微生信生物-扩增子V0.1.exe使用指南

写在前面：

今年是2020年工作的第一天，科研任务我首先排在首位，这是对老板和自己负责，晚上去师兄家里吃了顿饭，回来发现十点了，这开始奋笔疾书，为大家带来微生信生物-扩增子V0.1.exe使用指南（评论区置顶安装所需的全部文件和示例数据）

扩增子V0.1.exe 简介

这是我EasyMicrobiome中的一个项目，为的是将整个流程让更多的人可以使用，所以新的一年exe版本就首先问世了。本来我们想将web版本首先出来，但是想想，服务器还不够稳定。同时shiny部分似乎要自己做，但是exe可以有赵向阳同学帮忙使用python搞定，所以就先出现了。

扩增子V0.1.exe 安装

第一步 安装R语言3.6版本

你也不需要去官网下载了，这里我提供win版本的R3.6.1。这也是我开发这套exe的版本，使用链接直接下载即可；

备注：R版本大于3.6以上都可以运行，注意3.5版本一下的绝对不可以正常运行。

安装完成之后由于部分电脑找到不到R路径，所以需要设置环境便量：

• 第一步：打开系统

  

• 第二步：进入高级系统设置：点击环境变量：

  

• 第三步：点击图中新建：

  

• 第四步：填入图中信息，一层一层保存退出即可。（注意如果是自定义R语言安装目录的话，就将路径修改为自己的R语言路径）

  

第二步 安装R包

这里我提供两种方式进行安装：第一种，直接使用命令进行安装，需要安装的R包又31个： 这里使用我之前推送的玩转R包 进行安装即可；所需R包我列到推送末尾：

第二种方式，这也是我推荐的方式，使用我的R包备份直接考进去library中即可完成，省时省力气。

这里百度网盘存有两个文件，一个是R，直接双击安装即可，另外一个是这批程序需要的R包，需要下载下来。

• 双击解压，就看到这些R包

  

将R包拷到哪里呢？

按照如图下方式将R包拷入library中。如果你的R没有安装到默认目录，那么相信你会修改安装目录，也可以找到安装目录，然后进入找到library文件夹，然后考进去就好了。注意如果在拷贝过程中出现提示，是否替换，你就选择替换就可以了。

• 第一步：找到这里

-第二步：找到这里：（如果安装目录不在这里，就在你的安装目录下面找R即可）

• 第三步 进入R中文件夹：library：

• 最后一步，将R包拷贝进去即可；

常见问题：

闪退：

软件找不到R语言，设置R_HOME环境变量即可。

运行错误：

缺少R包，由于R包之间的依赖很多，所以我将整个R包都打包，大家如果嫌麻烦，直接解压出来复制到R安装目录中国每年的library中，如果又冲突，选择替换即可。（注意这些R包在R3.6以上版本测试可用）