INT J FOOD MICROBIOL | 16S rRNA高通量测序揭示浆水菜、酸菜的细菌群落及组成

推荐：江舜尧

编译：Frank

编辑：十九

南昌大学食品科学与技术国家重点实验室熊涛等人于2019年7月22日在International Journal of Food Microbiology发表题目为《Bacterial community and composition in Jiang-shui and Suan-cai revealed by high-throughput sequencing of 16S rRNA》的文章，该文章深入研究了传统浆水菜和酸菜的微生物组成和细菌特征，并证明微生物群落结构的差异性是浆水菜和酸菜各具特色的原因。

文章摘要

发酵蔬菜在许多文化中都具有悠久的历史，在我国华北地区浆水菜和酸菜最为著名。它们均通过天然乳酸发酵制作，但酸度、味道和风味等特点却有所差异，这主要是因为它们的发酵过程受特定细菌群落影响。因此，本研究中作者采用高通量测序技术对浆水菜和酸菜的菌群结构进行鉴定。随后，作者通过统计分析评估两者的细菌群落差异。厚壁菌门和变形菌门是浆水菜和酸菜中的优势菌门。乳杆菌属是浆水菜中的主要菌属，而乳杆菌属和片球菌属是酸菜中的主要菌属。在物种水平上，解淀粉乳杆菌，发酵乳杆菌和桥乳杆菌是浆水菜中的主要菌种，而小片球菌，棒状乳杆菌，戊糖乳杆菌和类短乳杆菌是酸菜中的优势菌种。这些结果表明，浆水菜和酸菜具有自己独特的细菌群落，并因此形成不同特点。此外，两种发酵蔬菜的细菌群落在不同位置有所不同。这项研究揭示了浆水菜和酸菜中的菌群组成，对我国发酵蔬菜的微生物种类有了更深刻的认知，并为浆水菜和酸菜的生产提供了指导。

文章中重要图片说明

图1 | 浆水菜与酸菜样品理化性质及多样性指数比较。

图2 | 稀疏曲线和物种累积曲线。

图3 | 在浆水菜和酸菜样品中细菌群落组成的相对丰富度。（A）为门水平。（B）为科水平。（C）为属水平。

图4 | 基于主成分1,2的UniFrac主坐标分析。（A）未加权。（B）加权。

图5 | （A）细菌群落热图分析。（B）多样本相似树。

图6 | 浆水菜和酸菜样本LEfSe分析。（A）微生物群结果柱状图，阈值为4。（B）反应浆水菜和酸菜微生物群丰度的进化分枝图。