m6A-meRIP-seq结果解读（四）

②生物信息分析流程

（1）数据质控；

（2）peak鉴定（peak calling）及diff peak分析：基于m6A-seq（IP，抗体富集后获取的测序数据）和RNA-seq（input）测序数据进行peak鉴定；目前默认p<0.05为diff>

（4）motif分析；

（5）基因定量及差异分析：差异基因表达分析；

（6）diff peak和基因联合分析：可以同时查看diff peak和及其对应基因的表达水平，从而初步判断diff peak及其对应基因的上下调情况。