FLEX条件性表达慢病毒载体(Cre-Off)是什么?
FLEX Cre-Off系统由两对异型Lox-变体重组位点组成,其中野生型序列称为LoxP,突变体称为Lox2272,分别位于ORF的两侧。 两种Lox-变体都可被Cre识别,但只有相同的Lox位点对可以彼此重组,与其他Lox-变体不能进行重组。 LoxP和Lox2272位点以交替方式位于ORF两端,每对位点互为反向。Cre重组酶不存在的情况下,客户定制的启动子可以驱动目的基因的正常表达。Cre重组酶存在的情况下,LoxP和Lox2272位点对分别重组,导致ORF方向反转为反向,且其中的一对重组位点将具有相同的方向,Cre会介导产生正向重组切割,继而分别留下一个不同的重组位点。ORF方向的反转,使得目的基因无法正常表达。由于ORF侧翼是两个不同的Lox-变体位点,所以即使存在Cre也不会进一步发生重组。
慢病毒载体首先以质粒的方式构建并使用E. coli扩增,然后与多个辅助质粒一同转染至包装细胞。载体上的两个LTR区域之间的DNA序列将被转录成RNA,而辅助质粒表达的病毒蛋白进一步与这些RNA组装形成完整的病毒颗粒。有活性的病毒颗粒被释放到上清液中。病毒上清液可直接转染或者浓缩后转染细胞。
当病毒感染靶细胞时,病毒RNA被反转录成DNA,然后永久性整合到宿主基因组。位于两个LTR区域之间的FLEX Cre-Off开关连同其他病毒基因组组分永久整合到宿主基因组。在Cre重组酶的介导下,自定义启动子调控下的目的基因的反转ORF编码方向从而实现目的基因的表达沉默。
通过改造优化,我们的慢病毒载体删除了与病毒包装和转导相关的基因(这些基因由辅助质粒进行表达,用于病毒包装过程),使产生的慢病毒颗粒是复制缺陷型的。即包装的病毒只具有转导靶细胞的能力,而无法在靶细胞中进行大量复制,因而具有很高的生物安全性。