科研 | SETD2通过整合EZH2和AMPK信号通路来限制前列腺癌的转移(国人佳作)

编译:子涵,编辑:景行、江舜尧。

原创微文,欢迎转发转载。

导读

前列腺癌(PCa)仍然是全世界男性癌症死亡的主要原因。局部肿瘤患者预后良好,而转移患者5年生存期下降至30%。晚期PCa的标准治疗包括雄激素剥夺疗法,该方法能在最初抑制肿瘤,但是在去雄难治性前列腺癌(CRPC) 中复发。基因组和转录组学分析的顶点发现致癌基因和肿瘤抑制基因的改变,例如AR、PTEN、TP53以及RB1,以及异常活化的关键信号通路是PCa转移的驱动因子。组蛋白甲基转移酶(HMTs)和去甲基化酶导致PCa转移。HMT EZH2能够修饰抑制性的H3K27me3,使细胞获得侵袭性的特征。研究者发现H3K36组蛋白二甲基化转移酶WHSC1能够与Pten协同作用驱动PCa的转移。在哺乳动物中,SETD2是催化H3K36me3的主要甲基转移酶。SETD2介导的H3K36me3的水平与EZH2催化的H3K27me3的水平成反比。然而,尚不清楚这两种酶活性是否在分子上有关联。在本研究中研究者发现SETD2通过其底物EZH2延迟前列腺癌(PCa)转移,SETD2甲基化EZH2,从而促进EZH2降解。SETD2缺失会引起Polycomb抑制的染色质状态,进而使细胞能够获得转移性状。相反,携带无法甲基化的EZH2突变体或者与EZH2结合缺陷的SETD2突变体的小鼠会产生转移性PCa。此外,研究人员发现二甲双胍刺激的AMPK信号会影响FOXO3来刺激SETD2表达。总之,这些结果表明SETD2-EZH2信号轴整合了代谢和表观遗传信号,进而限制PCa的转移

论文ID

原名:SETD2 Restricts Prostate Cancer Metastasis by Integrating EZH2 and AMPK Signaling Pathways

译名:SETD2通过整合EZH2和AMPK信号通路来限制前列腺癌的转移

期刊:Cancer Cell

IF:26.602

发表时间:2020年9月

通讯作者:秦骏、江军、王晓明

通讯作者单位:中国科学院上海营养与健康研究所秦骏研究组、重庆军医大学大坪医院江军研究组、南京医科大学王晓明研究组

DOI号:10.1016/j.ccell.2020.05.022

实验设计

结果

1   SETD2对PCa具有重要的临床和功能意义

为了确定SETD2在PCa中的重要性,研究者比较了代表惰性肿瘤Pten-/-小鼠和转移PCa的Pten-/-; Trp53-/-小鼠前列腺裂解液中H3K36me3/SETD2以及H3K27me3/EZH2的水平,结果发现H3K27me3和EZH2的水平与小鼠肿瘤进展正相关,并且在转移肿瘤中的表达水平高于惰性肿瘤(图1A)。重要的是,SETD2/H3K36me3以及EZH2/H3K27me3在小鼠前列腺组织中是互斥的(图1A)。因此研究者致力于确定PCa中SETD2的临床相关性。qRT-PCR的实验证实SETD2在前列腺肿瘤中的表达降低。公共数据集分析发现SETD2在CRPC和NEPC中的表达进一步降低,侵袭性的PCa亚型倾向于转移。此外,研究者发现SETD2 mRNA水平与疾病复发负相关。为了拓展这一结果,研究者利用SETD2抗体在肿瘤组织芯片上进行了IHC染色,如图1B,SETD2低表达的患者具有更短的无复发生存期。具有较高格林森分数(GS)的患者SETD2的表达降低(图1C)。多变量分析也发现SETD2负载预后价值,不依赖于前列腺特异的抗原水平和GS值。总之,这些结果表明SETD2在限制PCa进程中的作用。

