ggraph V1.0.0 发布了-R语言网络可视化的崛起 / 四六文摘

发布地址：https://ggraph.data-imaginist.com/index.html

在8月22日，ggraph默默发布V1.0.0。

关系数据的图形语法

ggraph是ggplot2的扩展，旨在支持网络，图形和树等表示关系的数据的结构。虽然它建立在ggplot2及其API的基础之上，但它带有自己的一套geom，facets等，并且在语法中添加了许多布局。

示例

library(ggraph) #> Loading required package: ggplot2 library(tidygraph) #> #> Attaching package: 'tidygraph' #> The following object is masked from 'package:stats': #> #> filter


# Create graph of highschool friendships

graph <- as_tbl_graph(highschool) %>%

mutate(Popularity = centrality_degree(mode = 'in'))

# plot using ggraph ggraph(graph, layout = 'kk') + geom_edge_fan(aes(alpha = stat(index)), show.legend = FALSE) + geom_node_point(aes(size = Popularity)) + facet_edges(~year) + theme_graph(foreground = 'steelblue', fg_text_colour = 'white')

ggraph核心概念

布局定义了节点在绘图上的绘制方式，也就是说，它是将关系结构转换为图形中每个节点的x和y坐标。ggraph可以访问igraph中可用的所有布局功能，并且还提供了大量自己的布局功能，例如蜂巢图，树图和圆形图。
节点是关系结构中的连接实体。这些可以使用geom_node _ *（）系列geom绘制。某些节点geom对某些布局更有意义，例如geom_node_tile（）用于树图和冰柱图。例如：geom_node_point（）对而其他图则更适用。
边是关系结构中的节点之间的连接。这些可以使用geom_edge _ *（）系列geom进行可视化，这些geom包含针对不同布局的许多不同边缘类型。有时边缘是由布局确定的（例如使用树图）。### 我们希望的，ggraph拥有igraph全部的布局

library(ggraph) library(igraph) graph <- graph_from_data_frame(highschool)


p <- ggraph(graph, layout = 'kk') +

geom_edge_link(aes(colour = factor(year))) +

geom_node_point() +

ggtitle('An example')

p

定义了网络主题

p + theme_graph()

另外一个网络主题

p + theme_graph(background = 'grey20', text_colour = 'white')

设置默认主题方便全部网络图绘制

set_graph_style()

p

可以使用分面绘制不同处理网络喽

# Assign each node to a random class V(graph)$class <- sample(letters[1:4], gorder(graph), TRUE) # Make year a character E(graph)$year <- as.character(E(graph)$year)


p <- ggraph(graph, layout = 'kk') +

geom_edge_fan(aes(alpha = ..index.., colour = year)) +

geom_node_point(aes(shape = class)) +

scale_edge_alpha(guide = 'none')

p + facet_edges(~year)