安捷伦样本质控护卫舰已就位,全力护航第四届全国NGS建库及创新大赛
随着新的《医疗器械监督管理条例》正式实施,为了适应NGS实验室和实验室自建方案的实验人员要求,上海市临床检验中心和上海市遗传学会共同主办,长三角罕见病实验诊断协作中心、上海市实验医学研究院和国家卫健委出生缺陷与生殖健康重点实验室协办的“2021年新一代测序技术培训班暨第四届全国NGS建库及创新大赛”将分别于2021年9月24-25日对医疗机构实验室操作人员进行理论培训,9月26日-29日进行实操培训。
自动化质控篇
安捷伦在核酸样品质控方面拥有全球领先的地位,其RIN值(RNA Integrity number)是安捷伦特有的专利保护的RNA完整性参数,至今引用已超过六万次。全球绝大多数的生物样本库、芯片用户和二代测序用户使用RIN来对RNA进行质控,RIN是行业内公认的RNA质控金标准。继RIN值之后,安捷伦公司又推出了DNA质控的利器DIN值(DNA Integrity number),基于独特的算法,DIN得以帮助研究者轻松地对基因组DNA(gDNA)的完整性进行数字化的质量评估,便于测试结果的记录、保存以及比对。DIN值可广泛应用于需要对基因组DNA进行质控的应用,如生物样本库、二代测序等。
文库制备是NGS工作流程中的关键步骤,不仅耗时费力且成本较高。对制备过程中间步骤的起始样品,以及对测序之前的最终文库进行质量控制(QC),可识别质量较差或浓度不足的样品,确保获得成功的序列数据,有助于节省时间和资源。样品质量信息还可帮助排除故障或优化文库制备方案。安捷伦自动化电泳产品系列提供了多种用于核酸QC分析的仪器,包括生物分析仪系统、片段分析仪系统、TapeStation系统和Femto Pulse系统。自动化电泳仪非常适合在整个NGS文库制备过程中测定样品的分子量大小、浓度和摩尔浓度,已在科学文献中广为引用。
安捷伦鼎立赞助此次建库大赛,无论是手动建库还是自动建库环节,都将使用安捷伦核酸分析系统TapeStation进行自动化质控。
自动化建库篇
SureSelect人全外显子V8提供了全面的内容和对RefSeq、CCDS 和GENCODE蛋白质编码区域的最全面覆盖。它还涵盖了TERT启动子和市场上其他外显子组中忽略的难以捕获的外显子。得益于基于机器学习的探针设计和全新的生产工艺,SureSelect人全外显子V8凭借仅为41.6Mb的高效的端到端设计大小,覆盖了人类基因组35.1Mb的靶标区域。该试剂盒提供了出色的序列捕获性能,可实现高效且经济的外显子组测序。此外,该试剂盒通过大规模生产分装,可在数年内确保提供一致的结果。
SureSelect人全外显子V8与传统的SureSelect XT靶向序列捕获系统,以及新型的SureSelect XT HS2、SureSelect XT HS、SureSelect XT低起始量和 SureSelect QXT文库制备和靶向序列捕获系统兼容,支持快速的90分钟杂交方案和单日工作流程。V8外显子组工作流程支持自动化,可通过安捷伦自动化平台实现完全无人值守的运行,也可与MGI自动化平台兼容,实现高通量样品前处理。使用Alissa Interpret可轻松分析测序数据,实现高效的变异解析和报告,提供了端到端的外显子组测序解决方案。
由华大智造携手上海市遗传学会共同发起的全国第二届自动化建库大赛已正式启动!此次安捷伦将携最新SureSelect人全外显子V8亮相建库大赛,匹配MGI自动化建库仪器,欢迎报名体验!
期待大家在参加比赛的同时,自由感受高科技、智能化仪器所带来的快速、简单、高性能的震撼体验。