非肿瘤7分纯生信,2个月接收
最近有一些朋友问起非肿瘤纯生信文章能不能做?其实肿瘤分析的内容和方法相比非肿瘤分析,算是超前的。告诉
今天分享的这篇文章,是上个月发表在frontiers in immunology上的文章,关于COPD(慢性阻塞性肺疾病)。2月22投稿,4月26接收,速度很快了。
发表杂志:frontiers in immunology
影响因子: 5.085 即时影响因子:7.3
研究背景
慢性阻塞性肺疾病(COPD)是一种复杂而持久的肺部疾病,每年全世界有超过300万人死亡。尽管综合治疗和预防急性加重在过去几十年中取得了进展,但在改善疾病进展或降低死亡率方面的治疗进展仍然很少。因此,有必要更好地了解复杂的疾病机制,探索更好的生物标志物来评估和监测疾病的风险和预后。
运动耐量受损是慢性阻塞性肺病的临床特征之一,导致疾病进展并增加患者死亡率。因此,有必要对运动耐力进行有效的评估和监测。6分钟步行测试(6MWT)是一种可靠且广泛使用的运动能力测量方法。6MWT需要合适的场地和专业培训。但由于需要合适的场地和专业的培训,在基层医疗机构推广难度较大。建立一种准确、简便、可在医疗机构中进行的筛查方法是非常重要的。
结果部分
Figure 1 COAD患者和正常人之间的差异分析和富集分析
Figure 2 COPD患者的免疫分析
包括COPD组和对照组22种免疫细胞浸润水平的差异分析
FVC%和FEV1/FVC分别于免疫细胞浸润水平的相关性
Figure 3 对COPD患者进行WGCNA分析,寻找于临床特性相关的基因模块
Figure 4 使用WGCNA筛选出的基因于差异基因做交集,筛选出10个关键基因,并使用另外连个GEO数据集验证这些基因的表达
Figure 5
作者选定了PLA2G7并展示了该基因于COPD患者临床特征的相关性(A),该基因的富集分析(B),该基因于免疫细胞浸润的相关性(C),该基因在其他数据库种的表达情况(D-E)
Figure 6 作者使用了自己收集的标本,验证该基因所编码的蛋白Lp-PLA2与COPD患者临床特征的相关性
Figure 7 构建列线图模型预测COPD患者的运动耐量受损指标
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