TCGA上的某种癌症被人发了SCI,该怎么办?
目前做数据挖掘的人越来越多了,感觉TCGA的数据不够用了,自己想写的癌症种类都别人写了,感觉没有什么希望了,其实并不是的。例如有人利用TCGA的mRNA做了差异分析,GO,KEGG分析,PPI分析,生存分析。可能他做的就是正常组织与癌症的差异分析,数据都是整体的,那么你还是有机会的,例如你可以做某分期与某分期的差异分析,这样的研究目的,研究结果完全不一样。或者他没有做模型,你可以做模型,或者没有做ceRNA,你可以做ceRNA,没有做WGCNA的,你可以做WGCNA。再比如说,有些癌症的mRNA被做模型,你可以用miRNA做,如果miRNA也被做了,你可以用lncRNA做,如果他都做了,可能只是做了整体数据的,你可以只关心的某一临床特性的病人,例如三期的,四期的,或者吸烟的,饮酒的,吸烟与没有吸烟的差异,饮酒与不饮酒的差异等等,一个人不可能在一篇文章中能够分析完所有的东西,这是不可能做到的。
此外,你还可以联合其他数据库,或者实验验证等等,虽然很多结果不一定漂亮的,但是只要肯尝试总会有所收获。GEO数据挖掘也一样,可能今天的出现在数据库的数据被他发了,可能明天别人又会上传数据,只要你能够认真等待,下一批数据就会被你抢发。
►GEO数据挖掘的深度不够,有没有提高GEO数据挖掘的深度的方法呢?
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