Cancer cell |中国四大院所联合揭示人类肝癌的药物基因组学研究

推荐：江舜尧

编译：小羊

编辑：马莉

中科院生物化学与细胞生物学研究所惠利健团队与中国科学院上海营养与健康研究所李亦学课题组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌课题组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷合作，于2019年8月1日在Cancer Cell 发表了题名为《A Pharmacogenomic Landscapein Human Liver Cancers》的文章。该研究使用全基因组测序和表达谱测序技术分析细胞系药物响应和基因组数据，描述了肝癌药物基因组学图谱，阐述了肝癌中基因组变异与药物响应的相关性。该研究建立了具有中国人遗传背景的肝癌细胞模型，可用于进一步发现新的治疗策略和分子标志物。

摘要

肝癌具有高度异质性，预后差，药物反应差。更好地理解基因改变和药物反应之间的关系将有助于肝癌的精确治疗。为了描述肝癌药物基因组图谱中的相互作用，我们研发了一种方案建立人类肝癌细胞模型，成功率约为50%，并生成了包含81个细胞模型的肝癌模型库(LIMORE)。LIMORE代表原发性癌症的基因组和转录组异质性。通过对LIMORE药物基因组图谱的研究，我们发现了一些未被探索的基因图谱关联，包括对肝癌流行变化的合成致死率。此外，还提出了选择索拉非尼反应患者的预测生物标志物的候选物。LIMORE为肝癌药物的发现提供了丰富的资源。

文中重要图片说明

图1 | 肝癌模型库与原发性肝癌的比较

图2 | 肝癌模型库覆盖原发性肝癌的致癌改变

图3 | 肝癌模型库的药物反应多样性

图4 | 肝癌模型库的药物基因组图谱

图5 | 与Wnt和MYC活化的合成致死相互作用

图6 | 索拉非尼的预测模型和生物标志物