【Meta分析】主题检索:限定与扩展的概念与意义

系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法。在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题,本公众号特此开设专栏解答,希望能够和大家共同学习交流Meta分析,共同成长,如有不当之处,还请大家批评指正。本期我们分享的是关于主题检索中扩展和限定的区别与使用。

01

什么是主题检索?

我们在课程中讲到制定检索策略时可以参考Cochrane系统评价,但是经常会碰到学员问[Mesh]代表主题检索,但是[Mesh:NoExp]是什么意思?或者[Majr】代表什么?
在回答之前,我们需要复习什么是主题检索?
主题词表主要分为MEDLINE《MeSH主题词表》和EMBASE《EMTREE主题词表》,而PubMed数据库支持MEDLINE《MeSH主题词表》。我们以骨关节炎的主题检索为例,细心的同学会发现在副主题下面存在两个条目:
Restrict to MeSH Major Topic.
Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy.
点击添加到检索框中我们就会发现勾选第一条Mesh变成了Majr,勾选第二条Mesh变成了[Mesh:NoExp],这也就是我们常说的限定检索(限定到主要Mesh词)和扩展检索(检索下位主题词)

02

什么是限定检索和扩展检索

在了解限定检索时,我们首先来看一个界面:
我们点击文献摘要进入后可以看到在下方有Publication types和Mesh terms,分别代表了这篇文章属于什么研究类型以及文章内容所对应的主题词是什么(聪明的同学会立刻理解[pt]代表什么,其实也是一种主题检索)。其实这就是我们利用主题词检索文献的原理,Mesh检索会将检索词与摘要下方的Mesh terms进行匹配并通过Search PubMed输出检索结果,因此仔细研究这个界面会更深入理解主题检索的含义以及主题词与款目词之间的关系。
但是细心的同学会发现在Mesh terms中有两个特殊的符号*和/,其实*代表的是这个主题词是这篇文章的主要主题词,而/代表后面的词是副主题词。因此我们的Majr就非常容易理解,Majr是指只检索该词标为*的文献,例如检索Arthroplasty, Replacement, Shoulde[Majr]就会检索到这篇文献,而检索Prosthesis Failure[Majr]则检索不到这篇文献,因为这篇文献中Prosthesis Failure仅是一个普通主题词,可通过Prosthesis Failure[Mesh]检索到同理可理解副主题词的勾选在实际运用中的原理。
那么什么是扩展检索呢?我们可以看到骨关节炎的下位词包括Osteoarthritis, Hip;Osteoarthritis, Knee;Osteoarthritis, Spine。通过PubMed的款目词和主题词我们可以简单地将骨关节炎的检索策略制定为osteoar*[Title/Abstract] OR Osteoarthritis[Mesh] or Degenerative arthriti*[Title/Abstract](词组的截词检索详见【Meta分析】什么是截词检索?截词检索怎么用?)。
假如选择不扩展,仅检索骨关节炎的主题词,我们可以看到Osteoarthritis, Hip的款目词如下,则Coxarthrosis与Coxarthroses所对应的文献就不会被我们检索到。
因此扩展检索实际上是一种查全的策略,通过下位词的主题检索作为补充,可以补检可能漏掉款目词没有涉及到的文献。
如果骨关节炎制定完整检索策略的话,可以考虑为osteoar*[Title/Abstract] OR Osteoarthritis[Mesh] or Degenerative arthriti*[Title/Abstract] OR Coxarthros*[Title/Arstract],并进行扩展检索。

03

注意事项

扩展检索和限定检索以及副主题词检索其实是数据库平衡查全和查准的策略,在实际检索过程中,由于Meta分析首选要保证查全率,所以一般对Restrict to MeSH Major Topic和Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy不进行勾选。
同时需要注意到最新收录的文献是没有Publication type, MeSH terms, Substance这一栏的,
因为我们知道主题检索是数据库后台标引的,所以存在一定的延时性,这也就非常好的为我们解释了主题检索后的文献,为什么在实际检索中还要进行款目词的检索,第一个原因是主题检索存在滞后性,仅仅使用主题检索无法检索到最新的未标引的文献,第二个原因是主题检索标引时可能存在错误,会有漏网之鱼,需要通过款目词也就是自由词检索将其进行补充。
(0)

相关推荐

  • 文献检索系列(六)——主题检索语言

    本公众号陆续推出医学文献检索相关知识和内容,手把手教您文献检索,持续关注,让一切文献都逃不出您的掌心! 主题检索语言是以词语作为概念标识,按字顺编排的检索语言.它由主题词汇构成,也就是将自然语言中的名 ...

  • 如何使用Cochrane Library进行文献检索?

    除了PubMed这个常用的数据库以外,医学工作者在科研中还会接触到另一个数据库--Cochrane Library.提到Cochrane Library,这里先要给一些刚接触科研的小伙伴隆重介绍一下大 ...

  • 新版Pubmed最全实用教程(超全收藏版)

    PubMed 是一个免费的搜寻引擎,提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要.它的数据库来源为MEDLINE.其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康学科.它同时也提供对于相关 ...

  • 文献太多看不过来?教你用R语言快速挖掘pubmed文献信息数据

    今天给大家分享两个用来挖掘PubMed的R包,有了现成的工具,省去了不少自己写爬虫的功夫,可以实现:快速分析研究方向的发文趋势,通过关键词找到合适自己的投稿期刊,看看自己领域内的大牛人物:这么多好玩的 ...

  • 当你还在为meta分析制定检索式的时候,人家已经利用生信把文章写好了

    很多人都是觉得生信数据挖掘很难,迟迟都不肯学习一下.五年前是利用meta分析发文章,现在依然还是利用meta分析发文章.五年前meta分析的文章可以顺利毕业,顺利拿到论文奖励,顺利拿到普升的机会.可是 ...

  • 【Meta分析】Meta分析有必要进行主题检索吗?

    系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法.在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题,本公 ...

  • 几行R代码帮你从pubmed搞定meta分析文献的检索!下载!整理!

    划重点:利用R语言几行代码,快速从pubmed根据keywords搜索数据(不会爬虫也没关系),查看下载数据,整理数据格式,一步到位. meta分析大家都知道,数据收集和整理是整个过程中非常熬人 的一 ...

  • 【Meta分析】常用研究类型检索策略过滤器

    系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法.在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题,本公 ...

  • 原创干货|同济博士师兄教你meta分析检索文献的注意事项!否则你的文章会很被动

    作者简介 本文作者:优秀会吸引优秀,本文作者咸鱼医生,八年制博士,擅长meta分析和临床研究,已发表多篇meta分析和临床研究相关sci文章.后续将会分享一系列的原创干货,敬请关注. 编辑审校: 白介 ...

  • [原创] 师兄教你meta分析面向的主题有哪些?

    作者简介:优秀会吸引优秀,本文作者咸鱼医生,八年制博士,擅长meta分析和临床研究,已发表多篇meta分析和临床研究相关sci文章.后续将会分享一系列的原创干货,敬请关注. 系统评价(和meta分析) ...

  • 【Meta分析】文献检索时为何要主题词与自由词联合检索?

    系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法.在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题,本公 ...

  • 【Meta分析】New PubMed数据库检索方法全面攻略

    系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法.在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题,本公 ...

  • 【文献检索】Meta分析检索策略过滤器

    系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析,再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法.在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题,本公 ...