QM 魔法小课堂——第二十五章 评估反应活性的简单方法—LUMO和HOMO的能量差

如图1所示,分别计算三氯异氰脲酸、二氯海因和NCS的LUMO轨道和能量。这些试剂的LUMO lobes均分布在氯原子上,而不是在C=O碳上,所以他们是卤化试剂,而不是酰化试剂。三氯异氰脲酸的LUMO能量为-0.79 eV,二氯海因为0.37 eV,NCS为1.09 eV。活性最高的三氯异氰脲酸LUMO能量最低,活性相对较低的二氯海因LUMO能量增加,活性最低的NCS有最高的LUMO能量。根据这三个试剂的计算结果和实验观察到的反应活性,我们可以总结出一个大概的规律:LUMO能量越低,反应活性也就越强,LUMO能量可以用来衡量卤化试剂的活性。
利用HOMO和LUMO的能量差评估反应活性

为什么LUMO能量可以衡量反应活性呢?余志祥小组给出了其中的理论解答[1]。如图2所示,他们从前线轨道理论 (FMO) 出发,结合过渡态理论中的Eyring方程,推导出Mayr方程和FMO理论在原理上是一致的。当在比较一系列分子的反应活性时,如果影响这些分子的反应性主要是由于不同取代基的电子效应所引起的,那么,一个分子的亲核性和该分子的最高占据轨道HOMO相关,而亲电性则与该分子的最低空轨道LUMO相关。也就是说可以通过HOMO能量和LUMO能量评估底物的亲核性和亲电性强弱,进一步通过HOMO和LUMO的能量差来判断反应活性。
接下来,我们就应用LUMO-HOMO能量差的方法来解释分子内Pictet-Spengler的反应趋势。
Pictet-Spengler 反应趋势与LUMO-HOMO能量差的关系

接下来保持亚胺部分不变,将吲哚环替换为其它芳环,并计算一系列亚胺中间体的LUMO和HOMO轨道的能量差 (计算数据见表1,结构见图4)。
表1. 不同骨架Pictet-Spengler反应亚胺中间体的LUMO和HOMO轨道能量差

如图4所示,随着LUMO和HOMO之间的能量差逐渐增大,需要更高的温度或者更强的酸才能发生环化反应[2]。当能量差超过约9 eV的阈值时,则无法让反应进行。


图5. 利用LUMO-HOMO 能量差预测不同底物的反应活性 (11+H+能量差由LUMO+1和HOMO-2计算,14 能量差由LUMO和HOMO-1计算,14+H+能量差由LUMO+2和HOMO-3计算)
对于含碱性氮的底物,我们在考虑能量差的同时,还要考虑底物的pKa,确定亚胺中间体是否质子化。
如图5所示,6-氮杂吲哚底物11,没有质子化时,LUMO-HOMO能量差为8.38 eV,处在可以发生反应的范围。但是,实际反应并不能发生,文献检索也找不到任何成功案例。这是因为在酸性反应体系中,吡啶氮原子质子化 (吡啶质子化pKa约为5.2),11+H+的LUMO-HOMO能量差高达10.11 eV。
团队想到一个巧妙的方法来解决这个问题:在N的邻位引入一个取代基,甲氧基或氯,来降低N原子的碱性 (2-MeO-和 2-Cl 吡啶的pKa分别是 3.2 和 0.7)[3],之后将取代基脱除。计算MeO取代底物12和Cl取代底物13的LUMO-HOMO能量差分别是7.93 eV和8.53 eV,均处在可以发生反应的范围内。我们决定首先尝试合成MeO产物,因为12的LUMO-HOMO能量差7.93 eV比9.09 eV的界限远多一点。实际合成中亦顺利得到了甲氧基取代的反应产物,随后将OMe转化为OTf,顺利脱除OTf得到6-氮杂吲哚产物[4]。
通过提前计算,苯并咪唑类底物14也会出现类似的问题,质子化14+H+的能量差高达10.09 eV,这就警示我们此路不通,要寻找其他方法啦[4]。
本章向大家介绍了利用LUMO和HOMO的能量差快速评估反应活性的方法。相对于计算过渡态,这种方法更加简便快捷,对于一些已经有大量反应实例的基础反应尤其适用。通过总结反应底物的HOMO和LUMO能量范围,就可以评估出新底物的反应活性。但是需要注意的是,这种方法仅适用于电子效应是反应活性主要影响因素的情况,如果有明显的空间效应则不适用。此外,还需要注意根据反应位点的轨道lobes可用性选择正确的轨道,可能会是HOMO-1和HOMO-2,LUMO+1和LUMO+2来计算相关能量。
小试牛刀


你会选择什么试剂去碘化1,2,3-三氟-4-硝基苯呢?卤化会发生在C-5位还是C-6位呢?
开动大脑,留言反馈,神秘大奖等着你!
参考文献
[1] L.G. Zhuo, W. Liao, Z.X. Yu, Asian J. Org. Chem. 2012, 1, 336.
[2] A. Yokoyama, T. Ohwada, K. Shudo, J. Org. Chem. 1999, 64, 611.
[3] https://www.chem.wisc.edu/areas/reich/pkatable/pKa_compilation-1-Williams.pdf
[4] M.K. Jackl, I. Kreituss, J.W. Bode, Org. Lett. 2016, 18, 1713.
[5] P. Bovonsombat, J. Leykajarakul, C. Khan, K. Pla-on, M.M. Krause, P. Khanthapura, R. Ali, N. Doowa, Tetrahedron Lett. 2009, 50, 2664.
[6] G.A. Olah, Q. Wang, G. Sandford, G.K. Surya Prakash, J. Org. Chem, 1993, 58, 3194.

第三章《利用静电势能图预测分子酸性强度》
第十七章《亲电卤代反应的区域选择性预测方法》
第十八章《HOMO/LUMO/相对能量/碳谱-QM计算综合应用》
第二十一章《不涉及量子力学的有机反应综述》
第二十二章《利用QM探究Menke Nitration的反应机理》
第二十四章《应用QM研究叠氮转移反应的机理》
关于药明康德药物研发国际服务部(IDSU)
IDSU(International Discovery Service Unit, 药物研发国际服务部)隶属于药明康德研究服务部。
IDSU愿景:
用我们FTE合成化学和药物化学平台为全球客户发现和发明小分子临床前候选药物提供全方位的服务和解决方案
IDSU目标:
平台:全球小分子新药发现和研究最高,最宽,和最深的FTE合成化学和药物化学能力和技术平台
入口:全球客户进入药明康德平台和生态系统的几大入口之一
赋能:加速及变革全球小分子新药研究和创新
IDSU拥有专业一流的研发团队,超过20年的合成化学和药物化学经验积淀,为全球小分子化学创新药物发现赋能。
IDSU除具备常规的合成化学和药物化学能力和技术,还拥有Oligo、PROTAC®、量子化学计算、电化学、光化学、催化剂筛选、酶催化、流体化学、发现工艺化学等全球领先的技术平台,以及计算机辅助药物设计、人工智能辅助有机合成路线设计等新技术研发,引领药物发现新趋势。
IDSU在上海、天津、武汉、南通、成都和美国旧金山都有国际一流的实验室,拥有完善的培训体系和良好的安全管控系统。
PROTAC® is a registered trademark of Arvinas Operations, Inc., and is used under license.