研究者接下来进行了类器官实验以确定SETD2的功能是否是细胞自发的方式。研究者从2个月大Pten-/-小鼠中分离得到管腔细胞,并且在Pten缺失类器官中利用病毒稳转的shRNA敲除SETD2。结果发现Setd2沉默提高了类器官形成的能力(图1D、E)。在Setd2不足的类器官中Ki67+增殖细胞,而不是CD8+管腔细胞或者P63+基底细胞,频率升高(图1F)。由于SETD2的表达在转移肿瘤中下调,研究者通过dCas9- GCN4-调节的CRISPR活化在Pten-/-; Trp53-/-类器官中过表达SETD2(图1G)。结果发现SETD2的表达使这一致死亚型类器官的形成受损(图1H)。这些结果表明SETD2在PCa中非常重要

图1. SETD2对PCa具有重要的临床和功能意义。(A)对小鼠前列腺裂解液中指定蛋白进行免疫印迹分析;(B)基于TMA中SETD2的表达进行IHC染色和Kaplan-Meier复发分析;(C)在TMA中依据GS值对SETD2的IHC分值分类;(D)对两个月大Pten-/-小鼠前列腺产生类器官中的SETD2进行IB分析;(E)对类器官形成的效率和到校进行成像和定量;(F)对特定部位进行免疫染色;(G)在两个月大Pten-/-; Trp53-/-类器官中过表达SETD2进行IB分析。(H)两个月大Pten-/-; Trp53-/-类器官中过表达SETD2进行类器官形成效率和大小的成像和定量分析;

2   Setd2与Pten协同缺失导致PCa转移

为了证实Setd2在体内的功能,Setd2floxed/floxed小鼠与前列腺上皮Probasin-Cre Setd2的小鼠交配。病理组织分析发现Setd2-/-动物畸形生长或者多灶性低级别前列腺瘤变(LGPIN)。Setd2-/-小鼠源系PIN病变呈筛状和/或管状结构组织。然而,在接下来的16个月,研究者并未检测到腺瘤的发展,表明只有Setd2缺失不足以驱动PCa。因此研究者将Setd2-/-小鼠与Ptenfloxed/floxed小鼠交配产生Pten+/-; Setd2-/-小鼠。所有Pten+/-; Setd2-/-小鼠15个月大部分死于膀胱出口梗阻(肾水肿),而Pten+/-小鼠存活超过20个月(图2A)。MRI成像发现相较于对照组,在8-至10-个月大的Pten+/-; Setd2-/-小鼠中平均前列腺肿瘤的体积大约5-至8-倍升高(图2B)。与8-10个月发展中LGPIN的Pten+/-小鼠相反,Setd2缺失导致高度前列腺上皮内瘤变的进展加快,在5-6月开始,8-10月发展为转移性肿瘤(图2C-E)。相应的,Ki67染色的增加表明Setd2缺失赋予了细胞增殖的优势。重要的是,Setd2缺失小鼠肿瘤周边平滑肌鞘明显受损,表明肿瘤发展为转移性的PCa(图2D)。因此,管腔来源的前列腺肿瘤细胞侵袭至基底。与此对应的,Setd2缺失的PCa在AR-或者CK8-阳性肿瘤结节中表现出广泛的转移范围,包括腰椎淋巴结、肺、肾脏、肝脏等(图2E)。此外,在8个月大Pten+/-; Setd2-/-小鼠外周血和远端器官也检测到Cre敲除的Pten或者Setd2重组等位基因,表明转移肿瘤的前列腺起源以及血管扩散(图2F)。总之,Setd2失活以及Pten缺失促进了PCa转移。

图2. Setd2与Pten协同缺失导致PCa转移。(A)Kaplan-Meier对Pten+/-以及Pten+/-; Setd2-/-小鼠的生存期进行分析;(B)MRI分析如图所示,定量的数据在右侧显示(n=6);(C)对组织学分级进行定量(n=10),**p < 0.01;(D)对特定时间前列腺SMAa进行H&E染色和IHC染色;(E)对8-10个月大Pten+/-; Setd2-/-小鼠组织进行H&E以及AR、CK8染色;(F)在特定组织中检测Cre敲除的Pten以及Setd2重组。

