GDCRNATools内置的gdc-client不好用

学徒已经陆续出师，是时候把生信技能树的舞台交给后辈了！

下面是赵婧的分享

TCGA 数据下载

今天听完生信技能树的TCGA课程后，尝试完成课程作业，通过GDCRNATools下载TCGA数据的时候出现了以下的报错：

最开始我还以为是我的网络不好，折腾半天无果，便到群里向小伙伴求助。然后小洁老师@小洁忘了怎么分身 热心的指了一条明路——那就是这个包已经过期了，需要去官网下载gdc-client。那我们就动起来吧！

gdc-client软件安装和配置

  1. 下载软件地址：https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool，根据自己的操作系统下载对应的版本，这里下载Mac版本。

  3. 将下载的软件解压，并放在一个自己好找的目录，例如我放在了Documents/TCGA数据下载中

下载数据

  1. 在GDC官网：https://portal.gdc.cancer.gov 中找到自己所需要的数据，比如HNSC的miRNA数据。然后下载Manifest到刚刚软件放置的目录
  2. 先点击Exploration，然后在左侧选取需要的癌症类型和项目，选好后点击View Files in Repository
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