【LorMe新生】[微小说]根际大战——守护圣树
在土壤世界中，生活着无数的生灵，其中“根际圈”是这个世界的中心，在这里生活的“微生物”数量庞大、密集且种类繁多。它们依靠“圣树”而活，圣树与它们签订了契约：微生物保护圣树不受“病原菌”的侵害，圣树则提供各种各样的“奇异果实”促进族群的生长壮大。
一天，芽孢杆菌爷孙俩正趴在圣树根脚大口朵颐着圣树长出的奇异果实。
“娃啊，多吃糖可以快点长大，多吃氨基酸和有机酸可以帮你生产更多的'抗生素’打击病原菌提高你的战斗力。”
“爷爷，我们为什么要保护圣树呀”
“圣树是我们的家，我们保护圣树，也是在保护我们自己”
“那我们能打败病原菌吗？”
“它们是不可能被消灭的，我们在变强，敌人也在变强，我们的目标是要压制病原菌的繁殖，以防它们伤害圣树，我们是抵御病原菌入侵的第一道防线”
前方战线
“报告将军，有新的病原菌入侵了我们这里”
“不用担心，圣树已经激活了免疫系统，分泌了大量的苹果酸，特异性地促进了有益菌组的生长，多种有益菌与它们的共生菌已经联合组建了战斗集团。”[1]
这时已经有浩浩荡荡的青枯菌和黑粉菌大军对根际圈发起了进攻。
根际圈的有益菌们已经紧急聚在一团进行战斗动员。
军团长肯定的说道：“根据以往的经验，我们需要组成具有合作性高（资源利用连接度高）、内部竞争小（资源利用嵌套度小），并对外部病原菌形成强大的竞争优势（与病原菌资源利用重叠度高）的功能菌群才能高效阻止病原菌入侵。”
军团幕僚连忙说：“上一次病原菌的入侵，其初始种群规模很大，经过一番的抵御战斗后，将病原菌抵挡在外。但经过那次战斗的影响，我们的微生物群落多样性降低，病原菌的入侵也导致了部分与病原菌相似营养偏好的种群灭绝，丰度大大降低[2]，属下担心这些种群这次会消极避战，影响军心。”
军团长回应道：“这也是没有办法的事，战争怎么会没有牺牲，它们已经逐渐失去了原有的生态位，优胜劣汰是自然法则。”
“报——前方发来讯报：'中立’派和病原菌沆瀣一气混在一起了”
“可恶，这些'中立’派为什么会支持病原菌，帮助它们大量的繁殖？”幕僚恼怒道。
“中立派虽然对我们没有危害，但它们能提供病原菌生长发育所需的营养，而且源源不断。”军团长平静的回答道。
“我们应该切断病原菌与它们的联系。”
“暂时没有好的方法切断它们的联系，不过我们可以找出它们，抑制它们生长，等到它们生物量降低到一定程度就对病原菌没有太大的帮助了。”
“又报——前方发来讯报，病原菌们起内讧了，青枯菌分泌了大量的邻氨基苯甲酸抑制黑粉菌的生长，抢先占据了有利的生态位”
军团长立即发布指令：“让所有细菌启动TrpEG系统，生产大量的邻氨基苯甲酸，我们先干掉一个敌人再说”
“幕僚团，这次我们有什么行动计划？”
其中一名幕僚说：“这场战争我们的具体方针就是提高有益菌的素质、拉拢中间派、孤立病原菌”
又有一名幕僚说道：“通常我们的做法是，释放大量的特异性较高的铁载体，减少环境中可螯合的铁含量，让病原菌释放的铁载体无法螯合铁，病原菌生产的铁载体也就被浪费了，消耗了自身的资源反而没有获得足量的铁，此消彼长之下我们的胜算更大”[3]
“我们的增援呢？”
“噬菌体已经开始大规模感染青枯菌了，青枯菌的生存能力有所降低，但长时间的共进化作用已经使得青枯菌对噬菌体的抗性增强”
“微生物组现在情况如何？”
“将军，我们将微生物群组进行了分工，将不同的生产步骤分给不同的成员，减少了单一种群的负担，同时将微生物组系统模块化，可以独立的调整、修改和替换，提高了资源生产效率，占用了病原菌的生态位，让病原菌无处生存”[4]
“很好，听说我们有新的武器装备了”
“是的，我们改装了'铁载体’，在铁载体上装了'炸药’，病原菌一吸收铁载体就嗝屁”
“我们也需要铁载体螯合铁元素，会不会误伤？”
“不用担心，铁载体有很多类型，我们自己用的铁载体特异性高，而且病原菌分泌铁载体会降低自身的致病性，战斗力降低”
“再报——前方防御战线已经大规模失守，病原菌已经入侵到圣树根系”
“怎么会这样？”军团长震惊的说道。
“这次的敌人更强了，有益菌产生的抗生素没有效果，病原菌分泌了大量蛋白质和糖类包裹自身形成生物膜，阻挡了抗生素”
“再再报——病原菌已经突破第二道防线进入圣树体内了”
“怎么会？圣树的表皮那么坚硬”军团长有些慌张。
