最新世界植物名录介绍与下载 2024-05-09 22:44:29 全球有约30万种维管植物,其分类学及系统学研究异常复杂。早期,人们根据几个主要性状进行机械划分,如草本、乔木、雄蕊数量等。因为大量无关植物放在了一起,非常不自然。随着对植物解剖结构的深入了解,人们开始将更多形态相似的植物放在一起,产生了近代分类系统,如大家所熟悉的恩格勒系统、哈钦森系统、克朗奎斯特系统等等。随着技术手段的不断更新升级,来自各渠道的信息、证据正在极大地完善分类系统框架。人们逐渐发现,一些看似结构相似的植物,很可能是趋同进化所导致的形态相似和研究不够深入所产生的误解。随着分子系统学的发展,以分子系统学为主要手段,结合植物化学、细胞学、超微结构等证据,人们建立了新的分类系统。1998年,全世界多个植物学研究单位参与的被子植物系统发育研究组(Angiosperm Phylogeny Group) 在《密苏里植物园年刊》上发表了APG分类系统第一篇研究论文,随后又分别在2003年、2009年和2016年在《林奈植物学报》发表了APG II、APG III和APGIV,根据分子系统学研究结果对被子植物目与科等级的分类进行了调整。APG IV系统共有64个目,416个科,数目适宜,便于应用和教学。因此,国际植物分类学界有不少人推荐用APG IV系统代替传统分类系统,作为学术研究和科学传播的基础工具和交流框架。与APG IV系统类似,裸子植物以及石松植物和蕨类植物也有基于分子系统发育的新系统,即克里斯滕许斯裸子植物系统和PPG系统。然而,所有的植物分类系统,只涉及科一级,对应用更有实际意义的属、种一级分类变动,是这些文章没有涉及的。因此,一些植物研究机构以APG系统为框架,根据最新的研究成果,陆续发布了世界植物名录。最主要的世界植物名录有:The Plant List(TPL, http://www.theplantlist.org),由英国皇家植物园邱园主导建立。根据2014年3月的整理结果(不同时间、不同研究者使用不同数据获取方式,这个数字会有差异),TPL包含1,298,051个名称,其中接受名373,942个,异名703,949个,未解决名称220,159个。Plants of the World Online(POWO, http://powo.science.kew.org),TPL的继任者。根据2020年8月的整理结果,POWO共有1,080,035个名称,其中接受名428,156个,异名651,879个。World Flora Online(WFO, http://www.worldfloraonline.org),由密苏里植物园、纽约植物园、爱丁堡植物园和邱园等几家主要机构联合制作。共包含1,325,205个名称,其中接受名350,510个,异名和未解决名称974,695个。最新世界植物名录(LCVP)分子生物学的发展非常迅速,植物各大类群的研究成果飞速更新,因此以上几个主要世界植物名录,多少有些更新不及时。接下来要介绍的,便是目前最新的世界植物名录。The Leipzig Catalogue of Vascular Plants(LCVP, https://github.com/idiv-biodiversity/LCVP),是德国莱比锡大学主导编制的世界维管植物名录。LCVP包含564个科,134,600属,1,315,562个名称,其中接受名351,180个。文章(见文末“阅读原文”)介绍了LCVP的整理过程。我根据原始数据,进行了二次整理,更正了一些错误,并将数据转换为Excel文档。接受名位于第一个工作簿中,异名位于第二个工作簿中,请见Excel文档下方工作簿标签。LCVP作者根据以下几个主要数据库:http://www.ville-ge.ch/musinfo/bd/cjb/africa/recherche.php?http://gentian.rutgers.edu/classNEW123.htmhttp://botany.si.edu/gesneriaceae/checklist/result.cfmhttp://www.systax.orghttps://parasiticplants.siu.edu/ListParasites.htmhttps://floramalesiana.org/newhttp://www.plantsoftheworldonline.orghttp://www.catalogueoflife.org/annual-checklist/2019http://www.omnisterra.com/bot/cp_home.cgihttps://rbg-web2.rbge.org.uk/diptero/diptax.htmlhttps://compositae.landcareresearch.co.nzhttp://www.cvh.ac.cn/cvh6/view/index.phphttp://cichorieae.e-taxonomy.net/portalhttp://ww2.bgbm.org/EuroPlusMed/query.asphttp://floradobrasil.jbrj.gov.br/reflora/listaBrasil/ConsultaPublicaUC/ConsultaPublicaUC.do#CondicaoTaxonCPhttp://www.melastomataceae.net/MELnameshttps://plants.usda.gov/javahttps://collections.nmnh.si.edu/search/botanyhttp://posa.sanbi.org/sanbi/Explorehttp://palmweb.org以及其他额外4500篇分类学文献,建立了基础数据库。在此基础上进行了名称审定。原始数据包含超过200万条植物名称条目,并有大量的拼写错误、不一致和相互矛盾的状态。