肝经为什么叫厥阴，十二经命名有何意义，跟子午流注，四时，六气有关系吗？
传经之次第，由少阴而厥阴。厥，可以理解为“缺”“绝”，是阴气发展的最后阶段，开始重新向阳的方面转化过程，所以《素问·至贞要大论》称之为“两阴交尽”；厥阴为阴之尽，阴尽则阳生。厥阴含有阴尽阳生、阴中孕阳之意。其位置在少阴之后，所以《素问．阴阳离合论》又称'厥阴为阖'，是指其具有蕴蓄阴气的作用。
厥阴包括手厥阴心包和足厥阴肝，并分别与手少阳三焦和足少阳胆相表里。
足厥阴肝经面部循行是：起于大趾丛毛之际……，循喉咙之后，上入颃颡(鼻咽部)，连目系(眼球连于脑的组织)，上出额，与督脉会于巅。其支者，从目系下颊里，环唇内。
肝为厥阴之府，少阴自少阳、太阴传来，而复逆行上传于肝，且经中气化之相传至此，又复阴尽而阳生。
亥子丑寒极三时，是太阴所主，不是少阴所主，故阴尽阳生的厥阴生于太阴，不生于少阴。由此可知，厥阴的本义就是讲两阴交尽而地道阳气来复，这样阴阳气就顺接了，所以说厥阴主阳气。如果阴阳气不顺接，阳气不恢复，太阴脏寒不退，因为脾主四肢手足，就要发生手足厥冷了。所以厥热、厥冷是厥阴应有的病症。
并且， “厥”有“逆”的意思，不顺、逆乱。由于气机逆乱，导致阴阳寒热不调，上下表里不一，因此出现上热下寒、上寒下热、表热里寒、表寒里热、脏热腑寒，脏寒腑热等等寒热错杂之证；由于阴阳之气不相顺接而导致的气机升降失常，四肢逆冷等的一应病证，均可称之为“厥”，还有突然跌仆、不省人事为主的病证，也称之“厥”，所有的这些病证表现加起来，就是“厥阴”的本质病理属性。
因此，肝经称“厥阴”，是源于它的生理意义和病理意义。
本经有病时、主要有胸满、呕逆、腰痛、下痢，疝气、遗尿、小便不通、月经不调、子宫出血、口咽干燥、面色暗晦等症状和病症，以及在本经循行部位的局部症状。
十二经每一经的命名，也都是这样，根据其生理意义和病理意义决定的。
子午流注：
子午流注是以时间为条件，以“天人相应”的观点为总纲，结合了人体经络循行、气血周流灌注的原理以及阴阳、五行、天干、地支等学说而形成的。
其原理源于《内经》所记载的五输穴，如《灵枢》记载：“五脏五腧，五五二十五腧，六腑六腧，六六三十六腧”。五输穴都是从井开始，然后流入荥，注入输，行入经，汇入合，分别有出、流、注、过、行、入的不同，用以表示脉气的盛衰，这就是“流注”来历。
此理论认为，天人相应，自然界的变化必然引起人体的变化，因此发现其规律。一日之中，气血周流盛衰的时间，以十二经的六十六穴为主，规定了每一日、时经穴的开闭及针治最当的时机。在治疗时，重视日时寒温和经气盛衰的关系，所以可以用子午流注的针法包括推拿法来进行针对性的治疗调理。
以针法来说，首先是取穴，有纳甲法、纳子法、纳络开穴法、灵龟法。经穴在开时，气血当盛，如潮汐之涨；阖时气血衰退，如潮汐之退，并从阴经转入阳经或从阳经转入阴经。气血在周身的循环，先后盛衰不同，有规律地相互交错地流注着。例如丑时阳生，正对应肝之厥阴“阴尽阳复”的本质。所以子午流注发可以用来治疗厥阴肝经之病。或者说，子午流注的公式，套用在包括厥阴肝经在内的十二级都是有效的。
六气：
《素问·天元纪大论》说：“厥阴之上，风气主之。”或云：“厥阴之上，风气治之。”厥阴为标，风气为本。可知厥阴是以风为本气，自然也是与五运六气有关系的。
四时、五运、六气，都如此理。肝系统的生理是主春温而生阳气，厥阴的一切生理功能都来自于阳气的生发。《素问·生气通天论》说：“阳气者，精则养神，柔则养筋。”初生之阳主升，阳生则阴长，而柔筋养神。既养心神，又养筋脉。
风性为阳，《素问·阴阳应象大论》说“东方生风”，东方是日出的地方，即阳气生的地方，这与厥阴的本质“阴尽阳复”也是吻合的。
厥阴的一切病理都来自于阳气变化，由生理可以逆推病理。厥阴从中气少阳相火，阳春肝木生太阳夏热心火，这是生理。伤寒传至厥阴，阳气受伤，这是病理。所以，厥阴病本证，一是本气风火太过为病，二是厥阴标气不及为病，三是阴阳不相顺接为病，这就是六气在厥阴肝经病理属性上的表现。