产品 | PMseq 血流感染症候群病原微生物基因检测系列
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血流感染
血流感染包括了各种病原微生物（包括细菌、真菌、病毒、寄生虫等）入侵血流所引起的感染。除单纯性血流感染外，血流感染还包括了感染性心内膜炎、导管相关血流感染等复杂性感染。血流感染可为原发性，亦可继发于局灶性的感染。血流感染的典型症状主要为畏寒、寒战、发热及毒血症状，此外尚包括原发感染灶及迁徙性感染灶的临床表现。
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PMseq简介
提取感染标本中全部微生物的核酸在高通量测序平台MGISEQ-2000上进行测序，通过微生物专用数据库比对和智能化算法分析，获得疑似致病微生物的种属信息，无偏性的检测细菌、真菌、病毒、寄生虫等12594种病原体，显著提高病原诊断阳性率，指导临床靶向使用抗生素，实现感染的精准诊断。
根据提取核酸的种类不同，分为DNA检测流程和RNA检测流程。DNA检测流程适用于细菌、真菌、寄生虫、DNA病毒，尤其是胞内寄生的细菌（如结核分枝杆菌）、细胞壁较厚的真菌等的检出。RNA检测流程适用于流感病毒、肠道病毒、登革病毒等RNA病毒的检出。当无法判断感染病原时，建议送检DR检测流程。
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产品名称
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PMseq-DNA 血流感染病原微生物高通量基因检测 |
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PMseq-RNA 血流感染病原微生物高通量基因检测 |
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PMseq-DR 血流感染病原微生物高通量基因检测 |
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PMseq-DNA Pro 高敏血流感染病原微生物高通量基因检测 |
适用疾病：不明原因发热查因（发热待查）
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适用推荐
《中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识》
推荐意见６：对于怀疑血流感染的患者，如有条件，推荐在抽取血培养标本时同步留取２ ｍＬ 血标本，分离血浆后保存于－ １６ ～ ２０ ℃冰箱，血培养３ ｄ 未报阳且经验性抗感染治疗无效时，推荐对留存血标本进行二代测序检测。若未留存标本，可重新采集标本（Ａ，Ⅱ）。
推荐意见７：对于怀疑继发性血流感染的患者，在原发感染灶的病原学检测为阴性或因各种因素无法送检合适标本的情况下，可考虑将血标本的二代测序检测作为二线检测方法（Ｂ，Ⅲ）。
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检测流程
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诊断效能
※ 78例患者中，血培养检出率为12.8%（10/78），mNGS检出率为30.7%（24/78），使整体的检出率提高了2倍以上，血培养联合mNGS使检出率提高到了23.1%；
※ 血培养检出11个病原体，包括细菌和真菌，mNGS检出32个病原体，其中额外检出9个血培养阴性的病原体和15个病毒；
※ 3例血培养阳性但mNGS检出阴性的结果，分析可能是院内污染带入；
※ mNGS阳性但血培养阴性的结果，分析与抗生素的使用有关。
图.单独血培养和血培养联合mNGS检出阳性病例数比较
图.血培养和mNGS检出病原体数量比较
参考文献：Long Y, et al. Diagnosis of Sepsis with Cell-free DNA by Next-Generation Sequencing Technology in ICU Patients.[J] .Arch. Med. Res., 2016, 47: 365-371
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典型案例
入院病史：男性患者，44岁，因“发热、咽痛、咳嗽咳痰4天”入院，肺部呼吸音粗，炎症指标升高，胸部CT见右肺中叶及左肺上叶舌段、双肺下叶纤维化。T-SPOT阴性，呼吸道感染病原六项均阴性，血培养阴性。
PMseq检测结果：血液标本检出贝纳柯克斯体430条序列。追问病史，半年前到新疆旅游但未接触牛羊；平素常到农庄吃饭。临床诊断为急性Q热，给予莫西沙星+多西环素治疗有效。