给癌细胞建“族谱”,CRISPR新技术窥探癌症扩散迷雾 | Science

你翻过自家的 “族谱” 吗?就是那本厚厚的,记载了自己祖辈繁衍和迁徙等信息的书。
癌细胞,也是 “繁衍和迁徙” 的小能手,这可太头疼了,因为癌细胞的一次迁徙,就意味癌症的一次扩散。更头疼的是,它们还没有 “族谱” 可以查,这也使得研究癌症扩散,仍是迷雾重重。
近日,就有研究人员利用基于 CRISPR 开发的新技术,为癌细胞创造 “族谱”,用以窥探癌症扩散背后的迷雾。这项研究成果,目前已经发表在了 Science 上。
具体来说,这个 “族谱” 就是癌细胞在分裂和转移的过程中产生的谱系,研究人员通过这个谱系,就可以溯源癌细胞在体内的分裂和扩散过程。
通过对 “族谱” 的研究,研究人员还发现了一些非常关键的信息,比如:同一癌细胞系中细胞,他们的转移能力,其实不尽相同,有些会扎根生长,有些则是四处漂泊。
记录谱系?转移能力不同?具体如何,让我们来详细看一下这项研究。
如何创造癌细胞的 “族谱”?
创造 “族谱” 的过程,简单理解就是:研究人员往癌细胞内部导入了一个记录器,这个记录器能够在癌细胞的每一代内部留下不同的痕迹,最后通过这些不同痕迹,就可以整理出谱系。
而这个记录器,就是 “基因剪刀” CRISPR/Cas 9
图丨 CRISPR/Cas9 切割示意图(来源:Wiki)
CRSIPR/Cas9 分为两个部分,负责剪切的 Cas9 蛋白和负责引导到目标位置的 gRNA,而且,Cas9 蛋白只有和 gRNA 结合后,才能拥有剪切能力。
也是基于这个原理,研究人员在癌细胞基因组中,进行了一番独特的设计:分别引入了 Cas9 蛋白、一系列 gRNA 以及 gRNA 所引导的切割位点
图丨 Cas9 切割基因组留下 “痕迹”(来源:Science
于是,随着癌细胞的分裂,自身分泌出的 Cas9 蛋白会在 gRNA 引导下去切割自身基因组中的特定位点,被切割的细胞,就这样受伤了。
之后,受伤的细胞会对伤口进行自我修复,这个修复过程中,会随机补入或删除一些核苷酸序列,而这个不一样的序列,就是每一代细胞中独特的 “痕迹”。
图丨切割前后对比(来源:Nature
因为是随机的,所以可以保证每一代之间的 “痕迹” 的不同。并且最关键的是,这个痕迹是累加的,即上一代的 “痕迹” 是会留存到下一代,同时下一代又会多出不一样的 “痕迹”。
图丨不同转移性的代际繁衍(来源:Science
最终,分裂多代之后的各个细胞中,就有着不一样的痕迹,而且这些痕迹还能够判断他们是从哪一代开始分裂出来的,癌细胞的 “族谱” 也就此产生。
癌症扩散的新发现
除了记录器外,研究人员还往癌细胞基因组中引入了荧光标签。这些标签,能够让研究人员在体外就能观测到体内癌细胞的扩散过程。
在各项改造完成后,研究人员把这类拥有记录器的癌细胞,移植到了小鼠的肺中。
图丨癌细胞丛肺部开始扩散(来源:Science
在扫描图像中,我们看到了这样的一幅景象:一开始,荧光聚集在小鼠心脏附近,像是一颗嵌入钻石;两周后,一个光三角在小鼠体内慢慢展开,越来越大;最终,蔓延到了各个器官。
图丨小鼠扫描图像(来源:Science
第 54 天后,研究人员便将小鼠杀死,分别取出身体各个部位的癌细胞,进行了全基因组测序,这一步,就是对癌细胞的扩散 “族谱” 进行解码。
解码之后,研究人员发现了一些新的现象。首先发现的是:即使来自同一个细胞系,但是其中的不同细胞,转移能力不尽相同的。
有些细胞及其后代,都一直呆在一个组织里,而有一些细胞及其后代,则表现出了高转移性,在多个组织均有发现。在同一个细胞系中的细胞,出现了异质性
图丨不同转移性癌细胞的谱系,颜色越杂表示转移越频繁(来源:Science
此外,对于 “族谱” 的进一步详细分析,还发现了癌细胞的转移特征:癌细胞第一次转移,多从左肺发生,之后会扩散到某些特定组织,如纵隔淋巴组织,之后再转移到别的地方。这个纵隔淋巴组织,就像是一个 “交通枢纽”。
对此,研究的第一作者杰弗里・奎因(Jeffrey Quinn)表示:“它就像一个中转站,把癌细胞连接到这片肥沃的土地上,然后它们就可以去那里殖民。”
启示和展望
这一项研究观测到了癌症的转移,同时带来了一些非常关键的新线索。
首先是同一细胞系中产生不同的转移性的原因,这是研究人员非常好奇的。科学家们想知道是什么原因导致了这种差异。
因此,他们开始寻找非转移性肿瘤、弱转移性肿瘤和高转移性肿瘤之间表达基因的不同之处。这,对于指导治疗癌症的目标基因选择上,有着重要意义。
其次,就是癌症转移特征,这个是非常有用的信息。发现这样的转移 “枢纽”,代表在治疗上能够采取更有效、更直接的干预。
研究的通讯作者维斯曼(Weissman)说:“如果你把癌症治疗集中在这些地方,那么你就可以减缓转移或者更早地阻止它。”
图丨本研究的通讯作者:Jonathan S. Weissman(来源:MIT)
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