3   Setd2缺失诱导的PCa转移依赖于EZH2活性升高

为了探究Setd2缺失如何提高转移的特征,研究者对三个月大Pten+/-以及Pten+/-; Setd2-/-小鼠来源的类器官进行了转录组学分析,来鉴定早期的驱动事件。Setd2缺失导致492个基因受到抑制,且299个基因产生(图3A)。信号通路和基因集富集分析表明所有差异表达的基因在EZH2和H3K27me3信号显著富集。qRT-PCR分析也证实了Setd2缺失的类器官细胞中EZH2直接抑制靶基因的表达的确降低(图3B)。有趣的是,对小鼠前列腺和PCa细胞分析发现Setd2缺失导致EZH2和H3K27me3水平的升高,但是不影响EZH2 mRNA水平(图3C)。EZH2表达的升高在Setd2缺失小鼠正常前列腺管腔细胞中也检测到(图3C)。同样,研究者发现C4-2细胞中SETD2敲除(KD)能够显著稳定EZH2(图3D)。为了证实这一发现,研究者利用ChIP-seq分析了H3K27me3。在Setd2缺失的类器官细胞中检测到H3K27me3的信号升高(图3E)。图3F中基因组也说明在Setd2缺失细胞中EZH2靶基因Cdkn2a、Sox7的转录抑制伴随H3K27me3的水平升高。总之,这些结果表明SETD2缺失导致PCa细胞Polycomb抑制的染色质状态。

研究者猜想这些结果是否具有临床相关性。对免疫印迹结果定量发现高GS患者中H3K36me3 vs H3K27me3、SETD2 vs EZH2之间负相关。考虑到在转移性CRPC中EZH2的表达最高并且与神经内分泌亚型相关,研究者进一步分析发现在CRPC和NEPC患者中SETD2的表达与EZH2的特征负相关。研究者也进行了免疫染色实验对晚期PCa中的SETD2和EZH2进行描述,包括高GS的腺瘤、CRPC以及NEPC,结果发现这两个蛋白之间的负相关(图3G)。这些结果说明在PCa中存在敌对的表观机制剥夺EZH2。

为了确定Setd2缺失是否会通过EZH2上调促进前列腺癌的发生发展,研究者在Pten+/-类器官中敲除Setd2的同时敲除了EZH2。与之前的报道一致,Ezh2缺失并没有导致可识别的缺陷,可能是由于Pten+/-小鼠中EZH2水平很低。相反,在Pten+/-; Setd2-/-类器官中敲除Ezh2使Setd2缺失引起的过量生长受到削弱。EZH2最主要的功能是作为PRC2复合体的酶促亚单元催化H3K27me3。利用EED的变构抑制剂EED226或者EZH2甲基转移酶抑制剂GSK126处理导致Setd2不足类器官的生长减弱,同时伴随H3K27me3水平降低。研究者将Ezh2-floxed小鼠与Pten+/- ; Setd2-/-小鼠交配。尽管在Pten+/-; Ezh2-/-以及Pten+/-小鼠前列腺组织中没有显著差异,Pten+/-; Setd2-/-小鼠中Ezh2缺失减弱了前列腺癌的进展(图3H、3I)。重要的是,研究者整合RNA-seq数据发现Pten+/-; Setd2-/-细胞中Ezh2缺失导致超过半数SETD2调节的基因(441/791)恢复表达至Pten+/-类器官的水平(图3J)。总之,这些结果表明Setd2缺失以EZH2依赖的方式加速了前列腺癌的发生发展。

