【药物发现】一文速览已实现PROTAC诱导降解的靶标

PROTAC 技术(蛋白靶向降解嵌合体技术)通过泛素-蛋白酶系统(Ubiquitin-proteasome system, UPS)诱导靶向蛋白降解,正成为一种新型治疗技术,相比于传统小分子抑制策略具有巨大的潜在优势。在过去的几年中,PROTAC技术取得了长足的进步,两项PROTAC已进入I期临床试验。然而,由于当前对诱导靶标降解关键过程的研究尚处相对早期阶段,PROTAC的发现和优化仍然效率低下。

学习已经实现PROTAC诱导降解的靶标及分子特征,将对PROTAC的发现和优化有重要促进作用。本文将笔者长期积累的当前公开的PROTAC靶标信息分享给读者(数据截止2021年2月15日)。当前公开报道的实验数据集成有2项工作,为大家汇集了详细的实验,如下:

(一)2020年10月3日,浙江大学侯廷军教授课题组创建了首个基于 Web 的PROTAC数据库PROTAC-DB,PROTAC-DB集成了 PROTAC 的结构信息和实验数据包括 1662个PROTAC,202个binder,65个E3配体和 806个Linker,以及它们的化学结构,生物学活性和理化特性(图1),数据库网站:http://cadd.zju.edu.cn/protacdb/
图1. PROTAC数据库PROTAC-DB(Nucleic Acids Res. 2021)。

(二)2020年12月10日, Eric S. Fischer教授等人在Cell发表了他们对激酶组大规模的实验数据,公开了PROTAC实现诱导降解超过170个激酶靶标(表1)。
上述两项工作,极大地方便了应用PROTAC技术的从业人员,作为补充,下文表2 呈现了笔者整理的,除激酶靶标之外PROTAC实现诱导降解的靶标信息。

数据来源:

1) PubMed检索"PROTAC" /"degradation" /"degrader" /"degron";
2)欧洲专利局分别检索上述关键词;
3)人工阅读整理。
特点
1)     相对全面、准确的归纳了当前PROTAC实现降解的靶标信息。
2)     直观展现蛋白组已经成功的靶标;
3)     除了期刊文献,特整理了专利文献公开的靶标信息
 
注意事项:表2数据均为人工整理,可能不全,仅供参考(查验方法:上述靶标+相应关键词检索)!
敬请期待后续《公开报道PROTAC未能实现诱导降解的靶标集锦》。

参考文献:

1)Gaoqi Weng et.al., PROTAC-DB: an online database of PROTACs. Nucleic Acids Res. 2021 Jan8;49(D1):D1381-D1387. doi: 10.1093/nar/gkaa807.

2) Katherine A Donovan et.al., Mapping the Degradable Kinome Provides a Resource for Expedited Degrader Development. Cell. 2020 Dec 10; 183(6):1714-1731.e10. doi: 10.1016/j.cell.2020.10.038.

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