肠企这两年 ｜派森诺：瞄准微生物检测，直击精准诊疗赛道
■ 这两年 | 10件大事
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2019 年 5 月 4 日至 6 日，派森诺作为赞助商，连续第二年参加“中国肠道大会”。
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2019 年 5 月，派森诺建立了邓子新院士工作站。
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2019 年 8 月，派森诺启动面向结直肠癌早筛领域的诺菌康®产品的 IVD 注册申报工作。
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2020 年 1 月，派森诺成功研发新冠核酸检测试剂盒，并获得欧盟 CE 认证。
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2020 年 5 月，全国首发基于 QIIME 2 分析流程的、行业领先的派森诺基因云®微生物组智能可视化分析平台。
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2020 年 6 月，派森诺医检所成为上海市卫健委指定的新冠核酸检测机构。
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2020 年 9 月，派森诺基因云进一步上线了真核有参转录组分析智能可视化平台。
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2020 年 10 月，派森诺医检所成为第三届中国国际进口博览会核酸检测指定合作单位，累计完成近 10 万例样本检测。
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2021 年 5 月，派森诺与因美纳（中国）科学器材有限公司在派森诺上海总部签署了合作备忘录，并举行了开机仪式。
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2019 年至 2021 年，派森诺作为赞助商，先后参加中国肠道大会、全国菌根学术研讨会、中国微生物学会学术年会等微生物学领域的国内盛会，并举办数十次线上/线下培训研讨会。
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2019 年 6 月，率先将 Illumina NovaSeq 最新测序系统应用于 PE250 微生物组扩增子测序业务，成为国内首家实现此项服务的企业。
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2019 年 9 月，率先推出以 QIIME 2 最新方法为内核的微生物组全流程分析服务，成功打造全国领先的“金牌产品”。
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2019 年 11 月，率先推广基于三代 PacBio Sequel II 测序技术的全长扩增子测序服务，并保持服务领先性和稳定性。
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2020 年 5 月，推出“派森诺基因云”，结合业内独家的 QIIME 2 最新全流程分析服务，基于阿里云，打造云端生物信息“一站式”交互分析和可视化平台，有效解决微生物组大数据解析、存储、传输等瓶颈问题。
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2020 年 10 月，基于最新的微生物组生物信息分析技术和方法，发布新一代宏基因组/宏转录组/宏病毒组分析流程。
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2019 年至 2021 年，国内外客户在 Blood、Nature Plants、Nature Communications、Microbiome、The ISME Journal 等杂志发表多项重要研究成果。
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2019 年至 2021 年，申请多项专利，包括鉴别结直肠癌的试剂盒、mNGS 法检测病原微生物的 DNA 文库构建方法、用于宏基因组测序数据的微生物物种与功能组成分析方法等。
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技术平台：
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“派森诺基因云” （https://www.genescloud.cn/）：派森诺基因云是专注于生物信息大数据分析与可视化服务的云平台。目前有云图汇、云分析、云学院三大板块，2020 年 5 月发布了国内首个基于 QIIME2 的微生物组全流程分析平台。
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结直肠癌早筛—诺菌康：结直肠癌患者中特定细菌丰度显著改变，或可作为疾病筛查、预后、治疗反应预测的生物标志物。
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病原微生物宏基因组检测（mNGS）—病原派：是基于新一代高通量测序技术和病原基因组学，专门针对临床感染病患的病原体进行全面、快速的鉴别诊断的产品。
问
派森诺的公司愿景是做微生物精准诊疗产品的领先者，能否为我们介绍几款派森诺最具代表性的微生物精准诊疗产品？贵公司如何看待微生物精准诊疗产品的发展前景？
答
人类感染性疾病几乎都与微生物相关，尤其是新冠疫情发生以后，关于感染性疾病的诊断、治疗和预防越来越受到了大家的关注。派森诺推出的病原微生物宏基因（mNGS）测序，作为一种不需培养的新型技术，可以深入快速鉴定感染病原体，相比传统培养方法拥有更高敏感性的同时又与“精准诊疗”的理念相契合。
临床医生在探寻可能的感染病原体过程中，往往会遇到未知及疑难感染病原体，或者由于检测技术受限，疑似感染病原体检测不到。而当下的临床辅助诊断方式与临床的迫切需求之间还存在着巨大的鸿沟。mNGS 技术在理论上能够满足临床的上述需求，现阶段已解决临床感染性疾病诊治的部分困难。
除此之外，mNGS 可以用于传染病预防，具有直接从临床样本中获的病原体传播线索的潜力。我们期望这种方法可以直接、快速、准确的从临床样本中鉴定临床相关病原体，进而指导临床治疗，预估治疗失败风险以及揭示可能的传播风险。
问
派森诺近年来也在积极布局结直肠癌早筛领域，目前进展如何？未来将如何进一步布局？
答
肠道微生态和肠道免疫决定着肠道稳态，也在某种程度上代表结直肠的环境因素，影响着结直肠癌的发生﹑发展。派森诺布局以肠道微生物为标志物的结直肠癌早筛检测服务，通过检测人体肠道微环境变化，可实现肠癌的早筛和超早筛，提高早期、I 期、II 期的生存率。
目前派森诺正在进行试剂盒的临床验证工作，主要利用了 PCR（荧光探针法）+胶体金的技术路线，同时提供肠道菌 DNA 和 FIT 双重检测，检测粪便样本中与肠癌发生有密切关系的多种致病菌和蛋白的分子指标。
从初步临床试验的结果上看，在多项指标上表现优秀，尤其是在进展期腺瘤这项评估癌变风险的重要因素上，特异性达到 92.6%，敏感性高达 92.9%，极有潜力成为建立和扩大结直肠癌筛查的重要工具。由于该项筛查基于粪便样本，简便易行，可以使得更多的受试者参与到结直肠癌筛查工作，为减少晚期癌症病例、降低治疗成本提供支撑。
问
基因测序在大健康领域的应用前景广阔，基因测序的与健康医学紧密相连。贵公司认为当前微生物组数据分析上存在的主要挑战是什么？应该如何应对？
答
目前微生物组研究规模越来越庞大，无论是样本量、数据量都在飞速扩展。同时，微生物组数据又具有典型的稀疏化的数据特性，因此，在如此海量的数据中，挖掘出与临床表型相关的微生物标志物（Biomarker）、或识别出与某种疾病发生发展密切相关的标志物种、标志基因功能，不仅需要非常专业的大数据分析算法，更需要计算机硬件的全力支持和不断提升。
在这基础上，微生物组的大数据挖掘也越来越倾向于借助于云端分析的技术，以更有效地利用计算资源，并且更方便地实现实时化、一键化的交互分析和数据可视化，从而有效解决生物大数据解析、存储、传输等瓶颈问题。
在这方面，派森诺倾力打造的云端生物信息“一站式”交互分析和可视化平台“基因云（https://www.genescloud.cn/）”，结合业内领先的微生物组 QIIME2 最新全流程分析服务，已成为微生物组大数据解析和可视化的有力武器。
（全文结束）