我研究的疾病研究过哪些基因呢?

我们在研究一个疾病或者某一个方向的时候,经常需要首先了解一下这个了解一下这个领域都研究了哪些基因。这个方面的的数据库还是挺多的,之前我们介绍过geneshot 可以进行这样的检索。但是由于geneshot需要科学上网。

所以今天我们来介绍另外一个挖掘某一个另外相关基因的数据库:GLAD4U(http://glad4u.zhang-lab.org/index.php)。

数据库使用介绍

由于这个数据库开发的目的比较简单,所以这个数据库的使用起来也就比较简单了,我们只需要提供我们想要检索的检索式同时输入自己的邮箱即可。

例如,我们这里想要搜索和肿瘤有关的坏死基因。因此,我们这里就输入:necrosis AND cancer

在输入完成之后经过短暂的等待,就可以获得基于关键的提取的相关基因了。

在结果呈现的内容里面,主要包括两个方面。

  1. 刚才检索分析结果的基本统计。在这个例子里面我们就看到,经过分析,最终在5798个相关文献当中,提取了2811个文献。同时经过数据库自定义筛选之后,最终得到225个基因

  1. 按照的得分,具体每一个基因的基本信息

以上就是这个数据库的基本使用了,另外在这个数据库当中还提供了对这些基因进行富集分析以及PPI分析的链接。但是,这个数据库是12年建立的。所以总是有一些缺陷的。目前关于富集分析和PPI分析的链接就不能用了。

但是,目前目前进行富集和PPI的工具那么多,所以这个不能用。我们下载了相关基因之后,去另外一个数据库进行分析即可。这个方面,可以参考我们之前的帖子:STRING数据库

好了,今天的数据库介绍,就到这里。下期见

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