来看看这篇11.552分的Theranostics,是怎么样来相对严谨地分析信号通路的……
分高一点的文章是怎么研究信号通路的呢
?夏老师就随便找了篇也不算太高的文章,11.552分的Theranostics……这篇还不是国人做的……
这篇是研究肠癌放疗耐受基因的
,首先就是在放疗耐受过程中找出异常表达的基因:
找到的就是CD45,他们发现CD45在肠癌放疗耐受中表达增加
。接着就分析CD45与肠癌耐放疗的相关性了:
接着就用流式分选出了CD45高表达和低表达的细胞,分别来做放化疗的耐受性实验,其实也主要是看看是不是CD45高表达导致的耐受表型
。这个用分选的细胞,其实和直接过表达也差不太多,但是更能反映体内的效果:
CD45高表达的细胞,放化疗耐受性明显是增强的
,那增强的原因是什么呢?他们觉得可能是肿瘤细胞干性增强造成的。于是他们分析了干性的靶标,以及肿瘤细胞干性相关的实验:
敲减了CD45后
,则抑制减弱了癌症发生、再增殖和转移这样的肿瘤细胞干性。
那机制不能只研究到这里,是什么使得CD45导致肿瘤细胞干性增强的呢
?他们首先分析了和干性相关的信号通路,和CD45的关系(敲减掉CD45后,qPCR变化明显的信号通路):
在这里面,他们认为Wnt信号通路最为致命……但他们也发现了
,CD45对于Wnt信号通路的调控,并不在于β-Catenin的mRNA阶段:
不要再问我为啥一提到Wnt信号通路,就要分析β-Catenin了……既然不是mRNA,那么就可能是调控了β-Catenin的蛋白
。于是他们分别用了放线菌素D(蛋白合成抑制)和MG132(蛋白降解抑制),对敲减CD45后的β-Catenin进行了分析:
他们发现,敲减后β-Catenin的泛素化降解增加了……大家应该都知道β-Catenin的降解是通过GSK3β对其磷酸化修饰后
,再进入的泛素化降解过程:
于是他们又针对性地分析了一下
,β-Catenin的降解相关的磷酸化位点:
敲减CD45后,β-Catenin的与降解相关的磷酸化位点增强了
……他们还用CD45的膜内结构域的突变体进行分析,发现主要起到抑制β-Catenin降解的结构域是D1……
最后,他们分析了CD45与β-Catenin的直接结合作用
,以及共定位,确定了二者有直接结合的能力,而CD45能通过抑制β-Catenin的降解相关的磷酸化,激活Wnt信号通路:
最后就形成了这么一张示意图
:
怎么说呢,其实这篇文章在推导的过程中
,其实还算的上是比较合理的。起码能对得起这个IF。有兴趣的话可以自己读一下,看看,会不会有什么收获。要看这篇文献,可以自己去PubMed上下搜一下。或者在评论区进行评论,就发给你们PMID号。实在不行就回复“公克”(不要在评论区回复
),要么就直接星球上见(当然,进不去也无所谓
)。好吧,今天就先给你们策到这里吧,祝你们心明
眼亮
。
封面:乡村爱情 谢飞机 https://pic.sogou.com/
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