接受名的粗略准则是对质量和可靠性的主观把握。最新的出版物有着更高的可靠等级。当互相之间有冲突时,通常使用有着更全面文献引用和更多异名收录的出版物。仅基于形态的系统发育容易出现分歧,因此一般只采用基于分子数据所做出的系统发育研究。如果是新的未发表组合,则标注comb. ined.。一些能够说明名称处理的例子。龙血树属(Dracaena)和 虎尾兰属(Sansevieria)关系密切。其中虎尾兰属(Sansevieria)似乎明确地嵌套在龙血树属(Dracaena)中,但两个属之间的差异是连续的。Lu等人将龙血树属(Dracaena)中的夏威夷种独立成金剑木属(Chrysodracon),但没有将虎尾兰属(Sansevieria)与龙血树属(Dracaena)重新组合。他们提出的论证和数据是彻底和全面的,因此LCVP接受了作者的论点,将龙血树属(Dracaena)的夏威夷种分离到新属金剑木属(Chrysodracon)中,但虎尾兰属(Sansevieria)和龙血树属(Dracaena)仍作为不同的属。在另一个例子中,Borchsenius等人研究表明,传统描述中的“肖竹芋属”(Calathea)是多系的。为了使伞竹芋属(Ischnosiphon)和单室竹芋属(Monotagma)分离,作为Calathea支系(包含Calathea模式种)的姊妹支系,较大的Calathea支系被放入了重新确立的Goeppertia(肖竹芋属)。LCVP还对物种名称的拼写进行了修改,按照《国际藻类、真菌和植物命名法则》(深圳法规)中的指南和建议,对物种名称进行检查。例如,使用标准化的表音符号,如warscewiczii(既不是warscewitzii也不是warszewiczii)。学名中只能使用从'A'到'Z'的大写字母,从'a'到'z'的小写字母以及连字符'-',特殊字符无效,如Isoëtes写为Isoetes,Köberlinia写为Koeberlinia。为了进一步标准化和便于在自动工作流程中使用,LCVP省略了作者姓名中的空格(C. F. W. Meissn.写为C.F.W.Meissn.,Balf. f.写为Balf.f.)。用'&’符号连接两个作者发表的名字;由三个或更多的作者发表的名字,限制为第一作者名字及后面的'& al.’。LCVP中只包括自然杂交种,没有人工杂交种。最后,LCVP还提供了R语言工具,请参阅https://github.com/idiv-biodiversity/LCVP以及https://idiv-biodiversity.github.io/lcvplants/articles/taxonomic_resolution_using_lcplants.html。由于数据量很大,LCVP提供了一个纯数据包,以及一个单独的工具包lcvplants,其中有一个用于解决分类名称的模糊匹配算法。两者都可以通过github下载和安装。LCVP数据包只包含三个文件:植物名称及其分类状态的数据集、用于编制清单的文献参考资料包(由三个文件组成)和一个元数据描述文件。lcvplants软件包包含一个用户级函数,使用LCVP数据进行快速模糊匹配以解决分类名称问题。这种分类名称的解析是以一种用户友好的方式实现的,只需要几行代码就可以完成。 赞 (0) 相关推荐 自带红蓝CP的小花,还有“背井离乡”的波折身世 在开始今天的故事之前,我们先来看一串植物的名字:繁缕.牛繁缕.假繁缕.沟繁缕.田繁缕.琉璃繁缕--emmmm,看完是不是觉得快不认识"繁缕"两个字了? 繁缕本缕 | 含笑 按常理, ... 国务院国资委网站公布最新央企名录!共97家 5月10日,国务院国资委网站公布最新中央企业名录,详细如下: 中央企业名录 化工央企有哪些?2021最新央企名录公布及其行政级别划分 2021年5月10日,国务院国资委发布最新版央企名录,列入国务院国有资产监督管理委员会履行出资人职责的企业为97家.这97家企业涉及核电.军工.航空航天.石油化工.电力.能源.电信.汽车制造.机械制造 ... 官宣:国家5A级旅游景区 2!(附:2021最新5A景区名录) 5月11日,文化和旅游部发布<文化和旅游部关于确定新疆维吾尔自治区赛里木湖景区和新疆生产建设兵团塔克拉玛干·三五九旅文化旅游区为国家5A级旅游景区的公告>.公告确认新增2个5A级旅游景区: ... 最新央企名录公布,八大建筑央企变了! ----------------以下是正文----------------- 来源:梁子笔记.国资委网站.网络等 央企,即中央企业,是指由中央人民政府(国务院)或委托国有资产监督管理机构行使出资人职责 ... 最新认证机构失信名录 近日,认监委对认证机构失信名录内容进行了更新,共10家机构.详情如下: 认证机构失信名录机构名称统一社会信用代码法定代表人身份证件类型和号码主要负责人身份证件类型和号码失信行为事实深圳中大国际认证有限 ... 成功列入世界遗产名录的神画:宁明花山岩画 成功列入世界遗产名录的神画:宁明花山岩画 【世遗】塔吉克斯坦的“老虎森林”保护区将被列入世界遗产名录! 2021年5月20日,(杜尚别,夏冉译)据"阿维斯塔"的消息称,在塔吉克斯坦共和国政府下属的环境保护委员会与联合国教科文组织区域(阿拉木图)办事处举行的会议上,讨论了准备将塔吉克斯 ... 2021最新股权转让合同范本.doc免费下载 2021最新 - 股权转让合同范本下载 401 次 (文中蓝色字体下载后有风险提示)本股权转让合同由以下双方在友好协商.平等.自愿.互利互惠的基础上,于____年____月____日在________ ... 超级任天堂世界主题乐园介绍影像!《异世界酒馆六重奏第二卷》将于明年1月登陆NS! 腾讯招聘上架多个<宝可梦>相关岗位 近日腾讯招聘页面上架了多个<宝可梦>相关的岗位招聘,其中包括宝可梦概念顾问.宝可梦运营策划.宝可梦Switch版本策划等.这或许意味着我们将 ...