本公众号首个TBtools插件CorrPlot诞生
距离上一次更新已经有9个月的时间,当然这并不是说这个公众号放弃了,实在是工作后事情繁多,没有时间进行更新,随着假期来临,可以闭门开始干自己的一些事情。
在前期的文章中,叙述了不少基于R语言进行的图片绘制,但是对于很多入门选手来说,进行跑代码还是特别的累,尤其对于那些急于出图、发文章的同仁来说,更是雪上加霜。而TBtools的诞生,改变了这种境况,在一定程度上,使生信的门槛变得低了一些,随着Rserver 插件的诞生,使R代码界面化成为可能,随后插件商店(https://www.jianshu.com/p/f23d7981e04c),使更多同仁可以分享自己的插件供大众使用,使更多的研究者在生信分析上不必过多的浪费时间和精力去读代码。
今天弄了工作上的事情后,觉得也应该尝试下插件的制作,基于前几期大家对相关性系数图的兴趣,我试着制作下插件CorrPlot,意外的成功了,本插件基于R包PerformanceAnalytics,在这里也感谢本R包的开发者,在这分享给大家:
插件可在TBtools的插件商店找到,安装后,打开的界面如下图:
在本界面,你只需要在三个地方进行操作:
1:即File的输入,文件的输入格式如下:第一列代表样品的名称,从第二列开始,都是你关注的性状数据,例如GS代表性状1,TA代表性状2,以此类推
2 :输入colnumber的数,如果你文件中有11个性状,这里就输入11;但是有的人说,我只想计算前五个,那你就输入5即可。
3:我们选择Metname,在这里我们提供了相关系数3个算法,你可以随自己的爱好选择,一般情况下,差别不是太大。
然后设置你的输出文件,点击Start,你发现,结果出来了,是不是跟之前的文章出图一模一样啊。
我是科研小白,我只是代码的搬运工,在今后的时间里,我会继续开发更多的插件,供同仁们使用,也希望大家多多贡献自己的插件,让我们去打破生信分析的门槛。插件制作方法https://www.jianshu.com/p/4a6a488bf3d3。