MIMIC专题 | MIMIC数据库的安装
本文作者为学号BH70058麻醉专业的樊桂波医生,小黑屋训练营的模范学员~
MIMIC数据库的安装主要有以下步骤:
下载和解压数据库(包含26个表格);
下载SQL文件;
postgreSQL安装;
SQL脚本安装;
1. 下载和解压数据库
2. 下载SQL文件
3. 安装postgreSQL
安装过程中数据安装位置的磁盘空间要至少90G的剩余空间,以免影响后期的使用。(注:建议选择10.14或9.6版本)
点击要安装的版本直接进行安装,软件安装位置可以随系统,数据安装建议安装的盘要留有足够,以免耽误后期使用。安装过程中需要设置密码(牢记),其他不需要动,安装完成最后一个界面取消选择,点击完成即可。
安装完成,可在电脑开始菜单中查看,如下安装成功。
4. SQL脚本安装
电脑的开始菜单里找到postgreSQL,找到这个shell打开。
然后按照官网的顺序开始输代码。别输错哦~ 输完一行记得后面加;号,然后回车执行代码。
出现如下界面,开始安装SQL语言命令,连接数据库
逐条粘贴以下代码,回车,出现postgres=#,光标闪烁才可粘贴下一条代码。
建立数据库链接。
与mimic数据库连接成功,接下来需要输入提取mimic数据表格的相关语言代码。指定文件夹就是所下载的mimic的26个.CSV文件表格位置。建议路径尽量短,以下存储路径仅供参考。按顺序输入每一条记录,然后回车,出现mimic=#_光标显示方可输入下一条。(注:安装下载数据路径时请不要着急,时间和网速与电脑系统有关,5到10个小时不等;增加索引大概需要2到3个小时;核查过程大概需要半个小时。安装时请合理安排时间。只要不出现报错命令,就不用管。静等即可。)
安装已提取好的数据代码,再次打开SQL shell(psql),回车直至出现用户口令界面,输入安装SQL时的密码(此处密码并不显示),继续回车。
出现以上界面时,逐条输入以下代码。注意事项同上。完成后关闭。
成功打开,可见Tables(44),安装完成。(下图片界面有更改,仅供参考)
安装完成后打开pgAdmin4,验证是否能够使用。
END
如果你也有值得分享的临床研究经验或
临床科研知识,任何与临床研究相关的稿件