飞鸟科研助手(一起打造科研之家)
前些天我在生信技能树VIP交流群无意中看到我们全国巡讲南宁站的东道主李金辉同学发出来了他写的一个网站,我觉得蛮有意思的,值得群策群力的打造升级它,所以邀请李金辉同学组建交流群,聚集志同道合的朋友打造这个科研之家!
今天给大家推荐一个文献下载工具包:飞鸟科研助手 www.flybird.cc输入flybird.cc同样可以访问,存书签不失联!强调下:flybird.cc
读研之前,在一家NGS生殖应用公司谋生活,常常需要阅读领域最前沿的一些文章,查阅外文期刊的时候,虽然毕业学校的图书馆账号还可以用,但是有些期刊校图书馆还没有购入,下载的时候就转向了付款界面,只能在心里默默吐槽下学校喽,然后就会向所在的学术交流群求助,规则是提供DOI号(可以理解为数字资源唯一的“身份证号码”,可以用DOI来标识文献、视频、报告或书籍等数字资源,只要知道了一篇文献的DOI,就能够查询到该文献的作者、标题、期刊、官方链接等信息)加个小红包,群友如果谁解决掉了这个问题就可以领取这个红包,正向激励氛围很好。
后来了解到scihub这个网站,犹如打开了潘多拉的魔盒一般,每次想要下载英文文献,就熟练的打开scihub这个网站下载(Scihub是Alexandra Elbakyan女士制作的文献共享网站,由于法律原因被米国通缉,所以Alexandra Elbakyan女神现在“潜逃”,尽管scihub的各个域名时不时就会“挂掉”,但是仍然在持续维护着这个网站)。
读研之后,某次在谷歌学术查到某篇文章时,打开scihub显示熟悉的崩溃界面,显然这样崩溃的界面已经不是第一次出现,每次出现需要等一两天甚至更久才会恢复。
Scihub一直有备用域名,但是有些打开速度极慢,甚至永远“爱的魔力转圈圈”,就开始找寻一劳永逸的方法。之前学过discuz建论坛,所以了解一些建站知识。域名绑定(解析)到服务器ip地址,所以我们可以通过输入域名等解析之后根据ip地址访问到放置网站的服务器,这时候网页回传过来,浏览器进行加工,就可以看到我们想要的界面了。如果说域名解析经常挂掉,那我把ip地址搜集起来就可以啦。说干就干,整理了下十来个目前用的比较多的scihub域名,查他们的ip,此时发现,有些镜像站其实是无效的,有的甚至是广告站,文献不但无法下载甚至还导向了论文润色、查重甚至论文代写的网站。
在筛除掉碰瓷的网站之后,将ip提取出来,写了个脚本,每天ping一下各个IP的速度,将速度最快的IP记录下来,然后向scihub网站发送GET请求,在返回的论文界面之后将pdf保存下来。这样就算我们常用的域名挂掉之后,脚本还是可以从多个IP中筛到可以使用的那个并且进行文献的下载。由于省去scihub首页的访问,实测无论是下载速度还是下载过程都非常nice。
起开始主要给同门用,由于课题组的部分同学不做生信分析,对于linux的使用也甚是头疼,子系统?别提了,人家哪有时间瞎点技能树。(不是每个人都会抽时间看生信技能树的100个小时教学视频的)
于是我开始了瞎点技能树,用依稀记得的前端知识,开始网站的编写,现学两天的php,一天将界面主体做了出来。后来又进行了一个月的迭代,陆续增加了文本翻译和影响因子查询等,在这一个月的时间,非常感谢几位朋友的分享,让它能在诞生一个月获得上万次的访问量。
1. flybird.cc主页(文献下载):
网站上方是导航栏区域,主页的左方是每日一句以及对应的图片、英汉双语以及标准美式发音,右方是文献下载以及使用说明。我将这个使用说明整理如下:
i. 出版商的文章页面网址输入到输入框中点击下载
URL例:
ii. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283608004087
iii. 在百度学术、谷歌学术或者出版商网站查找到的doi号复制粘贴至框中,点击下载即可
doi例: 10.1126/science.1102896
iv. 多篇文献同时下载,请点击 批量下载
v. 输入框中输入DOI、PMID、URL(页面网址)三者均可 ,一键下载更快,备用下载更稳定,一键下载不成功可以尝试备用下载。
2.批量下载
可以实现多篇文献的打包下载,只要将多篇文献的出版商文献界面网址、DOI号或PMID输入进去即可完成文献包的下载,点击保存即可。可以DOI、PMID、URL(网址)三者的交叉输入,需要空格或回车隔开。此功能需要注册为本站用户才可以使用,不限次数,实测40篇文献只需要5秒。
3.影响因子
已收录11857本期刊的影响因子,提供期刊的国家、投稿难度、以及近五年的影响因子查询,只需要输入查询的期刊名称或ISSN号即可,由于期刊名称的名称相似性问题,可能存在错误匹配问题,使用ISSN查询更加精准。另外,我将所收录的期刊列表整理在上面,点击期刊列表之后,按Ctrl+F即可查询,避免输入问题造成查询失败
4.文本翻译
目前已经实现的功能是基本的文本翻译,翻译效果还算不错,如果你下载完文献还没有关闭本站,可以随手复制粘贴过来进行翻译。
词汇翻译,必要性不强,先搁置;免费文档翻译,必要性很强但精力不足,搁置(苦笑)
5and6:机器学习教程和在线科研用图生成,由于CET6的紧急性,搁置。
7.软件下载
提供常用科研相关软件的下载和安装教程,也可以上传自己所拥有的教程和安装包。
9.树洞
这是一个科研工作者吐露心声(悄悄抱怨)和科研交流的匿名平台,任何人都可以在非登录的情况下发言。
目前的功能就是这些啦,如果有任何建议,可以在菜单栏的反馈建议中进行提交。
最后,送给各位科研工作者一句放在网站标题头的一句话:苦心膏沐不论赀,富贵人生各有时。
存书签:flybird.cc
微信交流群,完全免费,但是微信交流群二维码满200人后就没办法扫描了,所以,烦请没有需要的朋友不要随意扫描进来,留给有需要的朋友,让沟通更有效哈!
注:如果上面的微信群二维码失效,就需要麻烦我们的拉群小助手啦,小助手肯定会比较忙,所以请务必注明(姓名+学校),耐心等待。(如果不是必须,请不要麻烦小助手哦!)