R差异分析知识点

差异分析包含两类数据：芯片数据+测序数据

芯片数据：limma包分析

测序数据：edgeR包+DESeq2包分析

edgeR包+DESeq2包分析counts数据

counts为数值型，整数

FPKM有负值，有小数

其他分析，可以用TPM,FPKM数据分析

注意：limma不能分析counts数据