Vero细胞基因编辑案例
1.CRISPR/Cas9 系统助力猪流行性腹泻病毒入侵和感染Vero细胞的研究
猪流行腹泻病毒(PEDV)是一种阳性单链病毒,属冠状病毒亚科的单链病毒属。氨肽酶N(APN或CD13)是一种Ⅱ型锌金属蛋白酶,可以介导多种细胞生理过程,包括抗原提呈、细胞分化、细胞运动和冠状病毒进入。由于猪APN(pAPN)是猪肠道致病α冠状病毒(TGEV)的主要受体,Ji, Chun-Miao等人通过基因敲除Vero细胞系中 hAPN 或 pAPN 的内源性表达,发现 hAPN 和 pAPN 都不是 PEDV 的功能受体。为了完全排除可能低于检测限的 Vero 细胞中有潜在的 vAPN 产生,他们使用 CRISPR/Cas9 系统生成 vAPN 敲除细胞,即利用两个 gRNA/Cas9 复合物靶向 vAPN-CDS1,删除翻译起始位点下游 290-449核苷酸之间的 160 bp 片段(图2),并通过 IFA确认了这些敲除细胞 Vero-vAPNKO1和 Vero-vAPNKO2缺乏vAPN 的表达(图 3A)。研究结果显示在 PEDV-GFP 感染后,Vero-vAPNKO1和 Vero-vAPNKO2细胞都表现出与正常 Vero 细胞相似的CPE 和 GFP 的表达,这表明 vAPN 敲除对 PEDV 进入和感染没有影响[5]。
图2 通过 CRISPR/Cas9 在Vero 细胞中敲除vAPN 基因
图3 时间分辨免疫荧光
2.基因敲除Vero细胞可以帮助增强型RV疫苗底物的开发
轮状病毒(RV)是全球范围内引起严重胃肠炎的主要原因,Nichole等人使用siRNAs筛选对RV复制产生负面影响的宿主基因,然后通过CRISPR/Cas9基因编辑敲除选定的基因。与野生型Vero细胞相比,完全测序的基因敲除Vero细胞底物可增加RV复制和RV疫苗抗原表达。结果表明,与其他受试Vero细胞底物相比,EMX2基因缺失的Vero细胞的RV复制和抗原产生更高。基因敲除Vero细胞可以促进增强型RV疫苗底物的开发,并为改进RV疫苗生产提供了帮助。
图4
3.使用CRISPR/Cas9 系统在Vero细胞中敲入HSV病毒 DNA 基因组
细菌人工染色体(BACs)是控制DNA病毒(如疱疹病毒)大基因组的有力工具。因为这些DNA病毒(疱疹病毒)的基因组太大,无法克隆到质粒中。例如疱疹病毒 (HSV),一种常见的 DNA 病毒,基因组长度为 152 kbp,可能会引起唇炎、生殖器疱疹和脑炎。但突变型 HSV 是肿瘤疗法的候选者,可以用于杀死肿瘤细胞。Suenaga等人使用CRISPR/Cas9 系统和Vero细胞作为基质研究突变型HSV,这种方法无需将人工基因插入病毒基因组中,就能实现HSV的基因敲降与基因敲入,还提高了预期突变病毒克隆的分离效率。此外CRISPR/Cas9 系统也可以应用于其他 DNA 病毒,如 Epstein-Barr 病毒、巨细胞病毒、痘苗病毒和杆状病毒,对于研究各种类型的病毒,包括临床分离细胞株具有十分重要的作用[6]。
图5 使用 CRISPR/Cas9 系统将基因特异性突变引入HSV-1 基因组