接下来研究者探究了Setd2不足细胞中EZH2聚集如何驱动促癌的机制。研究者将基因表达数据与H3K27me3 ChIP-seq数据整合,以探究EZH2直接调控的靶基因。在Setd2缺失基础上有128个基因下调并且获得H3K27me3,通过Ezh2 KO补救,研究者将其命名为依赖EZH2的SETD2特征。研究者证实在Pten+/-; Setd2-/- Ezh2细胞中缺失确实能够减弱代表性基因的降低。研究者选取了10个基因(Cdkn2a, Dab2ip, Epha7, Sox7, Vash1, Adrb2, Ephb6, Fbxo31, Gas1以及Timp4)进一步进行功能分析。结果发现敲除Cdkn2a, Dab2ip, Epha7, Sox7,以及Vash1能够促进Pten无效类器官的生长。Cdkn2a, Dab2ip以及Vash1有助于EZH2促进肿瘤的发生发展。有报道称在其他肿瘤模型中Sox7和Epha7是肿瘤抑制基因。因此这些结果表明Cdkn2a, Dab2ip, Epha7, Sox7以及Vash1可能有助于PCa中SETD2发挥功能。

图3. Setd2缺失诱导的PCa转移依赖于EZH2活性升高.(A)小提琴图说明3个月大小鼠指定类器官间差异表达的基因,代表基因如图;(B)热图总结了三个月大小鼠产生的类器官qRT-PCR验证的结果;(C)对6个月大小鼠前列腺中指定蛋白进行IHC分析;(D)CHX处理的对照组或者SETD2 KD组中C4-2细胞的IB分析,条形图代表EZH2蛋白的水平,**p < 0.01.(E)热图分析显示在3个月大小鼠产生的类器官中TSS -2 kb~TES +2kb的H3K27me3上13412个基因峰图;(F)在Cdkn2a和Sox7基因位点上H3K27me3的RNA-seq以及ChIP-seq轨迹;(G)热图显示在PCa中SETD2和EZH2之间的IHC值。(H)8个月大小鼠指定前列腺的H&E染色;(I)对组织学等级进行定量(n=8),**p < 0.01;(J)热图总结了3个月大小鼠类器官中差异表达的基因。

4   SETD2介导的K735me1促进了EZH2依赖Smurf2的降解

接下来研究者探究了EZH2是否是SETD2非组蛋白底物。首先研究者发现外源和内源的SETD2能够与EZH2相互作用,而不是EZH1(图4A、4B)。PRC2的主要成分EED以及SUZ12也与SETD2存在相互作用(图4B)。重要的是,SUZ12/EED与SETD2相互作用的比例低于EZH2,表明SETD2与PRC2复合体之间的关联相对较弱。同时也表明SETD2/EZH2相互作用可能通过阻止EZH2进入PRC2复合体或者破坏其与PRC2其他成分之间的相互作用。研究者构建了编码SETD2的氨基酸1–900, 900–1,720, 1,720–2,564以及 1,460–1,720的载体,分别将它们命名为F1、F2、F3和SET,结果发现SETD2-F2和SET与EZH2相互作用。重组的GST-SETD2-F2与EZH2直接相互作用。由于全长SETD2的异源表达极其困难,研究者在接下来的实验中利用SETD2-F2,因为该截断体能够直接与EZH2相互作用,并且保留了甲基转移酶的活性。利用泛甲基化的抗体,在SETD2-F2过表达的裂解液中检测到了EZH2的甲基化。相反在酶失活的SETD2-F2突变体不能使EZH2甲基化。研究者进行质谱分析发现一个保守的赖氨酸残基K735通过SETD2-F2过表达一甲基化。基础甲基化K421和K698也检测到,但是SETD2-F2不能诱导产生。因此,研究者致力于探究K735me1对EZH2表达和功能的影响。为了检测K735甲基化的特异性,研究者构建并证实了K735me1的抗体。体外甲基化实验证实SETD2直接甲基化EZH2 K735残基,相反,将K735残基替换为R(K735R)消除了甲基化(图4C)。随后IHC分析说明3个月大Pten+/-; Setd2-/-小鼠前列腺管腔细胞并未检测到K735me1信号,但是EZH2的水平升高(图4D)。利用MG132处理稳定EZH2发现K735me1的升高,而Setd2缺失降低K735me1(图4E)。因此这些结果表明SETD2能够直接甲基化EZH2。

