血清标志物数据库推荐

对于一个疾病的诊断而言,其金标准都是病理检测等有一定有创性的指标检测,这种检测方法对于患者损伤极大,所以如果能在血液当中找到一个疾病相关的诊断指标的话,那对于诊断和随访而言就很有方便的。今天就给大家介绍一个用于筛选诊断标志物的数据库。BBCancer(http://bbcancer.renlab.org/)

首先从名字来说,这个数据库做的就是肿瘤相关的指标检测。这个数据库一共包括15种肿瘤的结果。另外的话,上面的数据库数据来源是蛋白质谱芯片,做的也是蛋白相关的指标。这个数据库使用的数据则是血液的二代测序或者芯片数据,所以找的是6种不同的RNA作为指标:分别是 messenger RNAs(mRNAs), Long non-coding RNAs(lncRNAs), microRNAs(miRNAs), circular RNAs(circRNAs), tRNA derived fragments(tRFRNAs) and Piwi-interacting RNAs(piRNAs)

这个数据库也提供了两种检索方式,具体信息检索以及已知标志物查看

1

具体基因检索

这里我们需要提供的是基因名即可。如果不提供基因名则会显示所有结果。

同时,我们可以点击相对于的具体基因的肿瘤的结果,就可以看到详细的数据结果了。

2

已知标志物查看

另外这个数据库也整合了,已知的一些标志物,方便我们查看在其他肿瘤当中这些标志物是不是有意义。

我们只需要点击 Full Name 的链接就可以看到和上面一样的具体的结果了。这里就不展示了。

3

数据下载

这个数据库不仅提供了差异表达分析的结果下载,同时还提供了表达水平的结果下载。这样也方便我们进行自己的数据分析DIY了。

数据库总结

以上就是两个血清标志物相关的数据库。关于这些标志物的筛选,其实也是高通量测序的结果,只不过用的样本是血液而已。基本上如果要研究,也是需要进行验证的,如果有研究诊断标志物的可以去查查看。

PS:AAgMarkers这个数据库是17年发表的文章。。有需要查这个数据库的同学,建议把数据全部下载下来。。这么久了,说不准服务器快关闭了。

看完如果觉得有所收获,点个“在看”再走哦,让大家共同学习~~

(0)

相关推荐

  • 爱你!恨你!糖类抗原--CA199

    ★ 随着肿瘤患病率逐年上升,人们的防癌意识逐渐增强,所以在体检中会增加一些肿瘤筛查指标,CA199就是一个颇受患者和临床医生重视的"肿瘤标志物". CA199是一种细胞膜上的糖蛋白 ...

  • 【原创】肿瘤标志物升高,就是得癌症了吗?

    FM105.5 马大姐话健康 10:00-11:00 我们现在在体检时,经常会看到有这样一个项目:肿瘤标志物.很多人一听这个名字,就会认为这是一种能检测出癌症的检查.如果这项指标的数值升高,就会恐慌: ...

  • 13条推荐意见!甲状腺癌血清标志物临床应用专家共识解读

    近年来,甲状腺癌的临床发病率逐年上升,其风险评估和临床管理方法也随之发生变化且不断完善,这使得国内不同医疗机构在甲状腺癌的临床诊疗模式和疾病管理方面存在较大差异,尤其是甲状腺癌血清标志物的临床应用方面 ...

  • 商科毕业论文写作金融数据库推荐

    金融经济的毕业论文数据库质量是非常重要的.少加入一个参数,哪怕只是少打一个小数点,那结果也是相差十万八千里!最终的数据分析结果,可想而知,也会直接受到影响.因此,本期我们主要介绍的是金融学生在写毕业论 ...

  • 4月29日19:00丨精准检测,消除乙肝:血清标志物再认知

    乙型肝炎病毒(HBV)感染呈世界性流行,我国一般人群的感染率约5%-6%.包括血清学标志物.病毒学标志物在内的实验室检测是进行乙肝患者临床诊疗的重要依据. 以乙肝五项为代表的血清学标志物,不仅可以反映 ...

  • CellMarker:细胞标志物数据库

    我们都知道,细胞标志物是我们用来对细胞定义和分选的重要标志.当我们想查看某细胞的标志物时,不可能对所有细胞都进行测序分析,首先,经费就烧不起...... 所以,今天小编就给大家介绍一个特别优秀的数据库 ...

  • 名人数据库推荐企业家/首席设计师:张雄

        张雄 ,男,中国籍,中国共产党员,毕业于中央美术学院 设计系 留学于日本 .意大利.    松美 (北京)设计事务所   创始人   北京松美文化传播有限公司  创始人    北京松美艺术教育 ...

  • 乙型肝炎病毒血清标志物出现这六种结果如何解读

    对于乙肝的病原学诊断最初.也是最常用的是乙肝病毒血清标志物(HBVM)检测.HBVM 主要包括:两对半(HBsAg.HBsAb.HBeAg.HBeAb.HBcAb).HBxAg.HBxAb.前 S 抗 ...

  • ExoCarta:外泌体相关标志物数据库

    导语 外泌体(exosomes)是一类由细胞分泌的胞外囊泡结构,其内部包含有DNA,蛋白,脂类,RNA等信息.外泌体最早见于1981年, 科学家在体外培养的绵羊红细胞上清液中发现了有膜结构的小囊泡,并 ...

  • [数据库推荐]转录后调控预测

    基因在从DNA变成蛋白的过程当中受到很多的调控的影响.其中主要包括:基因水平.转录水平.转录后水平.翻译水平和翻译后水平的调控,这五个水平的调控.转录后调控:是真核细胞中,将初级转录RNA转化为成熟R ...

  • [数据库推荐]gene:基因相关信息查询

    我们在进行基因相关研究的时候,如果要研究一个基因,那么首先要知道这个基因的一些基本信息,检索基因相关的网站还是很多的.其中比较出名的还是genecards.一个汇总的了很多数据库的的综合性基因查询网站 ...