胞中C/ebpβ、C/ebpδ、Pparγ和Fabp4的表达水平降低。此外,在分化的第8天,来自ARCs的生长培养基处理的3T3-L1细胞的成脂基因表达比来自APCs的生长培养基处理的细胞低约2倍(Fig 3B)。以上结果表明:ARCs可以抑制邻近前脂肪细胞(adipose precursors)分化为脂肪细胞。研究人员也检测了CD142-high-APCs是否能抑制邻近前脂肪细胞(adipose precursors)的脂肪生成。基因分析结果显示,CD142-high-APCs不高表达抑制成脂基因,如Ddk3、Meox2、Spink1等。用APCs或CD142-high-APCs的生长培养基处理的3T3-L1细胞进行分化时,两种处理组之间的脂质油红染色并无显著差异。并且两种3T3-L1细胞表现出相似的成脂标记物水平(Fig S3B)。综上结果得出结论:在衰老小鼠的SAT中,只有ARC可以抑制邻近细胞的脂肪生成,而CD142-high-APCs则没有抑制。
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据文献报道,紫外线A(UVA)抑制人脂肪组织来源的间充质干细胞(hAMSCs)的成脂分化,UVA降低PPARγ和CEBPα的mRNA水平,UVA还下调了PPARγ靶基因(脂蛋白脂肪酶(LPL),CD36,脂肪细胞蛋白(aP2)和肝X受体α(LXR)的mRNA水平。进一步研究发现,UVA抑制hAMSCs的成脂分化主要是通过降低PPARγ的表达,这是通过激活MIF-AMPK信号通路从而上调KLF2来介导的。本研究利用了紫外辐照处理ARC,从而抑制其成脂分化。
方法步骤:使用流式分选出ARC,预冷的PBS洗涤一遍,将细胞用PBS覆盖。然后使用以365 nm为中心的UV台照射细胞1小时。最后将辐照后的细胞与3T3-L1进行共培养。
如Fig 1C的结果中,ARCs表达大量的细胞因子。一些趋化因子及其受体,如Cxcl3和Cxcr2在之前的研究中已被报道可以促进3T3-L1细胞的脂肪分化。因此,研究人员推测ARC可能通过分泌趋化因子来影响附近的APC分化。qRT-PCR结果显示:与其他高表达趋化因子的细胞亚群(如巨噬细胞)相比,Ccl6是ARC中表达最高的趋化因子(Fig 3C)。因此,作者通过用Ccl6或对照His肽处理3T3-L1细胞,检测Ccl6对分化的影响。油红染色显示,与对照组相比,Ccl6处理后的细胞脂质减少;Ccl6处理组的Pref-1表达水平提高约2倍;成脂标志物基因:C/ebpδ、Pparγ和Fabp4的表达量则显著降低(Fig 3D)。为了进一步确定ARC对邻近细胞成脂的抑制作用是否依赖于Ccl6,研究人员将3T3-L1细胞分别培养在APC生长培养基、ARC生长培养基和加入Ccl6中和性抗体的ARC生长培养基。结果显示,ARC培养基中的3T3-L1细胞的C/ebpδ、Pparγ和Fabp4表达水平显著降低,Pref-1水平显著升高,然而APC培养组和Ccl6中和抗体组都表现出成脂标志物基因表达上升,Pref-1表达下降。上述结果表明ARC对邻近细胞脂肪分化的抑制作用是由于ARC生长培养基中分泌Ccl6。然而,ARC生长培养基加入Ccl6中和抗体组与APCs处理组显示相似水平的成脂标志物(Fig 3F)。总的来说,这些结果揭示出ARCs对前脂肪细胞(adipose precursors)的抑制分化效应与趋化因子分泌有关。
scRNA-seq分析结果显示,衰老小鼠的APCs、AFFs和SAT前脂肪细胞(preadipocytes)表达的促成脂分化因子水平均低于年轻小鼠(Fig 3E-G)。然后作者利用Pdgfrα和Pref-1分选出APCs,分析这些细胞在不培养情况下的基因表达情况。基因分析结果显示,老年小鼠iWAT中APCs的C/ebpβ和C/ebpδ水平低于年轻小鼠APCs,进一步证实了随着衰老的发展,老年小鼠的APCs相对于年轻小鼠的成脂分化能力下降。这些结果提示了ARCs对老年小鼠SAT中APCs的脂肪形成有抑制作用。然而,老年小鼠APCs中TNF-α、Ctsd(组织蛋白酶D)和Gpnmb(跨膜糖蛋白NMB)等炎症因子表达增加,可能进一步降低成脂分化能力(Fig 3G,右)。研究人员检测了从人类SAT中分离的APCs,在人类样本的Lin-细胞中,如C/EBPδ和PPARγ等成脂基因都随着衰老而减少。这些结果表明,衰老过程中APCs的成脂分化能力下降,可能不仅是由于它们本身导致的,更可能是由于ARC的出现对它们产生的抑制作用(Fig 3H)。