为了探究负载K735me1 EZH2的比例,研究者利用MG132处理细胞以及anti-K735me1抗体进行了IP实验。该抗体能够特异性的使上清中的K735me1缺失,并且大约50%的EZH2残留。利用MS分析,研究者发现MG132处理使C4-2细胞中含有EZH2-K735me1的肽段数量显著增加(图4F)。这一半定量的实验表明大量EZH2被甲基化并且降解。由于EZH2是PRC2复合体的一部分,并且能够催化H3K27me3,研究者对PCa细胞进行了凝胶过滤色谱分析,结果发现K735me1大量存在于PRC2复合体中。同时研究者也在MG132处理的C4-2细胞中进行了anti-EED IP,结果都检测到了SETD2和K735me1,且K735me1的比率与input具有可比性。重要的是有报道称EZH2独立于PRC2,存在于晚期PCa中。研究者进一步探究了EZH2-K735me1的生化结果。在SETD2-F2存在时,K735R突变体蛋白半衰期升高,同时多聚泛素化显著降低。为了证实这一结果,研究者在C4-2细胞中利用CRISPR/Cas9将内源K735替换为R(C4-2K735R细胞)。与C4-2K735R细胞中EZH2蛋白升高一致,内源EZH2-K735R蛋白K735me1和多聚泛素化显著降低(图4G)。此外,EZH2突变体蛋白的降解对SETD2-F2并不敏感(图4H)。由于EZH2上调,促进了C4-2K735R细胞的肿瘤进展以及对SETD2- F2耐药(图4I)。近期的研究表明EZH2自身甲基化发生在其他位点(K510, K514, 以及K515)。研究者发现SETD2缺失并不改变EZH2在这些位点的甲基化,同时EZH2催化突变体(EZH2-H689A)也并未改变K735me1。因此,K735,K510, K514, 以及K515甲基化可能不依赖于该机制的调节。

接下来研究者旨在确定K735me1通过什么机制导致EZH2破坏。Smurf2, b-TrCP,以及TRAF6是已知的能够靶向EZH2降解E3。研究者发现Smurf2是最可能的E3连接酶调节EZH2的稳定。同样,Smurf2加速WT EZH2降解,而不是K735R突变体蛋白(图4J)。机制上而言,研究者进行了IP实验并且检测到C4-2K735R细胞中EZH2与Smurf2之间的关联减弱(图4K)。这些结果表明SETD2诱导的K735me1促进了Smurf2 E3连接酶识别EZH2并且对其进行降解。

图4. SETD2介导的K735me1促进了EZH2依赖Smurf2的降解。对转染指定质粒的293T细胞的全细胞裂解液(WCLs) 和IP进行IB分析;(A)对C4-2和LNCaP细胞的WCLs和IP进行IB分析;(B)体外甲基化实验对EZH2-K735me1进行IB分析;(C)对3个月大小鼠前列腺K735me1和EZH2进行IHC分析;(D)3个月大小鼠前列腺产生的类器官在20 mM MG132处理8小时后对K735me1进行IB分析;(E)通过MS定量有无20 mMMG132处理8小时的C4-2细胞中甲基化和未甲基化EZH2-K735肽段,**p < 0.01;(F)对WT和C4-2K735R细胞指定蛋白进行IB分析;(H-I) 对WT和C4-2K735R细胞在有无SETD2-F2过表达的情况下对指定蛋白进行IB(图H)和肿瘤体积(图I)分析,**p < 0.01;(J) 对有无Smurf2过表达的WT, SETD2 KD, 以及C4-2K735R细胞WCLs进行IB分析;(K)对有无SETD2-F2过表达指定细胞的WCLs和anti-EZH2 IP进行IB分析。

