听说你想学scATAC

组学技术层出不穷，基本上都可以在单细胞水平实现，虽然大家接触的都是单细胞转录组，其实主要是因为10X仪器商业化的成功，目前10X在主攻scATAC和空间转录组解决方案，那么肯定会有人感兴趣scATAC的数据处理了。
这里我直接推荐一篇文章 ，他们的全部数据集和代码都共享了：
一般来说，访问 GitHub会有一点点困难，加油！
https://github.com/GreenleafLab/10x-scATAC-2019 （进去，全部的代码免费获取哦）
当然了，看懂这些代码，需要有一些基础，有2个学习班推荐给大家：
文章是：Massively parallel single-cell chromatin landscapes of human immune cell development and intratumoral T cell exhaustion. Nature Biotechnology (Satpathy, Granja et al. 2019)
Link : https://www.nature.com/articles/s41587-019-0206-z
我的B站免费视频课程
虽然我出品了两个单细胞课程， 但是确实没有 scATAC 项目，就不凑热闹啦！不过我有一个ATAC-SEQ实战演练视频，免费在B站,https://www.bilibili.com/video/BV1C7411C7ez  大家学习的时候记得发弹幕交流哈！
同步查看视频配套代码 ：https://www.jianshu.com/p/5bce43a537fd
ATAC-SEQ实战演练的素材：链接：链接：https://share.weiyun.com/5rYmPT1 密码：dr3ub6 包括一些公司PPT，综述以及文献。测试数据下载方式也是在里面了。
ATAC-SEQ 实战演练的思维导图：文档链接：https://mubu.com/doc/2DG1mC2kdg 密码：rf2n

文末友情宣传

强烈建议你推荐我们生信技能树给身边的博士后以及年轻生物学PI，帮助他们多一点数据认知，让科研更上一个台阶：
推荐阅读
赞 (0)

相关推荐