有趣的是,当3T3-L1细胞在来自ARC或前脂肪细胞(preadipocytes)的生长培养基中以低密度培养48小时后,ARC细胞上清处理的细胞增殖比前脂肪细胞(preadipocytes)细胞上清处理的细胞增殖降低了50%(Fig S3C)。同样的,用His-Ccl6重组蛋白处理,低密度培养3T3-L1细胞48小时,其细胞数量比添加His肽的对照组细胞数量低50%(Fig S3D)。这些结果表明,ARCs不仅抑制前脂肪细胞(precursor cells)的成脂分化,而且可能会降低这些细胞的增殖速度。
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Pu.1在ARC形成和功能中的作用
为了研究Pu.1是否参与ARC的发育,研究人员使用了两种不同的Pu.1 shRNA慢病毒,在分选后的ARC中进行Pu.1 KD检测。qRT-PCR结果表明两种Pu.1 shRNA的敲低效率均有90%左右。在脂肪细胞分化后,与对照shRNA处理的ARC相比,Pu.1 shRNA处理的ARC显示出更高的脂质积累。并且Pu.1 KD细胞的Sox9表达水平降低了2倍,脂肪生成标志物基因C/ebpδ和Pparγ增加了4倍以上(Fig 4F)。综上所述,这些数据表明,Pu.1对衰老过程中ARC的发育至关重要。
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研究人员检测ARC对邻近细胞的抑制作用是否需要Pu.1,于是将3T3-L1细胞在对照ARC和Pu.1-KD-FACS分类的ARC的生长条件培养基中培养。诱导分化后,在Pu.1 KD ARC生长培养基中培养的细胞脂质积累水平高于对照组。qRT-PCR结果表明在分化第0天,与对照组相比,Pu.1KD ARC培养液处理的3T3-L1细胞的Sox9基因表达水平更低,而C/ebpδ、Pparγ和Fabp4表达水平更高。在分化第8天,在Pu.1 KD ARC组的Sox9表达降低约3倍,C/ebpδ、Pparγ和Fabp4水平升高4倍(Fig 5A)。这些结果说明,Pu.1在ARC抑制邻近细胞成脂分化过程中起关键作用。
为了进一步验证Pu.1是否是ARCs对邻近细胞的抑制作用的关键因子,研究人员进行了体内移植实验。研究人员通过感染过表达Pu.1慢病毒,然后进行抗性筛选,构建稳定过表达Pu.1的3T3-L1细胞。该细胞系不仅Pu.1表达水平升高,而且Lgal3、TNF-α、Ccl6、Flil的表达水平也升高,粘附蛋白如Colla1、Col5a1表达降低(Fig S4)。因此,稳定过表达Pu.1的3T3-L1细胞表现出类似Fig 4中瞬时表达Pu.1的3T3-L1细胞的基因表达谱。然后,将表达GFP的3T3-L1细胞与表达Pu.1的3T3-L1细胞混合,然后将它们与基底胶混合,皮下注射到免疫缺陷型的SCID小鼠中。12天后,收集移植后的小鼠脂肪进行分选,再检测免疫荧光和qRT-PCR(Fig 5B)。移植物采用LipidTox或DAPI染色。对照组GFP+ 3T3-L1细胞经脂质染色形成大量脂肪细胞。相比之下,过表达Pu.1的3T3-L1细胞形成的脂质明显降低,表明Pu.1可以显著抑制脂肪生成。更重要的是,当GFP+ 3T3-L1细胞与稳定表达的Pu.1细胞一起植入时,与单独植入GFP+细胞相比,混合稳定表达的Pu.1细胞和GFP+ 细胞形成的脂质更低(Fig 5C),qRT-PCR显示C/ebpβ、C/ebpδ、Pparγ和Fabp4显著降低。这些结果表明,过表达Pu.1不仅抑制脂肪生成,而且抑制体内邻近前脂肪细胞(preadipocytes)的分化。综上所述, Pu.1是ARC发育及功能作用的关键因子,并且ARC可以抑制邻近前脂肪细胞(adipose precursors)的分化。
总结
本文中,研究人员通过比较年轻和衰老小鼠的SAT中的总的SVF细胞的scRNA-seq,鉴定并命名了一种仅在衰老小鼠和人的SAT中出现的ARCs亚群。ARCs表达脂肪祖细胞分子标记物基因,成脂分化相关基因表达降低。ARCs分泌高水平的促炎性趋化因子Ccl6以抑制邻近前脂肪细胞的增殖和分化。此外,Pu.1是ARC发育及功能发挥的关键转录因子。总而言之,文中揭示了一种ARC细胞亚群,其存在抑制邻近前脂肪细胞分化的能力,这对衰老中皮下脂肪相关的功能衰退提供新的分子机制。