5   EZH2-K735me1对PCa进展非常重要

为了证实体内K735me1的重要性,研究者构建了纯合K735R敲入突变体(Ezh2K735R)小鼠。IHC分析表明Ezh2K735R小鼠前列腺管腔细胞中K735me1水平减弱,同时EZH2的表达升高(图5A)。Pten+/-背景下Ezh2K735R导致肿瘤进展加快(图5B)。SMAα和AR染色证实30% Pten+/-; Ezh2K735R小鼠发展为转移型腺瘤。这一结果与EZH2表达升高促癌的结论一致,然而疾病没有Pten+/-; Setd2-/-小鼠中严重。因此研究者探究了Pten无效小鼠中Ezh2K735R突变体(Pten-/-; Ezh2K735R)能够导致转移型PCa。通过H&E, SMAa, CK8, 以及Ki67染色发现在16周,Pten-/-; Ezh2K735R小鼠高度转移(图5C)。Pten-/-; Ezh2K735R负荷乳腺癌小鼠中AR-或者CK-8阳性细胞转移至腰淋巴结(7/10)和肺(4/12)(图5D)。这些表型表明EZH2- K735me1缺乏促使PCa细胞演变为转移型PCa

此外研究者从2个月大Pten-/-以及Pten-/-; Ezh2K735R小鼠中分离得到管腔细胞,并且比较了它们体外形成类器官的能力。K735me1缺乏导致类器官形成的能力提高。重要的是,SETD2过表达或者KO对Pten-/-; Ezh2K735R小鼠源性类器官的生长没有影响(图5E、5F)。这一观察与类器官中K735me1, EZH2,以及Ki67+的水平相关。此外,研究者比较了2个月大Pten-/-和Pten-/-; Ezh2K735R小鼠产生类器官的转录图谱,结果发现Pten-/-; Ezh2K735R细胞中,与H3K27me3信号相关的特征显著富集,并且60% EZH2依赖的SETD2特征(74/128)。研究者证实EZH2-K735R突变体中EZH2抑制的靶基因降低。总之,这些结果表明SETD2的肿瘤抑制功能大部分依赖于EZH2的甲基化。

为了进一步探究EZH2- K735me1在PCa中的临床意义,研究者通过基于TMA的IHC比较了SETD2, EZH2,以及K735的甲基化水平。这些组织依据免疫染色分值分为SETD2、EZH2和K735me1高水平和低水平的群组。如图5G,SETD2的高表达与EZH2-K735me1的高表达以及EZH2的低表达高度相关。此外,低水平的K735me1也与临床差的预后密切相关(图5H)。因此,在患者中SETD2、EZH2以及EZH2-K735me1之间紧密关联。

图5. Ezh2甲基化缺陷促进了小鼠PCa转移。(A) 对前列腺中K735me1和EZH2的IHC分析;(B) 对8-10个月大小鼠前列腺进行H&E染色,**p < 0.01;(C) 对4个月大前列腺进行IHC染色,**p < 0.01;(D) 对4个月大小鼠淋巴结和肺中AR和CK8进行IHC染色;(E) 对Setd2 KD或者过表达类器官中指定蛋白进行IB分析;(F) 2个月大小鼠在Setd2 KD或者过表达产生类器官成像;(G) 在TMA中依据SETD2分类低表达或者高表达的K735me1或者EZH2;(H) 基于K735me1的表达参数进行Kaplan-Meier复发分析。

6   病人来源SETD2-R1523H突变体不能结合并且甲基化EZH2

研究者猜想人类肿瘤中SETD2的一系列无义突变可能影响其调节EZH2的能力。参考cBioPortal (58,857个患者,21个肿瘤类型中)数据库研究者在包含788个无义突变的2069个肿瘤中鉴定出SETD2突变。在剩余的无义突变中,SETD2酶失活的突变体R1625G最常见(图6A)。有趣的是,SETD2 R1523H突变体主要发生在12个肿瘤中。在一项相关性研究中发现,R1523H被列为3D热点突变,有趣的是,研究者数据表明SETD2的aa 1,520–1,530是其与EZH2直接作用所必需的。因此研究者推测R1523残基可能参与与EZH2的直接相互作用。

