当思想碰撞，不只是火花
当思想碰撞，不只是火花
——暨NAU_LorMe－UU_EB合作初步成果
2017年为中荷建交45周年，两只可爱的大熊猫“武雯”、“星雅”就在一周前落户荷兰，成为中荷友谊的见证。科技方面，两国学者也建立了牢固的基础和深厚的友谊。从2012年10月至今，南京农业大学资源与环境科学学院LorMe实验室和荷兰乌特勒支大学Ecology & Biodiversity课题组的Alexandre Jousset博士建立起密切合作，共同探讨根际微生物生态与植物健康。
2012年10月Alexandre Jousset博士第一次访问LorMe实验室
这次合作不仅是知识火花的碰撞，也是文化的交流。Jousset博士在111等项目支持下每年访问LorMe实验室两次，每次都会举办相应的报告和学习交流会，如科技论文写作、实验设计等。双方的密切交流及显著成效还吸引了欧洲其他国家或实验室的研究者来LorMe团队交流合作，如英国约克大学噬菌体细菌共进化专家Ville Petri Friman博士、荷兰格罗宁根大学微生物生态入侵专家Joana Salles副教授、荷兰皇家生态研究所（NIOO）的原生动物专家Stefan Geisen、法国农业科学院（里昂）微生物群体进化专家Thomas Pommier研究员、荷兰乌特勒支大学Plant-Microbe Interaction团队专家Peter Backer副教授和Roeland Berendsen博士、法国农业科学院（图卢兹）Stephane Genin研究员和Nemo Peeters。同时，LorMe实验室的指导老师们也去荷兰进行了较为长期的交流。
2014年5月研讨会（从生态和进化角度思考土传病害防控）+生物信息学培训
2014年Jousset博士被聘为南京农业大学客座教授（左图为沈其荣教授和Jousset博士）
2015年5月土壤微生物区系调控与植物健康研讨会
2016年12月研讨会（根际益生群落装配与调控）
各国研究学者到访LorMe实验室
正因为中荷双方的共同努力，近几年双方科研成果颇丰，已有9篇根际微生物互作文章发表在国际高水平期刊上。如揭示根际非致病菌与致病菌的营养竞争机制，即营养网络特征，从而预测微生物群落对入侵病原菌的稳定性及防御力，还探讨了外界资源环境对营养竞争的调控作用（Weiet al., 2015, Nature Communications和Yanget al., 2017, Environmental Microbiology）；还有结果表明利用多样性高的根际促生菌(PGPR)群落可更加有效地预防病原菌的入侵（Huet al., 2016, mBio）；生防菌与噬菌体合作能更好地抵御病原菌对作物的侵染（Wanget al., 2016, Evolution）；根际微生物可调控植物根际分泌物的酚酸含量（Guet al., 2016, Biology and Fertility of Soil）；我们还发现外界温度对病原菌的入侵及有益菌的抵抗能力起着至关重要的作用（Weiet al., 2017, Journal of Applied Ecology）;综述了稀有微生物在生态系统中的功能（Joussetet al., 2017, ISME J）。还有许多结果正在整理当中，在不久的将来都将与大家分享。
附文章列表：
1. Tianjie Yang, Zhong Wei*, Ville-Petri Friman,Yangchun Xu, Qirong Shen, George A.Kowalchuk, Alexandre Jousset. Resourceavailability modulates biodiversity-invasion relationships by alteringcompetitive interactions. Environmental Microbiology, 2017, doi:10.1111/1462-2920.13708.IF5-year=6.288.
2. Zhong Wei, Jianfeng Huang, Tianjie Yang,Alexandre Jousset, Yangchun Xu*, Qirong Shen, Ville-Petri Friman.Seasonal variation in the biocontrol efficiency of bacterial wilt is driven bytemperature-mediated changes in bacterial competitive interactions. Journal of Applied Ecology,2017, DOI: 10.1111/1365-2664.12873. IF5-year=6.038.
3. Alexandre Jousset, Christina Bienhold,Antonis Chatzinotas, Laure Gallien, Angélique Gobet, Viola Kurm, Kirsten Küsel,Matthias C Rillig, Damian W Rivett, Joana F Salles, Marcel GA van der Heijden,Noha H Youssef, Xiaowei Zhang, Zhong Wei and WH Gera Hol. Where less may be more: howthe rare biosphere pulls ecosystems strings. The ISME Journal, 2017, 1–10. doi:10.1038/ismej.2016.174. IF5-year= 9.328.
4. Xiong Wu, Li Rong, Ren Yi, LiuChen, Zhao Qingyun, Wu Huasong, Jousset Alexandre, Shen Qirong *. 2017. Distinct roles for soil fungal andbacterial communities associated with the suppression of vanilla Fusarium wiltdisease. Soil Biology and Biochemistry 107, 198–207. IF5-year = 5.04.