“将军，您忘了？圣树它是一株番茄，体内木质素和纤维素含量比较低，含水量很高，极易感染”
圣树体内寄生的微生物也开始抵御病原菌，圣树加快了分泌各种奇异果实，供给有益菌群生长，大量的有机酸提高了磷、钾、铁元素的有效性，圣树分泌的大量氨基酸为微生物组群提供氮源，各种糖类为微生物组群提供碳源[5]，同时还有促进生化反应的各种酶类。
此时，一丝曙光透过土壤表面冷凝的水珠，七彩的光芒照亮了黑暗的地下世界。军团长这才恍然大悟，原来已经天亮了，黎明带来了希望，同时也带来了力量。
“兄弟们，天亮了，圣树开始光合作用了，可以为我们提供源源不断的营养，不用害怕补给跟不上，现在又是一天中最冷的时候，病原菌活性降低，还等什么，上刺刀，冲锋！”
草芽孢杆菌、假单胞菌、放线菌开始和病原菌短兵相接，有益菌直接吸附在病原菌菌丝上，产生溶菌物质消解菌丝体，使菌丝断裂、解体，同时使病原菌的原生质暴露出来，抗生素直接对原生质杀伤。
战场上尸横遍野，无数有益菌与病原菌的残骸被其他微生物吸收利用，经过分解转化成养料又供给各自的军团，一部分的养料被圣树吸收利用，促进圣树的生长发育。
“爷爷，你不要死啊。”
“娃啊，不用担心爷爷，爷爷不会死，爷爷的身体会成为你们成长的养料，爷爷的精神……只要你一直记得爷爷，爷爷就一直活着”
战场上一片狼藉，芽孢杆菌、假单胞菌、放线菌、青枯菌、黑粉菌的尸体残缺不整，四处残留着抗生素、有机酸、蛋白酶……
捕食者原生动物也加入了战场，它们是占据绝对优势的微型真核生物，主要捕食细菌，原生动物的选择性捕食重塑了根际微生物的组成，同时它们促进了有机物的矿化，给有益菌提供充足的补给。
胜利的天平开始向有益菌一方倾倒，越来越多的其他微生物群占领病原菌的生态位，病原菌大势已去。
“我们又赢了”
“是啊，我们又赢了”
（完）
[1] Berendsen Roeland L, Vismans Gilles, Yu Ke, SongYang, de Jonge Ronnie, Burgman Wilco P, Burmølle Mette, Herschend Jakob, BakkerPeter A H M, Pieterse Corné M J. Disease-induced assemblage of aplant-beneficial bacterial consortium.[J]. The ISME journal, 2018,12(6).
[2] Mallon C A, Le Roux X, van Doorn G S, Dini-Andreote F,Poly F, Salles J F. The impact of failure: unsuccessful bacterial invasionssteer the soil microbial community away from the invader's niche.[J]. The ISME journal, 2018,12(3).
[3] Saha M, Sarkar S, Sarkar B, et al. Microbialsiderophoresand their potential applications: a review[J]. Environmen tal Science and Pollution Research, 2016,23(5):3984-3999.
[4] Tsoi Ryan, Dai Zhuojun, You Lingchong. Emerging strategiesfor engineering microbial communities.[J]. Biotechnology advances, 2019,37(6).
[5] Chunlan Yang, Yue Dong, Ville‐Petri Friman, AlexandreJousset, Zhong Wei, Yangchun Xu, Qirong Shen. Carbon resource richness shapesbacterial competitive interactions by alleviating growth‐antibiosistrade‐off[J]. Functional Ecology, 2019,33(5).