在293T细胞中只有过表达R1523H发现与EZH2相互作用的能力丧失(图6C)。SETD2-F2-R1523H突变体,而不是R1625G,不能与EZH2相互作用(图6D)。当在C4-2细胞中异源表达时,SETD2-F2-R1523H并不能降低EZH2和H3K27me3的水平,导致EZH2的多聚泛素化,尽管仍然保留着完整的H3K36me3甲基转移酶的活性(图6E)。正如所期盼的一样,R1625G代表酶失活的突变体,因此并不能减弱EZH2和H3K27me3水平(图6E)。为了进一步证实SETD2-R1523是识别EZH2的关键氨基酸,SETD2-EZH2对接实验证实R1523残基与R78, G79, 以及T80环区形成氢键(图6F)。为了验证这一模型,研究者同时将EZH2的氨基酸78–80残基突变为丙氨酸(EZH2-78-80M),结果发现其并不能与SETD2-F2结合(图6G),并且对SETD2-F2诱导的降解抵抗。

在肿瘤模型中,SETD2-F2过表达的细胞肿瘤发生能力低于WT细胞。相反,SETD2-F2-R1523H和SETD2-F2-R1625G都不能抑制肿瘤的进展(图6H)。研究者同样利用CRISPR/Cas9技术构建了鼠源Pten不足的类器官细胞,带有SETD2-R1497H突变体。当内源R1497替换为H(Setd2R1497H),类器官的生长显著加快,并且与EZH2蛋白显著升高以及EZH2靶基因的降低相关。重要的是,Setd2R1497H细胞中EZH2缺失减弱了类器官的生长(图6I)。此外研究者同样在Ezh2 KO或者没有KO的Pten-/-以及Pten-/-; Setd2R1497H细胞中异种移植,并且获得了相似的结果(图6J、6K)。总之,研究者的结果证实人类SETD2中复发R1523H突变体临床相关性的机制。

图6. SETD2-R1523H突变体通过EZH2促进肿瘤的发展。(A) 列表显示SETD2中最显著的无义突变,所有SETD2无义突变肿瘤的数量如图所示;(B) 介导SETD2与EZH2相互作用的区域;(C) 转染指定质粒293T细胞IP的IB分析;(D) GST pull-down实验证实指定蛋白间的相互作用;(E) 稳转指定质粒C4-2细胞的IB分析;(F) EZH2与SETD2潜在的结合界面;(G) 转染指定质粒293T细胞IP的IB分析;(H) 测量指定细胞的肿瘤体积,**p < 0.01;(I) 对有无Ezh2 KD小鼠类器官进行IB分析;(J) 对皮下类器官进行成像和定量,**p < 0.01;(K) 皮下类器官的组织学分析。

7   AMPK-FOXO3轴线刺激了SETD2的水平并且二甲双胍处理抑制EZH2

尽管SETD2突变体导致活性丧失,但不能解释前列腺癌中SETD2的普遍下调。为了发现调控SETD2表达的上游信号,研究者在C4-2细胞中进行了化合物筛选。有趣的是,AICAR、A-769662、2-DG处理能够提高AMPK的活性,提高PCa细胞中SETD2 mRNA水平(图7A)。当AMPKa1/a2缺失时SETD2的表达对AICAR处理并不敏感(图7B)。根据AMPK在能量传感中的作用,葡萄糖剥夺模拟饥饿效应能够刺激SETD2的表达和p-AMPKa。当再次喂养葡萄糖,SETD2的表达以AMPK依赖的方式减弱。研究者接下来拓展了检测,并且发现AMPK特征在转移PCa中下调。这些结果表明SETD2的表达受AMPK正调控

为了探究AMPK调控SETD2表达的分子机制,研究者构建了SETD2启动子的不同片段驱动的荧光素酶报告基因。包含+360bp至+310bp的片段上坐落着保守的FOXO结合元件,该部位响应AMPK的刺激效应。之前的报道发现AMPK能够提高p-FOXO3促进它的转录活性。同样FOXO3结合位点突变使SETD2启动子活性降低。此外,FOXO3的确占据在SETD2启动子区域,并且AICAR处理后加强。最终研究者说明AMPK信号聚集在FOXO3上刺激 SETD2的表达(图7C)。接下来研究者评估了局部以及转移PCa中SETD2, EZH2, K735me1, p-AMPK或者p-FOXO3的水平。定量结果表明SETD2, K735me1, p-AMPK, 以及p-FOXO3的水平在转移型PCa中广泛降低(图7D)。总之,AMPK以FOXO3依赖的方式调节SETD2的表达

