Nature:构建出人类肺部细胞图谱,为治愈肺部疾病奠定基础
在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学的研究人员构建出人类肺部的细胞图谱,该细胞图谱突出了构成肺部不同部分的几十种细胞类型。相关研究结果于2020年11月18日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“A molecular cell atlas of the human lung from single-cell RNA sequencing”。在这篇论文中,他们描述了他们的研究工作(主要涉及单细胞RNA测序)以及他们在研究工作中了解到的一些关于肺部的事情。
图片来自CC0 Public Domain
为了构建肺部细胞图谱,这些研究人员从肺部的细支气管、支气管和肺泡区域收集了组织样本,以及相关的血液样本。每一个样本都被分解成其细胞成分,然后按类型进行分类:免疫细胞、上皮细胞、内皮细胞或基质细胞。
这些研究人员为大约75000个细胞生成了转录组。通过使用标志物,他们随后对这些细胞进行了聚类分析,揭示了58个不同的细胞群体。在这样做的过程中,他们能够生成91%的肺部细胞类型的表达谱,而且还发现了14种以前不为科学所知的肺部细胞类型。他们还发现了大约200种标志物,可以用来识别他们发现的未知肺部细胞类型。
这些研究人员发现,他们能够利用由此产生的细胞图谱来追踪肺部中的激素靶标。在这样做的过程中,他们发现,一些激素受体在肺部的不同部位广泛表达,而另一些激素受体则没有。作为这项次要工作的一部分,他们还确定了表达233个基因的区域,这些基因可以被致力于了解和治愈各种肺部疾病的科学家们所利用。
这些研究人员还利用他们的细胞图谱来比较人类和小鼠的肺部。他们发现,小鼠缺乏大约30%的人类肺细胞类型,而人类缺乏约5%的小鼠肺细胞类型。他们认为,这一发现表明早期哺乳动物物种的多样化程度可能比之前认为的要高。
这些研究人员建议,该细胞图谱可供广大医学工作者使用,并指出它为不同类型肺部细胞的调节、相互作用和功能提供了新的见解。(生物谷 Bioon.com)
参考资料:
1.Kyle J. Travaglini et al. A molecular cell atlas of the human lung from single-cell RNA sequencing. Nature, 2020, doi:10.1038/s41586-020-2922-4.
2.Stanford team creates cellular atlas of the human lung
https://medicalxpress.com/news/2020-11-stanford-team-cellular-atlas-human.html