将Dicom格式转换为Nifti文件-方法1

将Dicom格式转换为Nifti文件-方法1

我们要做影像资料后处理分析,需要最常用到的软件是freesurfer、3D Slicer、spm12,但是他们不能直接处理标准dicom格式的文件,因此我们需要把dicom文件转换成NIFTI格式(analyze格式)。有多种方法可以将Dicom格式转换为Nifti文件,今天为大家介绍一种比较简单的方法。PET,MR,CT等数据都可以用这种方法处理。

一、程序准备:

  • 需要软件:MRICRON

  • 下载地址: https://people.cas.sc.edu/rorden/mricron/index.html

  • 安装方法:解压后即可使用,无需安装

  • 注意事项:请选择与自己电脑操作系统对应的版本

二、操作方法:

  1. 准备好需要转换的dicom文件夹,

  2. 打开MRICRON文件夹下的dcm2niigui.exe程序,

  3. 将dicom文件夹拖入dcm2niigui界面,或者也可以把dicom文件夹下的一个图像拖入dcm2niigui界面,

  4. 几秒钟后即可获得Nifti格式的文件

  5. 如果文件夹里有多个序列的图像,软件会自动区分,生成多个Nifti文件

操作视频,请全屏观看

三、小提示:

  1. dcm2niigui.exe程序图示

  1. 建议大家选择SPM8这个nifti格式

  1. 如果是处理DTI文件,请选择FSL/SPM8这个nifti格式

  1. 程序可以设置输出nifit格式文件的文件名

  1. 若文件夹下包含多个dicom文件,也可以一起拖入,可以同时处理多个文件

  1. 转换完成后请务必确认图像无误


神经影像后处理内容即将上线,有兴趣的老师可以通过下面的方式进群

(0)

相关推荐

  • EPLAN~EDZ部件的导入

    我们知道制作一个宏,一个部件很麻烦,但是如果可以在网上下载或得到别人的部件,那么就相当省时省力了,而其中EDZ格式的部件是很常见的格式: 当EDZ文件里包含的部件很少时,EDZ文件很小,导入没什么问题 ...

  • 什么是DICOM?如何获取?为何对病情诊断至关重要?

    很多时候,我们在协助患者或家属整理病历资料时,都建议提供一份DICOM影像资料.但对于该资料,很多患者及家属表示没有听说过或了解甚少,下面,厚朴方舟为大家介绍下DICOM是什么,以及它对病情诊断的重要 ...

  • 图片(jpg,png,tif等)批量转dicom(dcm)格式

    简介 医学领域专用工具,千金难求,可以批量把jpg.png.bmp.tif图片转换为dicom(dcm)格式,并且保持原有顺序,同时支持嵌入部分重要的dicom元数据,比如:病人姓名,病人生日等. 将 ...

  • 如何将DICOM格式类型显示出来,利用MATLAB时

    今天准备用MATLAB处理一下核磁图像,按照MATLAB对图像的读取,必须要正确描述图像的名称和文件类型.之前也处理过,图像从西门子磁共振上导出来的,传到自己的电脑上可以正常显示图像的文件类型,但这次 ...

  • Python中利用SimpleITK读取DICOM文件 - 简书

    Williamongh关注 0.122018.08.20 10:43:53字数 90阅读 8,297 有帮助的话请点赞收藏,谢谢 当同一文件夹下有多个DICOM序列时: import osimport ...

  • 将Dicom格式转换为Nifti文件-方法2

    将Dicom格式转换为Nifti文件-方法2 我们要做影像资料后处理分析,需要最常用到的软件是freesurfer.3D Slicer.spm12,但是他们不能直接处理标准dicom格式的文件,因此我 ...

  • webm格式转换mp4文件方法分享

    视频格式有很多种,很多朋友就只认识mp4格式,确实这种格式是我们日常中比较常见与用得比较多的一种格式.而接下来的分享,小编会带大家认识其他视频格式.本篇文章,就先带大家认识webm格式与webm格式怎 ...

  • Python安装tar.gz格式文件方法小结

    目前就职的公司对网络管控比较严,所以在使用Python第三方库时比较头疼 -- 不能够在线安装. 昨天总结了Windows下安装.whl文件方式,传送门:https://www.cnblogs.com ...

  • 3种简单有效的将PPTX文件转换为PPT文件的方法

    PowerPoint 2007或以上版本可以打开以前任意版本中的格式文件,而早期的PowerPoint 2003或更早的版本是无法打开PowerPoint 2007或以上版本生成的PPTX的格式.如果 ...

  • TF之VGG系列:利用预先编制好的脚本data_convert .py文件将图片格式转换为tfrecord 格式

    TF之VGG系列:利用预先编制好的脚本data_convert .py文件将图片格式转换为tfrecord 格式 转换代码 python data_convert2tfrecord.py -t pic ...

  • 利用eps格式将AI文件转换为CorelDRAW文件(一)

    发布时间:2017/02/04 Illustrator和CorelDRAW是学平面设计必须会使用的矢量绘图软件,都可应用于出版.矢量插画绘图,广泛应用于印刷出版.海报书籍排版.多媒体图像处理.专业插画 ...

  • 推荐一款打开DICOM格式图像的软件(一)

    推荐一款打开DICOM格式图像的软件(一)

  • m4v如何转换成mp4?视频格式转换的实用方法操作

    视频的格式是有很多种的,他们彼此之间是有着不同的权限限制,就好比m4v这种视频格式,它是一个标准视频文件格式,由苹果公司创造.这种格式的视频是只能在iPhone.iPad以及iOS设备上所使用,像安卓 ...

  • 使用ABBYY 15将PDF文档转换为epub文件

    epub文件是一种应用范围很广的电子书文件格式,相信喜欢阅读电子书的朋友不会对其感到陌生.epub文件可适应不同的屏幕大小,相比于PDF文档,更适合用于移动阅读设备. 那么,怎么才能将PDF文档转换为 ...