综述 | 人类肠道微生物组的新见解（IF：41.456）
美国德克萨斯大学Alex H. Nishida和Howard Ochman于2019年1月8日在《Nature Reviews Genetics》上发表了题目为《A great-ape view of the gut microbiome》的文章。该综述提出了一个主要以人类为中心的观点，并通过其他类人猿物种的肠道微生物组揭示有关人类肠道微生物组的新见解。本文通过将近期对人类和与人类密切相关的动物的研究进行比较，来更深入地了解多种因素如何影响微生物组成以及人类与类人猿的微生物组有何不同。
文章摘要
人类从一个充满各种微生物的世界中组装自己独特的微生物组。人类与类人猿微生物组的比较提供了一个维度，这对于理解这些微生物群落如何形成，发挥功能和变化是必不可少的。这种进化观点不仅说明了人类肠道微生物群如何被我们的类人猿祖先所塑造，而且还说明了人类独特的特征，例如，细菌和古菌多样性的广泛丧失以及与宿主共同多样化的微生物谱系的鉴定。
文中主要图表说明
表1 | 影响人类和黑猩猩微生物组成的因素
图1 | 人类和黑猩猩肠道微生物组的微生物类群。来自西方社会的314名人类和贡贝国家公园的160只野生黑猩猩的肠道微生物组中不同分类等级的相对分类群丰度的比较，包括门（a），纲（b），目（c），科（d）和属（e）。
图2 | 将人和黑猩猩肠道微生物组分成组成相似的肠型。对黑猩猩和人类肠道微生物组中的属水平分类群的多因素分析将群落划分为三簇，称为肠型I（红色），II（蓝色）和III（黄色）。黑猩猩和人类肠型中占主导地位且共同存在的属被列在每个相应的簇附近。基于总体的种系多样性，黑猩猩和人类肠道的肠道微生物群落可以被区分并且是宿主特异性的。总之，这些结果表明，黑猩猩和人类肠道微生物组共有的每个属都包含不同的菌种（即，具有相同属的不同菌种），并且肠道微生物组分为不同的肠型，先于黑猩猩和人类的分化PC，主要组成成分。
图3 | 巨猿进化过程中肠道微生物组的细菌和古细菌多样性。a | 本综述中讨论的大猿物种的地理分布。b | 物种中的细菌（蓝色）和古菌（橙色）共享的操作分类单元（OTU）的数量叠加在物种系统发育的末端分支上。
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