脑脊液外泌体的小RNA测序分析
miRNA,特别是在人体液中发现的那些,已经被建议作为潜在的生物标志物。在各种体液中,脑脊液(CSF)有希望作为神经疾病的诊断和监测的分析目标。然而,相关的基因组规模研究是有限的,目前没有脑脊液中外泌体miRNAs的研究。
来自东京医科齿科大学的研究人员在健康人CSF的外泌体和非外泌体(上清液)部分以及每个供体的血清中进行了小RNA的下一代基于测序的全基因组研究。他们观察到相对于CSF和血清的上清液,外泌体中的miRNAs得到富集。 他们还观察到CSF和血清之间的外泌体miRNAs谱的实质性差异。在CSF外泌体中发现一半报道的脑miRNAs。特别地,在脑组织中特异性表达的miR-1911-5p在CSF中检测,但在血清中检测不到,在三个另外的供体中通过数字PCR得到证实。这些数据表明大脑是CSF外泌体miRNAs的主要来源。研究人员提供了重要的证据表明CSF中的外泌体miRNAs可能反映脑病理生理学特征。
分析流程图;(B)通过超速离心得到的脑脊液外泌体的电镜图。Scale bar= 100 (C) 外泌体的标志性蛋白鉴定。
参考文献:
Yagi Y, Ohkubo T, Kawaji H, Machida A, Miyata H, Goda S, Roy S, Hayashizaki Y, Suzuki H, Yokota T. (2016) Next-generation sequencing-based small RNA profiling of cerebrospinal fluid exosomes. Neurosci Lett [Epub ahead of print].
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