亦友亦敌话病毒——新冠状病毒她们的起源、足迹、分布和传播(1)
本期要点
1、什么是病毒?
2、它们起源在哪里,分布在哪里?
什么是病毒
病毒,“病”和“毒”,我们人类对这两个字是恐惧的,这个名字代表了我们敌对的状态。但是它从哪儿来的?
病毒的英文名字叫virus,它真正的名字是来自拉丁文。过去医生都是用拉丁文来写处方的,其中一个目的就是表现出医生非常有学问,而且医生开的处方一般病人也看不懂。在中世纪的时候,这个拉丁文virus代表的是一种可以传播疾病的毒素。说什么东西有毒,我们就说它是virus。
之后,显微镜、光学显微镜发明了以后,发现还有一些微生物存在,这些微生物我们命名为细菌。科学家用了一个网,它的大小约为200纳米左右,进行了过滤,把细菌过滤掉了,但是留下来的液体仍然有毒性,而且可以传染,可以传播,特别是可以传染活的细胞,剩下的这些物质就被命名为病毒了。但是我们仍然看不见它,直到电子显微镜的出现,我们才知道原来还有一种微生物,它实际上是一种颗粒。
病毒的定义:一组可传染的、拥有遗传物质的、依赖于细胞的一种寄生物,它常常被蛋白包裹,有时有膜,通常它是以颗粒存在的。平常,它以静止的颗粒存在,进入细胞以后,它就表现出了活力,所以它到底是生命还是非生命是有争议的。科学界认为它是一种生命的边缘状态(edge of life)。
再让我们回顾下生命是怎么起源的,这一直是困扰科学家、学者的一个很重要的问题,有人说它是外星来的,有人说它是闪电在大气里合成的,但是比较可靠的科学依据是,宇宙大爆炸以后,各种物质聚集在地球上,其中在海底有碳、氧、氮、磷,而这些物质在一定的温度下,包括环境、酸碱度以及一些放射物质的诱导下,在海底,在地壳变动中,偶然形成了一系列的分子,而这些分子是生命所必要的,比如形成了核苷酸,它连接起来以后形成了最初级的一个可复制、可传代的物质,就是RNA,而RNA协同周围的很多氨基酸,形成了蛋白,形成了酶之后,就形成了生命的现象。所以,极有可能生命是起源于这种遗传物质,而现在这种遗传物质就是携带在病毒这种颗粒体内的,也是现在地球上所有生命都具备的。从RNA变成了DNA后更稳定,之后形成了一系列的生命现象。
45亿年前,我们的地球形成了,那个时候是一个混沌的状态,整个太阳系还没有完全固化下来。但是地球在40亿年前出现了气候的变化,海洋形成,海就是孕育生命的一个大孵化器(incubator),越来越明确的证据证明,生命在那形成了,之后走上了陆地。地球上最早的生命痕迹是38亿年前,在澳大利亚发现了岩石上的生命迹象,它已经形成了细胞的结构,包含了遗传物质,再加上遗传所需要的一套配套的整个体系,包裹在一个包膜下。它大小是多少呢?细菌和细胞约是微米大小。如果把毫米分成1000份,每份就是一个微米,而微米再分1000份就是纳米,而病毒是多大呢?病毒体在几十纳米到一个微米之间,而细菌是快到一个微米到几个微米之内,所以显微镜可以看到它。
我们的生命是依据于遗传物质的,而遗传物质肯定是在生命细胞的单体之前就存在,科学家在找证据来证明生命起源于RNA。而病毒就是一种可进入细胞寄生、复制的RNA/DNA颗粒,它存在于整个世界,数量是我们全部生命现象的10倍以上,它在水里有1030之多,一勺海水就有200万个病毒颗粒,一升水里的病毒数量就超过我们人类的数量。
水里有一种噬菌体(phage),它有尾巴,通过扎在细胞上,可以把遗传物质输入到细胞里面去进行复制。这样的噬菌体头尾相连有多长?是1亿光年。地球上,HIV这种逆转录病毒在人类的身体里有多少?1016之多,是按照3700万病毒携带者来计算的,这是非常可观的数据。所以,病毒在我们整个的地球上,对生物的均衡,以及生态的平衡,起到非常关键的作用,它无处不在,在我们每吸入一口空气的时候,就有很多病毒进入,在我们吃一次蔬菜色拉的时候,就有几十亿个病毒通过口腔进入肠道,最后从粪便排出去,而且有很多病毒是跟我们共生存的,比如多瘤病毒,在我们每次小便的时候都有几十万/几万个这种病毒排泄出去。
科学家已经证明,我们体内的基因,有8.3%左右的染色体DNA碱基是从逆转录病毒来的。逆转录病毒可以整合到我们的DNA内,沉睡在那,一旦有机会就可以复制,但是好在这部分沉睡在我们基因里的病毒遗传物质是静止的。在我们体内,每个细胞都有31亿个碱基对,其中8.3%是病毒留给我们的痕迹,而且年代非常久远,是在我们人类的祖先形成之前,病毒已经进入到我们体内。所以,病毒和外界的环境是促进我们成为今天的我们的一个很关键的因素,它在很多的关键点上,是让我们更适应环境,让我们出现了一些关键的突变,把它的基因嵌合进了我们的基因组中。我们的身体其实清除不了这些病毒的,它们跟我们已经长期共存了,比如说疱疹病毒,在我们身体里有十几种疱疹病毒,你得了一次水痘,那个病毒也沉睡在我们的神经根上,EB病毒、多瘤病毒、巨细胞病毒,这一系列病毒在平常跟我们都是相安无事的,但是如果我们的抵抗力降低,它就会冒出来了。我在这所讲的意思是病毒在我们的环境中无处不在,特别是海水中。在我们身体里也是无处不在,皮肤、大脑、神经、血管、内脏,全部都和病毒是共同生存的。所以,我们叫它病毒,其实是不公平的,实际上它是一种有生命边缘迹象的颗粒,我们跟它是共生存的。
病毒可能是地球上所有生命的祖先,它的起源非常早,它散布于环境中和人类的体内,我们和它共生存,而且在人类的基因中有它的痕迹。
参考文献:
1.Nature 2016;537:500-501
2.Science 2008;319:1100-1104
3.Lancet 2020 https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30251-8
4.Lancet 2020 https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)30183-5
5.ChinaXiv:202002.00033v2
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