基于网络药理学与数据挖掘探讨中药调节细胞焦亡用药规律

摘 要 Abstract

  目的 探索中药调节细胞焦亡的物质基础及用药规律。方法 通过整合GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、DisGeNET数据库获取细胞焦亡的作用靶点,以ADME参数和Lipinski规则为筛选条件,利用中药系统药理学技术平台筛选可作用于靶点的化合物及中药,并构建靶点-化合物、化合物-中药、靶点-化合物- 中药网络。匹配中药的性味归经等信息,对用药规律进行分析。借助AutoDock Vina将网络中核心靶点与成分进行分子对接,以评估网络中靶点与化合物的结合强度,并进一步挖掘潜在的化合物靶点组合。结果 共获得 81个细胞焦亡的作用靶点,其中16个靶点可匹配到候选化合物,共收集到90个候选化合物,462味中药。频数统计结果显示,能够干预细胞焦亡的中药药味以苦、辛、甘为主,药性以寒居多,主要归肝、肺二经。分子 对接共获得网内组合53个,Affinity较佳的有CASP3-rutin、CASP3-hesperidin、AKT1-diosgenin等;获得网外新组合109个,Affinity较佳的有AKT1-hesperidin、AKT1-rutin、AKT1-β-sitosterol等。所得核心靶点包括CASP3、 BCL2、AKT1、IL1B、STAT3、EGFR,较为重要的成分有金雀异黄酮,(-)-表没食子儿茶素没食子酸酯、槲皮素、熊果酸等,较为重要的中药有麻黄、葛根、虎杖。结论 本研究通过系统探讨中药干预细胞焦亡的物质基础,总结中药调节细胞焦亡的一般规律,可为中西医结合临床及干预细胞焦亡药物开发提供思路。

  关键词 细胞焦亡;网络药理学;用药规律;新药研发

开放科学(资源服务)标识码(OSID)

作者语音介绍、在线问答、学术圈、开放科学数据与内容

引用格式:但文超,刘金垒,何庆勇,等.基于网络药理学与数据挖掘探讨中药调节细胞焦亡用药规律[J].中国中医药信息杂志,2021,28(9):36-43.

DOI:10.19879/j.cnki.1005-5304.202007395

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