如何从零开始拆解一篇肿瘤生信文章，并化为己用

上次笔者大概讲解了一些生信文章中常见的图片类型（收藏！举一反百的通路图解读法）。

那么，今天笔者就以一篇 SCI 文章为例，带各位小可爱看一看怎么才能更快 GET 一篇近期发表的生信分析文章中主要讲了些什么，以及我们该如何学习大佬的思路并化为己用。

今天，用来举例的这篇文章是发表在 International Journal of Molecular Sciences 的A Comprehensive Bioinformatics Analysis of UBE2C in Cancers（DOI：10.3390/ijms20092228），影响因子在 4.5，是纯生信文章中还不错的分数辣。

至于为什么又是肿瘤？别问，问就是肿瘤撑起了生信分析文章的四分之三壁江山。

当然，在读文章和读图之前我们还是要对文章进行一个概念化的认识。通过大致阅读摘要，我们可以获知：

UBE2C 是一种泛素化的共轭酶，作者通过两个数据库——TCGA 和 GTEx，发现这个酶的表达和肿瘤的不良预后相关，并且筛选出了一些之前不太有研究的、和 UBE2C 相关的一些基因靶点。

在这里笔者提出一个小建议，各位小可爱不妨在读完摘要后，代入自身视角先思考一下：

如果是你们进行这项研究，会通过哪几部分结果，用什么样的分析方法来验证并且得出摘要中所提出的结论。然后，再带着思路去阅读文章，对比作者是怎么样证明的。

这个小技巧非常有助于科研思维和逻辑的培养，对以后做实验和写文章都很有帮助。

比如这篇文章，我们至少可以提出以下三个推断：

1）UBE2C 在肿瘤中存在差异性表达（表达量统计学分析）；

2）UBE2C 的差异性表达会影响肿瘤的预后（生存分析）；

3）与 UBE2C 表达变化的上下游相关基因和他们的生物过程（蛋白互作分析，富集分析）；

图 4（来源：文献图 3）