实验发现 新冠病毒可把自身片段逆转录进我们的基因
人类的基因组是一个大坟场,里面到处都是曾经困扰我们祖先的病毒的基因片段。如果麻省理工学院研究人员的最新研究经受住了质疑,那么新冠病毒很可能也会加入其中。
几块病毒代码片段散落在我们的基因里,并不一定意味着病毒无法根治。它甚至可以在一定程度上解释为什么少数病人在康复后很长时间内仍然COVID-19检测呈阳性。
但是SARS-CoV-2根本不具备将自己植入人类基因库的工具,这意味着它需要某些特殊技巧。
麻省理工学院Whitehead研究所的生物医学研究员张立国(音)说:"SARS-CoV-2不是逆转录病毒,这意味着它无法把自身反向编辑进人类的基因组。然而,包括人类在内的许多脊椎动物的基因组里都曾检测出非逆转录病毒的RNA病毒序列。"
去年,张立国团队分享了初步结果,表明SARS-CoV-2可能拥有某些手段。
利用已公布的受感染细胞培养物和患者样本的数据集,该团队在细胞产生的序列中发现了部分人类、部分病毒的转录物质。
随后的实验评估了SARS-CoV-2颗粒的存在是否足以刺激细胞产生某些专门将RNA逆转录为DNA的酶。
他们的研究结果支持了一种相当令人担忧的可能性:冠状病毒序列可以被复制并粘贴到我们的基因组中。另一方面,重要的是,这些证据未能说服整个科学界。
论文遭到了其他研究人员的严重怀疑,他们还指出病毒与人类基因的混合序列可能只是病毒的某种伪装手段。
张的团队承认,这些批评是公平的。因此,他们需要更强有力的证据。
他们的工作现在已经通过了同行评审,并发表在PNAS上。在更新的研究中,研究人员提供了新的理由,认为冠状病毒可能在感染消失后很长一段时间内持续困扰着我们的细胞。
除了寻找冠状病毒与人类基因片段的嵌合体和观察病毒支配转录工具的迹象外,该团队还直接搜索了人类基因组内存在病毒序列的证据。
他们甚至使用了三种不同的DNA测序技术,以确保他们的结果不是任何一种技术自带的瑕疵。
在每一种情况下,他们都发现SARS-CoV-2基因材料片段滑入了细胞的基因库中,就像从违禁书中撕下的书页。
有一半的 "书页" 是随机颠倒插入的,这一事实暗示,它们不是病毒刻意为之。
经进一步检查,插入序列的两侧也不是随机的编码片段。这些编码带有转座子的特征——一种所谓的跳跃基因,它进化出一种方法,可以脱离原位并将自己插入到基因组的其他地方。
一些转座子通过使用从过去的病毒感染中偷来的酶来实现这一目的。
其中一类序列被称为LINE1逆转录转座子,占我们整个基因组的17%,令人震惊。尽管大多数已经失去了打包和移动的功能,但有些仍然活跃,偶尔会造成一些后果。
而且它可能会让SARS-CoV-2进入我们的DNA。
"有一个非常清晰的LINE1整合的足迹,"该团队之一,白石研究所生物学家Rudolf Jaenisch说。"在病毒序列与细胞DNA的交界处,有20个重复碱基对。"
然而,这项实验是在实验室的细胞培养物中——而非实际的人类体内——完成的,所以仍有怀疑的余地。还有一个问题是,它意味着什么——虽然这些片段不能构建新的感染性颗粒,但它们是否可能以其他方式具有生物活性;后果到底是好是坏,现在还远远不清楚。
https://www.sciencealert.com/we-have-the-strongest-evidence-yet-that-sars-cov-2-can-insert-itself-into-our-genome