要如何选择一款合适的生物缓冲剂?
为实验选择合适的生物缓冲液(Tris,Mops,Hepes,Pipes等)可能很棘手,缓冲区选择过程就像玩“猜猜谁”。像游戏一样,一般来说,可以从非常广泛的缓冲区列表开始,然后慢慢地提出问题和研究答案以缩小选择范围。
在下文将给大家提供一些选择生物缓冲液的注意事项。
确定实验的pH:
在许多实验中,需要更改条件以使蛋白质在溶液中保持完美状态。举个例子,假设在pH 7.4的条件下进行了模拟生物条件的实验,但是蛋白质在此pH值下不稳定,因此需要优化这种情况。要注意的是,目标pH值通常离蛋白质等电点(pI)大约一个pH单位(有时稍远)。pI是给定的分子或蛋白质不带净电荷的pH值。当蛋白质达到其pI时,它的溶解度就不那么高。
考虑不必要的缓冲区交互:
决定使用哪个缓冲区的另一个重要步骤是确定是否存在负缓冲区交互。举个例子,如果正在使用一种酶,那么有机缓冲液可能会影响酶功能的好坏。
实验时需要考虑到的一些问题:
就像游戏一样,可以提出一些问题,以确保获得正确的缓冲。举个例子,1.溶液中是否存在可能于缓冲液络合的金属?2.目标蛋白是一种酶吗?它属于哪一类?3.配体结合,蛋白质稳定性或电泳的离子强度要求是什么?像这样的一些问题根据实验时的具体情况来提问并思考,将进一步帮助找到合适的生物缓冲液(Tris,Mops,Hepes等)
考虑下游实验时会有什么影响:
研究人员经常遇到的一个绊脚石是,他们将从缓冲区开始,并发现它不适用于下游应用程序。举个例子,已知Tris会对Bradford assay产生负面影响。其他生物缓冲液会对质谱产生负面影响。不幸的是,在执行前面2步之后,可能已经缩小了缓冲区的范围,只是发现它在将来可能无法很好地工作。这就像“猜猜谁”的噩梦般的版本。在这种情况下,必须进行一些研究以找到合适的替代方法。但是,既然已经缩小了所需的特征,那么进行这项研究就会容易一些。
寻找合适的缓冲区:
当知道要使用什么缓冲区时,就应该去采购缓冲区了。对于大多数研究人员而言,底价和纯度基本上是在哪里购买缓冲液的重要标准。当然,也可以去找大品牌的公司,那么将会获得合适的产品。但是,其价格也一定不会便宜。