研究者假设AMPK激动剂二甲双胍能够刺激K735me1,由此影响前列腺癌的发生发展。的确,二甲双胍能够诱导Pten-/-类器官中SETD2的表达,同时降低EZH2和H3K27me3的水平(图7E)。重要的是,Pten-/-; Ezh2K735R中EZH2甲基化的缺失削弱了二甲双胍降低EZH2的能力(图7E)。因此,二甲双胍抑制了Pten-/-克隆形成的能力,但是对Pten-/-; Ezh2K735R或者Pten-/-; Setd2-/-类器官的影响有限。但是二甲双胍处理使H3K27me3的水平以及类器官的大小在Setd2 KO以及Ezh2K735R突变体细胞中减弱(图7E)。研究表明AMPK能够磷酸化EZH2的T311位点,导致PRC2复合体的组装缺陷。同样,2小时二甲双胍处理并不改变SETD2和K735me1的水平,但是EZH2和SUZ12之间的作用减弱。EZH2/SUZ12相互作用在二甲双胍处理24小时后进一步减弱,此时SETD2导致EZH2下调。此外,研究者发现EZH2-K735R; EZH2-T311A双突变中H3K27me3的水平大部分对二甲双胍耐药。总之,这些结果表明AMPK介导的EZH2磷酸化以及SETD2的表达影响了EZH2的活性/水平。这一结果进一步通过类器官原位移植到受体小鼠中证实。二甲双胍处理削弱了Pten不足小鼠肿瘤的生长,但是对PPten-/-; Ezh2K735R或者Pten-/-; Setd2-/-细胞的影响较小(图7F)。为了拓展这一发现,研究者采用发育为CRPC或者转移性肿瘤病人来源的移植体PDXs,并且发现它们对二甲双胍敏感(图7G)。重要的是,二甲双胍处理的PDXs具有较高的SETD2和K735me1水平,而EZH2的水平降低。这些结果表明SETD2-EZH2轴线与代谢能量传感以及肿瘤发生发展相关。

图7. AMPK-FOXO3轴线介导的SETD2表达调节EZH2-K735me1 。(A) 热图显示C4-2细胞经过处理12小时后 SETD2mRNA水平;(B-C) C4-2细胞在有无AMPK KD (B) or FOXO3 KD (C)条件下用1 mM AICAR处理24h进行IB分析;(D) 热图总结在局部和转移肿瘤中指定蛋白之间的关联;(E) 在有无二甲双胍处理7天,2个月大类器官进行IB分析;(F) 对皮下类器官成像和肿瘤体积定量,*p < 0.05, **p < 0.01;(G) 测量二甲双关或者对照每隔2天处理4-6周后的肿瘤体积,*p < 0.05, **p < 0.01。

结论

在本研究中研究者发现SETD2通过其底物EZH2延迟前列腺癌(PCa)转移,SETD2甲基化EZH2,从而促进EZH2降解SETD2缺失会引起Polycomb抑制的染色质状态,进而使细胞能够获得转移性状。相反,携带无法甲基化的EZH2突变体或者与EZH2结合缺陷的SETD2突变体的小鼠会产生转移性PCa。此外,研究人员发现二甲双胍刺激的AMPK信号会影响FOXO3来刺激SETD2表达。总之,这些结果表明SETD2-EZH2信号轴整合了代谢和表观遗传信号,进而限制PCa的转移。


更多推荐

1  科研 |SCI ADV:平行单细胞转录组和染色质可及性测序揭示重编程轨迹的多样性

科研 |NAT COMMUN:单细胞RNA测序鉴定通过双电位中间产物形成的早期感 觉神经元的多样性

END

(0)

相关推荐