5. Xiaofang Wang#, Zhong Wei#*, Mei Li,Xueqi Wang, Anqi Shan, Xinlan Mei, Alexandre Jousset, Qirong Shen, Yangchun Xu*(通讯), and Ville-Petri Friman.Parasites and competitors suppress bacterial pathogen synergistically due toevolutionary trade-offs. Evolution, 2016, doi:10.1111/evo.13143.IF5-year= 4.366.
6. Yian Gu, Yugang Hou, DapengHuang, Zhexia Hao, Xiaofang Wang, ZhongWei*, Alexandre Jousset, ShiyongTan, Dabing Xu, Qirong Shen,Yangchun Xu*, Ville-Petri Friman. Application of biochar reduces Ralstoniasolanacearum infection via effects on pathogen chemotaxis, swarming motility,and root exudate adsorption. Plant Soil, 2016, DOI: 10.1007/s11104-016-3159-8.IF5-year= 3.581.
7. Hu J#, Wei Z#*, FrimanV-P, Gu S-H, Wang X-F, Eisenhauer N, Yang T-J, Ma J, Shen Q-R, Xu Y-C*, JoussetA. 2016. Probiotic diversity enhances rhizospheremicrobiome function and plant disease suppression. mBio7(6):e01790-16. doi:10.1128/mBio.01790-16.IF5-year=6.887.
8. Gu, Yian; Wei, Zhong*; Wang, Xueqi; Friman, Ville-Petri; Huang, Jianfeng; Wang, Xiaofang; Mei, Xinlan; Xu, Yangchun*(通讯); Shen,Qirong; Jousset, Alexandre. Pathogen invasion indirectly changes the composition of soilmicrobiome via shifts in root exudation profile. Biology and Fertility of Soils, 2016,52(7):997-1005.IF5-year= 3.287.
9. Zhong Wei#,Tianjie Yang#,Ville Petri Friman, Yangchun Xu, Qirong Shen*,Alexandre Jousset*.Trophicnetwork architecture of root-associated bacterial communities determinespathogen invasion and plant health. Nature communications. 2015 6:8413| DOI: 10.1038/ncomms9413.IF5-year= 12.001.
近期，LorMe实验室韦中教授正在荷兰乌特勒支大学进行学术访问，还到访了英国约克大学（Ville Petri Friman组织的研讨会，介绍中国青枯病现状以及微生态调控研究进展）、法国农科院（图卢兹，与Nemo洽谈联合培养研究生事宜）、荷兰瓦赫宁根大学（在土传病害研讨会介绍LorMe研究进展）、格罗宁根大学（与Joana Salles教授讨论合作计划及5月份访问LorMe事宜）。
以下才是本推送的重点，哈哈
4月18日，韦中副教授参加了杨天杰博士的答辩（这也是这次访问交流的重要任务）。重点不是韦博士参加了，是杨天杰博士答辩了，拿到了荷兰综合实力最强的乌特勒支大学的博士学位。这是LorMe的重要事件，播报的有些晚，但对LorMe来说一点不晚。
George Kowalchuk教授为杨天杰授予博士学位证书
杨天杰博士的研究方向为根际有益微生物群落与病原菌间的营养竞争，并探讨环境资源对营养竞争的调控作用。作为LorMe实验室与荷兰乌特勒支大学联合培养的第一个博士生，她的表现得到了荷方团队老师和其他成员的高度认可。在CSC资助两年之后，Jousset博士继续从项目中多支持了7个月。2年7个月顺利拿到乌特勒支大学博士学位，是南京农业大学与乌特勒支大学良好国际合作的开端，也为今后更深入合作交流的铺垫。
根际微生物的互作不仅应关注细菌本身，还应重视整个食物网络以及资源环境的调控，才能更全面的研究或预测根际微生物的营养互作网络，进而为调控根际微生物群落，保障植物健康夯实基础。学科内部以及跨学科交流更有利于推陈出新、提高学生学术能力，从而磨炼出质量过硬的学术成果。
今天也是Alexander Jousset博士的生日，在此LorMe也以此文送去特别的祝福，愿他生日快乐，梦想成真。
2015年8月瑞士洛桑（第十五届欧洲进化生物学会议）
注：LorMe团队的胡洁博士生目前也在荷兰乌特勒支大学深造，另外熊武、宋阳也是LorMe所在的大团队SMOF（Soil Microbiology & Organic Fertilizer土壤微生物和有机肥团队）与荷兰乌特勒支大学联合培养的博士生，在这里衷心祝福他们早日学成归来。