lncRNA芯片是什么？lncRNA芯片特点

一、lncRNA芯片

长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA) 指的是长度在200-100000 nt之间的RNA分子，它们不编码蛋白，但参与细胞内多种过程调控。人们对lncRNA的认识还处在初级阶段，lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程，与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切的关系。lncRNA的种类远远超过编码RNA，哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%-5%）。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点。

lncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法（SELEX等）效率低下，假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点，因此用基因芯片来筛选lncRNA是一种准确快捷的方法。

二、lncRNA技术特点：

1）目前市面上探针密度最高的lncRNA芯片产品；

2）芯片采用Agilent eArray平台设计，使用Agilent SurePrint技术合成，技术重复性高于99%；

3）覆盖主流数据库所有lncRNA，可同时检测lncRNA和mRNA，并挖掘两者之间的关联；

4）检出率高：随机引物扩增方式，可同时扩增带Ploy-A和不带Poly-A的lncRNA，确保更多的 lncRNA被检测出来；

5）提供完整lncRNA芯片数据分析解决方案。

三、lncRNA芯片流程：

1、总RNA提取；

2、反转录合成cDNA;

3、体外转录合成cRNA;

4、随机引物合成正义链cDNA

5、DNA片段化，生物素标记；

6、芯片杂交、洗涤、染色、扫描。

四、应用：

筛选差异表达的lncRNA和mRNA、lncRNA功能注释、lncRNA调控机制预测